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    山桐子葉際微生物群落多樣性、結(jié)構(gòu)及功能預(yù)測(cè)分析

    2023-01-12 09:14:52周慧娜徐自恒薛曉焱王艷梅蔡齊飛耿曉東李明婉
    經(jīng)濟(jì)林研究 2022年4期
    關(guān)鍵詞:山桐子孢屬鏈格

    周慧娜,張 濤,徐自恒,薛曉焱,馮 建,劉 震,王艷梅,蔡齊飛,耿曉東,代 莉 ,李明婉 ,李 志

    (1. 河南農(nóng)業(yè)大學(xué) a. 林學(xué)院;b. 中原地區(qū)森林資源培育國(guó)家林業(yè)局重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,河南 鄭州 450002;2. 棕櫚生態(tài)城鎮(zhèn)發(fā)展股份有限公司,河南 鄭州 450000)

    微生物是生態(tài)環(huán)境的重要組成部分,對(duì)生態(tài)環(huán)境的穩(wěn)定發(fā)揮著重要作用,它們的生存繁衍影響著植株的健康生長(zhǎng)。與土壤、根際相比,葉際微生物種類(lèi)較少[1],但仍發(fā)揮著關(guān)鍵的作用。葉際微生物(Phyllospheric microorganism)一般是指生活在植物地上部分,主要棲息于葉片的微生物群落[2]。對(duì)葉際微生物而言,葉際環(huán)境是一個(gè)非??量糖也环€(wěn)定的生境,生活在葉表的微生物經(jīng)常要面臨水分和營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的不足,以及劇烈變化的強(qiáng)光、高溫和高紫外線(xiàn)等的影響[1],受當(dāng)?shù)丨h(huán)境影響明顯[3-4],即便如此,植物葉片仍存在大量不同性質(zhì)的微生物,比如真菌、細(xì)菌和病毒等[5]。葉際微生物與植物體共同生長(zhǎng)、相互依存、相互影響、相互制約,彼此形成一個(gè)緊密的整體,它們是微生物生態(tài)系統(tǒng)的主要成員,其代謝活動(dòng)與代謝產(chǎn)物可以促進(jìn)宿主適應(yīng)環(huán)境,維持生態(tài)系統(tǒng)平衡[6]。其中,有可以固氮、促進(jìn)宿主生長(zhǎng)、抑制病原菌、降解農(nóng)殘農(nóng)藥等正面功能的有益菌,如蘇云金芽孢桿菌Bacillus thuringiensis是一種常見(jiàn)的葉際細(xì)菌,作為生物殺蟲(chóng)劑,它在保護(hù)作物和防治病蟲(chóng)害方面起到了很大作用。由于長(zhǎng)期使用同一類(lèi)型的殺蟲(chóng)劑,昆蟲(chóng)易產(chǎn)生抗性[7],而蘇云金芽孢桿菌轉(zhuǎn)基因作物的廣泛應(yīng)用,極大地減少了農(nóng)藥的使用,降低了環(huán)境污染,有助于生態(tài)系統(tǒng)的穩(wěn)定性[8]。另一方面,也存在著引發(fā)病害、抑制植物生長(zhǎng)等負(fù)面效應(yīng)的病原菌[9],如青枯假單胞菌Ralstonia solanacearum,俗稱(chēng)青枯菌,是危害嚴(yán)重的世界性植物病原細(xì)菌[10],廣泛分布于熱帶、亞熱帶、溫帶地區(qū)[11],青枯菌可引起煙草、花生和番茄等萎蔫病,可侵染40多個(gè)科200多種植物,寄主范圍極廣[12]。目前,對(duì)于植物微生物的研究更多集中于土壤微生物、根際微生物以及微生物肥料等的研究[13-16],相比之下,有關(guān)葉際微生物的研究相對(duì)較少。

