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      云計算下的檢驗檢疫實驗室信息管理系統(tǒng)研究

      2014-06-05 03:22:18包先雨
      關(guān)鍵詞:報驗檢疫實驗室

      包先雨, 李 軍, 王 洋

      (1.深圳市檢驗檢疫科學(xué)研究院,廣東 深圳 518010;2.深圳市超寬帶通訊與射頻識別重點實驗室,廣東 深圳 518010)

      檢驗檢疫實驗室信息管理系統(tǒng)(LIMS-for-CIQ)是利用計算機網(wǎng)絡(luò)技術(shù)、數(shù)據(jù)存儲技術(shù)、快速數(shù)據(jù)處理技術(shù)對檢測實驗室進行全方位管理的計算機軟、硬件系統(tǒng),如圖1所示。它主要以實驗室為中心,將實驗室的業(yè)務(wù)流程、環(huán)境、人員、儀器設(shè)備、標物標液、化學(xué)試劑、標準方法、圖書資料、文件記錄、科研管理、項目管理、客戶管理等影響分析數(shù)據(jù)的因素有機結(jié)合起來,使得實驗室可以達到信息化管理、自動化操作和低碳辦公的目的。該系統(tǒng)運行多年來,對提高檢測工作效率、規(guī)范實驗室管理、促進檢驗檢疫電子化等方面起到了積極的推動作用。

      云計算[1-2]是網(wǎng)格計算(grid computing)、分布式計算(distributed computing)、并行計算(parallel computing)、效用計算(utility computing)、網(wǎng)絡(luò)存儲(network storage technologies)、虛擬化(virtualization)、負載均衡(load balance)等傳統(tǒng)計算機和網(wǎng)絡(luò)技術(shù)發(fā)展融合的產(chǎn)物。其核心是將大量用網(wǎng)絡(luò)連接的計算資源進行統(tǒng)一管理和調(diào)度,構(gòu)成一個計算資源池向用戶按需服務(wù)。云計算對傳統(tǒng)計算方式帶來了變革[3]。云計算具有靈活的擴展性,可根據(jù)用戶需求動態(tài)分配資源,提高資源運用效率;應(yīng)用軟件不再需要安裝在本地計算機,減少了硬件成本。云計算的特點給現(xiàn)有 的 LIMS-for-CIQ 系 統(tǒng) 技 術(shù) 改 進 帶 來 了 新機遇[4]。

      圖1 LIMS-for-CIQ系統(tǒng)

      本文引入云計算技術(shù),提供一個具有超算能力和存儲擴展能力、用戶不受地理位置限制、易于維護的LIMS-for-CIQ系統(tǒng)應(yīng)用環(huán)境。首先分析目前LIMS-for-CIQ系統(tǒng)存在的問題,再結(jié)合現(xiàn)有的云計算技術(shù),利用檢驗檢疫系統(tǒng)內(nèi)部局域網(wǎng)建立CIQ云,進而提出一種云計算環(huán)境下的LIMS-for-CIQ系統(tǒng)方案,最后以深圳 LIMS-for-CIQ系統(tǒng)為例,說明了該方案的可行性和有效性。

      1 LIMS-for-CIQ存在的問題

      隨著 LIMS-for-CIQ系統(tǒng)中涉及的數(shù)據(jù)、流程以及操作的快速增長,產(chǎn)生了較大的檢測量和數(shù)據(jù)量,LIMS-for-CIQ系統(tǒng)的復(fù)雜性也大大上升,這使得傳統(tǒng)的LIMS-for-CIQ系統(tǒng)不僅生命周期短,而且其處理速度、存儲資源擴展以及查詢統(tǒng)計效率等應(yīng)用都很難達到未來檢驗檢疫實驗室建設(shè)的要求[5-6]。

      (1)數(shù)據(jù)量增長速度快,查詢統(tǒng)計較慢。LIMS-for-CIQ系統(tǒng)是檢驗檢疫各檢測實驗室的主干系統(tǒng),目前僅深圳年報驗業(yè)務(wù)量即達十幾萬批次,系統(tǒng)數(shù)據(jù)量增長速度很快,這使得數(shù)據(jù)的查詢效率也會受到很大影響。雖然數(shù)據(jù)庫端、應(yīng)用程序端盡可能的優(yōu)化,但由于系統(tǒng)自身架構(gòu)的局限性,頁面查詢速度始終相對較慢,且不穩(wěn)定,特別是在業(yè)務(wù)高峰期,大數(shù)據(jù)量的查詢統(tǒng)計難以及時完成。