    山桐子Idesia polycarpaMaxim.,又名水冬瓜,為大風(fēng)子科Flacourtiaceae山桐子屬I(mǎi)desia落葉喬木,分布廣泛,樹(shù)干通直美觀(guān),極具觀(guān)賞價(jià)值[17]。山桐子果和種子均可榨油,干果含油率達(dá)35%左右[18],木材質(zhì)地松軟,適宜做工藝品家具等[19]。油脂中亞油酸含量很高,山桐子果實(shí)中提取的油脂可以加工出優(yōu)良的食油、柴油以及潤(rùn)滑油等,其油脂還可以通過(guò)加工用于制藥,具有降低血脂、血壓等功效[20]。由此可見(jiàn),山桐子是一種有著觀(guān)賞性、果材兩用的多功能速生經(jīng)濟(jì)型樹(shù)種[21]。目前,對(duì)于山桐子的研究,多集中于山桐子油、種子、果實(shí)以及栽培扦插等方面,對(duì)于山桐子微生物方面的研究尚不多見(jiàn)。微生物在自然環(huán)境中的相互作用非常復(fù)雜,它們的數(shù)量和多樣性以及組成的異質(zhì)性使其更加復(fù)雜化[22]。本研究通過(guò)分析健康與感病山桐子葉際微生物之間的群落多樣性特征,探明微生物群落的主要差異,并對(duì)不同菌群進(jìn)行功能預(yù)測(cè)分析,為山桐子科研及生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)提供理論參考。

    1 材料與方法

    1.1 試驗(yàn)區(qū)概況

    試驗(yàn)地選在河南省鄭州市金水區(qū)河南農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)試驗(yàn)站,地理位置 113°38′E,34°47′N(xiāo);海拔為108 m,該地區(qū)最高氣溫為43℃,最低氣溫為-17.9℃,年平均氣溫為14.2℃,年降水量為650.1 mm,無(wú)霜期為215 d,全年光照時(shí)間約為2 400 h,屬于典型的半干旱半濕潤(rùn)大陸性季風(fēng)氣候。土壤為潮土,pH值為中性[23-24]。

    1.2 樣品采集

    選擇生長(zhǎng)在鄭州地區(qū)的山桐子為試驗(yàn)材料,株行距為4 m×4 m,山桐子采用常規(guī)栽培方法。分別采集健康與感病山桐子葉片,山桐子選擇樹(shù)體大小一致,且每株選擇相同部位的葉片。將山桐子葉片清洗干凈,用75%的酒精消毒4~5 min,用蒸餾水清洗3~4次;將處理過(guò)的葉片放在研缽中加入液氮進(jìn)行搗碎處理,之后放入離心管中,應(yīng)用CTAB方法提取DNA[25]。

    1.3 高通量測(cè)序

    使用上海派森諾生物科技有限公司Illumina平臺(tái)對(duì)樣品的16S rRNA和ITS基因測(cè)序。對(duì)細(xì)菌的16S V3V4區(qū)(測(cè)序策略:Novaseq-PE250)和真菌的ITS V1區(qū)(測(cè)序策略:測(cè)序策略:Miseq-PE250)進(jìn)行測(cè)序。細(xì)菌的上游引物名稱(chēng):338F上游引物序列:ACTCCTACGGGAGGCAGCA;下游引物名稱(chēng):806R下游引物序列:GGA CTACHVGGGTWTCTAAT[26]。真菌的上游引物名稱(chēng):ITS5F上游引物序列:GGAAGTAAAAG TCGTAACAAGG;下游引物名稱(chēng):ITS1R下游引物序列:GCTGCGTTCTTCATCGATGC[27]。再將擴(kuò)增產(chǎn)物用1.8%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)PCR產(chǎn)物純化效果,測(cè)定純化后PCR產(chǎn)物的濃度,將純化產(chǎn)物等摩爾數(shù)混合,以備上機(jī)前純化和測(cè)序儀分析。

    1.4 數(shù)據(jù)處理

    運(yùn)用QIIME軟件(Quantitative Insights Into Microbial Ecology,v1.8.0)進(jìn)行序列過(guò)濾,以保證分析結(jié)果準(zhǔn)確性。去除葉綠體來(lái)源和線(xiàn)粒體來(lái)源的序列。運(yùn)用Mothur軟件去除嵌合體序列,得到后續(xù)分析的優(yōu)質(zhì)序列。使用QIIME軟件,對(duì)獲得的序列按97%的序列相似度進(jìn)行歸并和OTU劃分,獲得每個(gè)OTU所對(duì)應(yīng)的分類(lèi)學(xué)信息,并使用QIIME軟件計(jì)算多樣性指數(shù)[28]。運(yùn)用SPSS 26.0軟件對(duì)健康山桐子與感病山桐子葉際微生物多樣性指數(shù)進(jìn)行顯著性分析。采用PICRUSt2方法分析預(yù)測(cè)山桐子葉際菌群的代謝功能。

    2 結(jié)果與分析

    2.1 健康山桐子與感病山桐子葉際微生物的豐富度及多樣性

    健康(Y)與感?。˙Y)山桐子葉際細(xì)菌獲得有效序列分別為211 375、202 030,真菌分別獲得有效序列314 050、273 779(表1)。采用97%的序列相似度作為OTUs(Operational Taxonomic Unit,OTUs))的劃分閾值。如圖1所示,健康山桐子與感病山桐子細(xì)菌OTUs數(shù)量分別為212和198個(gè),兩者共有的OTUs數(shù)目為29個(gè),特有OTUs數(shù)量分別為183和169個(gè)。健康山桐子與感病山桐子真菌OTUs數(shù)量分別為101和79個(gè),兩者共有的OTUs數(shù)目為31個(gè),特有OTUs數(shù)量分別為70和48個(gè)。

    表1 樣品序列信息Table 1 Sample sequence information

    分析正常山桐子葉片與感病山桐子葉片的Chao1、Observed_species、Pielou_e、Shannon 和Simpson多樣性指數(shù)(表2),發(fā)現(xiàn)山桐子健康葉片細(xì)菌及真菌的豐富度和多樣性均高于感病葉片,說(shuō)明山桐子感病在一定程度上降低了其豐度和多樣性,且Chao1指數(shù)的顯著差異表明健康山桐子葉際細(xì)菌豐富度顯著高于病葉(P<0.05)。

    2.2 健康山桐子與感病山桐子葉際細(xì)菌群落組成

    測(cè)序結(jié)果表明,山桐子葉際細(xì)菌隸屬于16個(gè)門(mén)、43個(gè)綱、90個(gè)目、143個(gè)科、199個(gè)屬。如圖2A,在門(mén)水平上,山桐子葉際細(xì)菌主要為變形菌門(mén)Proteobacteria。隸屬于該門(mén)的細(xì)菌豐度分別占健康和感病植株的77.66%和70.29%。變形菌門(mén)Proteobacteria、藍(lán)細(xì)菌門(mén)Cyanobacteria、酸桿菌門(mén)Acidobacteria相對(duì)豐度相比健康植株,感病植株中相對(duì)豐度均有所下降;相比健康植株,厚壁菌門(mén)Firmicutes、放線(xiàn)菌門(mén)Actinobacteria、擬桿菌門(mén)Bacteroidetes、綠彎菌門(mén)Chloroflexi相對(duì)豐度在感病植株中均有所增加。

    圖1 山桐子葉際細(xì)菌、真菌韋恩圖Fig. 1 Venn diagram of bacteria and fungi in leaf area of I. polycarpa

    表2 樣品微生物多樣性指數(shù)Table 2 Microbial diversity index of samples

    在葉際細(xì)菌屬水平上(圖2B),不動(dòng)桿菌屬Acinetobacter和別生根瘤菌-新生根瘤菌-寄生根瘤菌-根瘤菌屬Allorhizobium-Neorhizobium-Pararhizobium-Rhizobium的相對(duì)豐度較高,不動(dòng)桿菌屬在健康和感病植株中相對(duì)豐度分別為32.67%和24.90%,別生根瘤菌-新生根瘤菌-寄生根瘤菌-根瘤菌屬在兩者中相對(duì)豐度分別為11.64%和8.47%,這兩個(gè)屬以及伯克霍爾德氏菌屬Burkholderia-Caballeronia-Paraburkholderia、短波單胞菌屬Brevundimonas在感病植株的相對(duì)豐度相對(duì)于健康植株均有所下降,Escherichia-Shigella屬感病植株的相對(duì)豐度相較于健康植株上升較多(1.14%、5.46%)。