      (2)應(yīng)用服務(wù)器資源消耗較多,運行效率低。LIMS-for-CIQ系統(tǒng)的用戶訪問量較大,由于服務(wù)器系統(tǒng)自身資源有限,系統(tǒng)運行一段時間后系統(tǒng)資源的占用率就會很大,服務(wù)器的運行效率將大大降低,從而使得用戶訪問服務(wù)器的速度也會隨之下降。

      (3)存儲擴展能力有限。LIMS-for-CIQ 系統(tǒng)涉及報告、原始記錄單、檢測任務(wù)單、樣品流轉(zhuǎn)單等各類文檔,需要占用數(shù)據(jù)庫服務(wù)器大量空間。目前LIMS-for-CIQ系統(tǒng)的存儲擴展能力有限,無法滿足快速增長的數(shù)據(jù)存儲需求。

      2 系統(tǒng)方案與功能實現(xiàn)

      針對上述問題,本文通過集群應(yīng)用[7]、分布式計算[8]等系統(tǒng)功能,將檢驗檢疫系統(tǒng)內(nèi)網(wǎng)中的幾乎所有網(wǎng)絡(luò)和計算機應(yīng)用軟件集合起來協(xié)同工作,共同對各級檢驗檢疫機構(gòu)和檢測實驗室提供數(shù)據(jù)查詢、存儲和計算服務(wù)。由于我國檢驗檢疫系統(tǒng)內(nèi)部局域網(wǎng)的完整性,完全可以利用其現(xiàn)有的局域網(wǎng)建立檢驗檢疫系統(tǒng)自己的云,即“CIQ云”。CIQ云可以最大限度地整合現(xiàn)有的計算能力和存儲資源,為系統(tǒng)提供超算能力和存儲擴展能力,并且云存儲和計算資源的訪問可以完全由檢驗檢疫系統(tǒng)自己控制,而不是公用的云計算服務(wù)的提供商,完全的物理隔離,保證了數(shù)據(jù)的安全性。因此,通過引入云計算技術(shù),構(gòu)建基于CIQ云的LIMS-for-CIQ系統(tǒng),即“4橫3縱”的技術(shù)方案,如圖2所示。

      圖2 基于CIQ云的LIMS-for-CIQ系統(tǒng)方案

      “4橫”含義如下:

      (1)數(shù)據(jù)存儲層。由各個數(shù)據(jù)存儲中心構(gòu)成,包括各種計算和存儲資源,它構(gòu)成平臺環(huán)境的硬件基礎(chǔ)。

      (2)系統(tǒng)核心層。提供構(gòu)造云存儲和云服務(wù)的基本軟件模塊,包括查詢服務(wù)和數(shù)據(jù)管理功能,其中的數(shù)據(jù)管理為查詢服務(wù)提供支持。

      (3)訪問接口層。提供共性應(yīng)用服務(wù),例如數(shù)據(jù)的讀取與寫,為上層LIMS-for-CIQ應(yīng)用層奠定基礎(chǔ)和提供接口。

      (4)LIMS-for-CIQ應(yīng)用層。面向最終用戶,提供各種具體的LIMS-for-CIQ數(shù)據(jù)處理和存儲服務(wù),供用戶完成LIMS-for-CIQ的各種工作流程;另外,應(yīng)用層還負責將一些管理功能展現(xiàn)給用戶,用于對數(shù)據(jù)處理和存儲服務(wù)的管理以及執(zhí)行的監(jiān)控。

      “3縱”含義如下:

      (1)運行管理與維護。負責環(huán)境中各類數(shù)據(jù)存儲資源的授權(quán)管理、訪問控制、統(tǒng)一認證以及審計等。

      (2)數(shù)據(jù)存儲節(jié)點的質(zhì)量管理與控制。完成數(shù)據(jù)備份、垃圾收集、服務(wù)質(zhì)量控制等。

      (3)用戶管理和訪問控制。用戶數(shù)據(jù)的訪問控制、計算環(huán)境中數(shù)據(jù)掛載的控制等。

      該系統(tǒng)集報驗管理、樣品管理、結(jié)果登記、報告管理、信息查詢等功能于一體,主要包括如下4大功能模塊,如圖3所示。

      圖3 系統(tǒng)功能實現(xiàn)