    檢測(cè)出健康山桐子葉際細(xì)菌特有菌屬92類(lèi),除去未分類(lèi)及未培養(yǎng)菌屬,特有菌屬相對(duì)豐度排名前三的是:Candidatus_Competibacter、水桿菌屬Aquabacterium以及海洋芽胞桿菌屬Oceanobacillus;感病山桐子葉際特有細(xì)菌菌屬56類(lèi),除去未分類(lèi)及未培養(yǎng)菌屬,相對(duì)豐度排名前三的是動(dòng)球菌屬Kineococcus、脆弱球菌屬Craurococcus及薄層菌屬Hymenobacter。

    2.3 健康山桐子與感病山桐子的葉際真菌組成分析

    測(cè)序結(jié)果表明,山桐子葉際真菌隸屬于8個(gè)門(mén)、18個(gè)綱、37個(gè)目、71個(gè)科、101個(gè)屬。如圖3A,在門(mén)水平上,山桐子葉際真菌優(yōu)勢(shì)菌落為子囊菌門(mén)Ascomycota、擔(dān)子菌門(mén)Basidiomycota,分別占健康和感病植株的85.15%和93.54%。其中子囊菌門(mén)Ascomycota的分別占健康和感病植株77.59%和89.50%,是相對(duì)豐度最高的門(mén)。經(jīng)分析,擔(dān)子菌門(mén)Basidiomycota在正常植株(7.56%)是感病植株(4.04%)的1.9倍,斜紋菌門(mén)Olpidiomycota在正常植株(5.34%)是感病植株(1.83%)的2.9倍,毛霉菌門(mén)Mucoromycota在健康植株(1.50%)是感病植株(0.65%)的2.3倍,三者相比,健康植株,感病植株的相對(duì)豐度都大幅降低。

    在屬水平上(圖3B),健康植株中鏈格孢屬Alternaria、亞隔孢殼屬Didymella相對(duì)豐度均在15%以上,鏈格孢屬Alternaria在感病植株中相對(duì)豐度占一半以上,是感病植株的主要菌屬。相對(duì)豐度前十的菌屬里,亞隔孢殼屬Didymella(15.43%,8.95%)、油壺菌屬Olpidium(5.34%,1.83%)、球腔菌屬M(fèi)ycosphaerella(4.57%,1.05%)健康植株高于感病植株,鏈格孢屬Alternaria在感病葉片里明顯增多,其余菌屬差異不大。

    圖2 健康山桐子與感病山桐子主要細(xì)菌群在門(mén)(A)、屬(B)水平上相對(duì)豐度Fig. 2 Relative abundance of the main bacterial groups at phylum (A) and genus (B) levels of healthy and susceptible I. polycarpa

    圖3 健康山桐子與感病山桐子主要真菌群在門(mén)(A)、屬(B)水平上相對(duì)豐度Fig. 3 The relative abundance of the main fungi in healthy and susceptible I. polycarpa at phylum (A) and genus (B) levels

    2.3.1 鏈格孢屬Alternaria

    鏈格孢屬Alternaria是一類(lèi)世界范圍廣泛分布的真菌,存在于自然界的不同基質(zhì)上,可作為腐生菌、寄生菌和內(nèi)生菌。作為腐生菌,鏈格孢以極強(qiáng)的適應(yīng)能力存活于水、土壤、空氣和紙等不同基質(zhì)上,部分可在已發(fā)病的寄主組織上再次定植,占領(lǐng)其他病原物造成的病斑位點(diǎn)、受損部位或其他衰弱組織等,加重其他病害的發(fā)生。鏈格孢屬病葉相比健康葉片增加了215%,推測(cè)該屬為葉片致病的主要菌屬。

    2.3.2 亞隔孢殼屬Didymella

    亞隔孢屬真菌是一類(lèi)重要的植物病害病原菌。徐兵劃等[29]研究報(bào)道亞隔孢殼屬真菌Didymella.bryoniae(Auersw.)可引起蔓枯病,危害甜瓜、黃瓜、哈密瓜、西瓜、西葫蘆等至少12個(gè)屬,23種葫蘆科作物。亞隔孢殼屬Didymella是唯一與莖點(diǎn)霉屬和殼二孢屬真菌正確關(guān)聯(lián)的有性型屬[30],莖點(diǎn)霉屬由Fries(1821)建立,該屬真菌是一類(lèi)重要的植物病原菌,分布廣泛且具有豐富的多樣性,主要引起植物葉片及莖桿上的病斑,可導(dǎo)致作物產(chǎn)量嚴(yán)重?fù)p失,其中一些物種還被列為檢疫性真菌[31]。山桐子病葉中亞隔孢殼屬數(shù)量相較于健康葉片降低了42%。

    2.3.3 油壺菌屬Olpidium

    油壺菌屬Olpidium是壺菌目Chytridiales中的一種生物內(nèi)生的、整體產(chǎn)果式真菌。其中Olpidium uicia可引起蠶豆癭病,是蠶豆主要和最具破壞性的疾病[32]。該屬相對(duì)于健康葉片,病葉中相對(duì)豐度下降了66%。

    2.3.4 健康山桐子和感病山桐子葉際真菌特有屬

    檢測(cè)出健康山桐子葉際真菌特有菌屬34類(lèi),除去未分類(lèi)及未培養(yǎng)菌屬,特有菌屬相對(duì)豐度排名前三的是:赤霉菌屬Gibberella、毛殼菌屬Chaetomium及擬棘殼孢屬Pyrenochaetopsis;感病山桐子葉際特有菌屬29類(lèi),除去未分類(lèi)及未培養(yǎng)菌屬,特有菌屬相對(duì)豐度排名前三的是:熱子囊菌屬Thermoascus、黃絲曲霉屬Talaromyces及裸腳菇屬Gymnopus。

    2.4 山桐子葉際微生物群落功能預(yù)測(cè)分析

    2.4.1 細(xì)菌群落

    基于KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)細(xì)菌群落進(jìn)行分析(圖4),結(jié)果表明在第一層級(jí)水平,有生物進(jìn)程(Cellular Processes)、環(huán)境信息處理(Environmental Information Processing)、遺傳信息處理(Genetic Information Processing)、 人 類(lèi) 疾 ?。℉uman Diseases)、代謝(Metabolism)和有機(jī)體系統(tǒng)(Organismal Systems)6種代謝通路。其中和代謝有關(guān)的基因相對(duì)豐度最高,為81.34%。

    圖4 PICRUSt2預(yù)測(cè)細(xì)菌群落的功能(level2)Fig. 4 Bacterial communities functions predicted by PICRUSt2 (level2)

    在KEGG第二層級(jí)上研究代謝功能,豐度排名位于前三的代謝功能有輔助因子和維生素的代 謝(Metabolism of cofactors and vitamins)、氨基酸代謝(aminoacid metabolism)和碳水化合物代謝(carbohydrate metabolism),其豐度分別為16.57%、12.02%和11.63%。同時(shí),還存在能量代謝(energy metabolism)、其他氨基酸 代 謝(Metabolism of other amino acids)、 萜類(lèi)化合物和聚酮類(lèi)化合物的代謝(Metabolism of terpenoids and polyketides)、異源生物降解和代謝(xenobiotics biodegradation and metabolism) 、脂代謝(lipid metabolism)、其他次生代謝產(chǎn)物的合成(biosynthesis of other secondary metabolites)、聚糖生物合成與代謝(glycan biosynthesis and metabolism)、 核 苷 酸 代 謝(nucleotide metabolism)、折疊,分類(lèi)和降解(Folding,sorting and degradation)、復(fù)制和修復(fù)(replication and repair)、翻譯(translation)等。

    2.4.2 真菌群落

    基于MetaCyc數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)真菌群落進(jìn)行分析(圖5),在山桐子葉際真菌群落有5個(gè)代謝通路,分別為:生物合成(Biosynthesis)、退化/利用/同化(Degradation/Utilization/Assimilation)、前體代謝物和能量的產(chǎn)生(Generation of Precursor Metabolite and Energy)、 聚 糖 通 路(Glycan Pathways)和代謝集群(Metabolic Clusters)。主要功能類(lèi)群為生物合成(44.74%)、前體代謝物和能量的產(chǎn)生(35.57%)。