      報驗管理模塊包括分支機構(gòu)用戶報驗、委托客戶網(wǎng)上自助報驗、現(xiàn)場報驗、報驗受理、合同評審、狀態(tài)查詢等功能。分支機構(gòu)用戶可以從LIMS-for-CIQ系統(tǒng)中導(dǎo)入報檢單信息進行報驗,委托客戶可在網(wǎng)上自助報驗,檢測中心還提供現(xiàn)場報驗功能。收到報驗申請后,檢測中心對樣品和報驗信息進行審核、合同評審后,系統(tǒng)自動給客戶反饋受理回執(zhí)。為了方便客戶及時了解檢測狀態(tài),系統(tǒng)提供了檢測狀態(tài)查詢功能,客戶憑受理回執(zhí)即可實時查詢。

      流程管理模塊包括任務(wù)分配、樣品分樣、結(jié)果登記、擬稿、報告審核及簽發(fā)等功能。檢測中心受理報驗申請后,系統(tǒng)會自動根據(jù)其對應(yīng)的檢測項目進行任務(wù)分配,檢測人員接收任務(wù)后進行樣品檢測、結(jié)果登記、擬稿、報告簽發(fā)等工作。為優(yōu)化檢測中心內(nèi)部管理,系統(tǒng)設(shè)置了流程監(jiān)控、樣品管理等功能。樣品在中心受理時即按照檢測要求分樣,貼上樣品標簽,通過樣品標簽在各個部門之間流轉(zhuǎn)。系統(tǒng)通過條碼標簽實現(xiàn)樣品管理電子化,在任何環(huán)節(jié),只要簡單掃描標簽,就能完成樣品信息查詢、流程監(jiān)控、樣品交接等功能,解決了原來樣品管理復(fù)雜,紙質(zhì)交接單多,容易出錯的問題。

      系統(tǒng)采用了開源OpenOffice技術(shù)實現(xiàn)證書制作功能,能夠自動提取檢測結(jié)果生成報告,還可根據(jù)實際要求進行手工調(diào)整,并能夠進行幾種文件格式的互相轉(zhuǎn)換。系統(tǒng)實現(xiàn)了檢測結(jié)果數(shù)據(jù)與報告的有機關(guān)聯(lián),解決了原來擬稿存在的需要重復(fù)編輯、合并證書等問題。由于采用系統(tǒng)自動生成報告為主的擬稿方式,并且引入批操作功能,大大減少了擬稿的工作量。

      資源管理模塊包括檢測中心文件控制、易耗品、科研、人員等信息的電子化管理。通過對在檢測中心運作過程中有關(guān)標準及方法管理、檢測程序控制、檢測人員監(jiān)督管理等與檢測中心能力保證直接相關(guān)的各要素的控制和管理,實現(xiàn)對檢測中心的人員要求、儀器設(shè)備、耗材、方法、環(huán)境控制等各項檢測資源的一體化管理,規(guī)范檢測中心能力保證行為,增強檢測數(shù)據(jù)的可靠性,促進檢測質(zhì)量的提高。

      統(tǒng)計分析模塊包括統(tǒng)計報表、組合查詢、自定義查詢等功能。分支機構(gòu)用戶可及時查詢檢測結(jié)果并打印報告,檢驗檢疫相關(guān)業(yè)務(wù)處室可實時掌握檢測業(yè)務(wù)情況,加強對不合格項目和檢測報告的管理,實現(xiàn)了檢測信息高度共享,業(yè)務(wù)處室、分支機構(gòu)、檢測中心三位一體。此外,系統(tǒng)還預(yù)留了接口與其他業(yè)務(wù)動態(tài)數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)實現(xiàn)數(shù)據(jù)共享,更加方便了報檢業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)與檢測業(yè)務(wù)數(shù)據(jù)的比對分析。

      3 應(yīng)用舉例

      深圳檢驗檢疫實驗室基于云計算的LIMS-for-CIQ系統(tǒng)于2009年11月在動植物檢驗檢疫技術(shù)研究所實驗室率先上線運行,其軟件界面設(shè)計如圖4所示。隨后,該系統(tǒng)又在工業(yè)品檢測技術(shù)中心、食品檢驗檢疫技術(shù)中心、動植物檢驗檢疫技術(shù)中心、玩具檢測技術(shù)中心、深圳國際旅行衛(wèi)生保健中心等檢測實驗室上線運行。截至2011年6月底,共計受理各類報驗65 000余批次,平均月受理約11 000余批次,檢測樣份250 000份,總檢測項目數(shù)2 303 000項。目前,該系統(tǒng)整體運轉(zhuǎn)正常,達到了預(yù)期目標,取得了良好的效果。

      圖4 LIMS-for-CIQ系統(tǒng)界面

      (1)提高了工作效率。系統(tǒng)通過穩(wěn)定的基礎(chǔ)架構(gòu)和高效的后臺數(shù)據(jù)處理使得處理速度及處理能力有了較大提高;與CIQ2000系統(tǒng)、攜帶物管理系統(tǒng)、業(yè)務(wù)動態(tài)數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)、電子收費系統(tǒng)等的數(shù)據(jù)銜接減少了重復(fù)錄入工作;條碼技術(shù)方便了樣品管理和數(shù)據(jù)錄入;OpenOffice方案實現(xiàn)了檢測報告自動生成;多處設(shè)置批處理功能,如批報驗、結(jié)果參考、結(jié)果批審核、批擬稿、批簽發(fā)等,極大減少了重復(fù)性操作,節(jié)省了工作人員的系統(tǒng)操作時間。系統(tǒng)建立的高效處理的信息化平臺,使得工作效率有了較大提高。比如報告擬制工作,原來需要3人專門負責,現(xiàn)在只需1人即可完成。

      (2)優(yōu)化了實驗室內(nèi)部管理。系統(tǒng)提供流程監(jiān)控功能,可滿足實驗室內(nèi)部、檢測中心前臺及客戶了解樣品檢測狀態(tài)的不同需要,有助于更加嚴格控制檢測周期,以加強對樣品檢測周期的保證;通過樣品的條碼標簽使得樣品的流轉(zhuǎn)管理更加規(guī)范,并有效地減少了紙質(zhì)單證流轉(zhuǎn);系統(tǒng)流程進行到下一環(huán)節(jié)時即可鎖定上一環(huán)節(jié)工作,并且最后生成PDF格式的檢測報告,避免了工作人員人為修改檢驗結(jié)果,有助于確保檢測數(shù)據(jù)的嚴密性和完整性。系統(tǒng)實現(xiàn)了對實驗室工作的各個環(huán)節(jié)進行全面跟蹤和管理,使實驗室內(nèi)部檢測管理更加科學(xué)和規(guī)范。

      (3)采用了多種技術(shù)提高系統(tǒng)的易用性。該系統(tǒng)開發(fā)基于B/S架構(gòu),相對于C/S架構(gòu)大大降低了系統(tǒng)維護與升級的成本,同時也方便了用戶的操作培訓(xùn)工作。系統(tǒng)中使用條碼打印機、條碼掃描器、攝像頭等外圍設(shè)備,并用到業(yè)界流行的ActiveX控件技術(shù),較好地實現(xiàn)了在瀏覽器上控制客戶端硬件設(shè)備,使系統(tǒng)功能更豐富、使用更便捷。

      4 結(jié)束語

      本文針對現(xiàn)有LIMS-for-CIQ系統(tǒng)的不足,通過引入云計算技術(shù),建立CIQ云并設(shè)計了一種云計算環(huán)境下的LIMS-for-CIQ系統(tǒng),詳細描述了系統(tǒng)結(jié)構(gòu)和功能設(shè)計。該系統(tǒng)整體設(shè)計科學(xué)、功能合理、操作便捷、響應(yīng)速度快。系統(tǒng)啟用后,實現(xiàn)了檢測業(yè)務(wù)各個環(huán)節(jié)的全面跟蹤,優(yōu)化了檢測中心內(nèi)部管理,檢測工作更加科學(xué)化,樣品管理更加規(guī)范化,為檢驗檢疫實驗室的高速運轉(zhuǎn)提供了強大的超算能力和存儲擴展能力。該系統(tǒng)在深圳檢驗檢疫實驗室中的成功實施,將有助于該系統(tǒng)在全國直屬檢驗檢疫機構(gòu)檢測實驗室中的推廣應(yīng)用,具有廣闊的應(yīng)用前景。

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      [2]Michael A,Armando F,Rean G.A view of cloud computing[J].Communications of the ACM,2010,53(4):50-58.

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