    圖5 PICRUSt2預(yù)測(cè)真菌群落的功能(level2)Fig. 5 Fungal communities functions predicted by PICRUSt2 (level2)

    在第二層級(jí)上,主要功能有核苷和核苷酸的生物合成(Nucleoside and Nucleotide Biosynthesis)、輔因子,輔基,電子載體和維生素生物合成(Cofactor, Prosthetic Group, Electron Carrier, and Vitamin Biosynthesis)、氨基酸生物合成(Amino Acid Biosynthesis)、電子轉(zhuǎn)移(Electron Transfer)和呼吸(Respiration)。

    3 討 論

    在本研究中,發(fā)現(xiàn)山桐子健康葉片細(xì)菌及真菌豐富度和多樣性均高于感病葉片,說(shuō)明山桐子感病在一定程度上降低了其豐度和多樣性,與前人研究[33-35]得出健康植株比感病植株擁有更高的豐富度和多樣性的結(jié)論一致。葉際細(xì)菌中變形菌門(mén)Proteobacteria、擬桿菌門(mén)Bacteriodetes等為最具代表性的優(yōu)勢(shì)類(lèi)群,不動(dòng)桿菌屬Acinetobacter、假單胞菌屬Pseudomonas等在不同植物葉際中也被反復(fù)檢測(cè)到;門(mén)水平上的子囊菌門(mén)Ascomycota、擔(dān)子菌門(mén)Basidiomycota是葉際真菌的優(yōu)勢(shì)類(lèi)群,屬水平上枝孢屬Cladosporium、鏈格孢屬Alternaria等較為常見(jiàn)[36]。對(duì)比兩者之間的差異性發(fā)現(xiàn)鏈格孢屬Alternaria真菌在健康山桐子的相對(duì)豐度遠(yuǎn)低于感病山桐子的相對(duì)豐度。鏈格孢屬Alternaria屬于子囊菌門(mén)、座囊菌綱、格孢腔目和孢腔菌科[37],對(duì)應(yīng)健康山桐子與感病山桐子的葉際真菌優(yōu)勢(shì)門(mén)、綱、目、科,因此可能是由于鏈格孢屬Alternaria在健康山桐子與感病山桐子中的顯著性差異導(dǎo)致了山桐子感病。鏈格孢屬Alternaria真菌同時(shí)具有寄生和腐生性,可以適應(yīng)多種不同的環(huán)境條件,故繁殖能力較強(qiáng)[38]。它們分泌的酶可以降解寄主植物的保護(hù)組織,降低植株抵御病原體的能力,幫助病原體入侵、定植植物[39],造成多種植物感病[40]。

    亞隔孢殼屬Didymella、油壺菌屬Olpidium、球腔菌屬M(fèi)ycosphaerella真菌感病植株相較于健康植株相對(duì)豐度都出現(xiàn)不同程度下降,由此推測(cè),鏈格孢屬真菌的增長(zhǎng)抑制了上述菌群的生存和繁殖。在馮麗等[41]的研究中,深海沉積物中分離出的包括鏈格孢屬在內(nèi)的幾個(gè)屬對(duì)多種指示細(xì)菌均產(chǎn)生了不同程度的抑制。因此,感病山桐子葉際細(xì)菌中除葉綠體線(xiàn)粒體以外的幾個(gè)菌落相對(duì)豐度降低可能也與鏈格孢屬菌落的抑制作用有關(guān)。

    通過(guò)PICRUSt2功能預(yù)測(cè),與代謝、生物合成及能量產(chǎn)生有關(guān)的微生物群落活躍度較高。其中,輔助因子和維生素的代謝在細(xì)菌群落中活躍度最高,其在維持細(xì)胞正常生長(zhǎng)和正常代謝,維持機(jī)體正常生命活動(dòng)中不可或缺。真菌群落內(nèi)核苷和核苷酸的生物合成功能群豐度最高,它們是生物體內(nèi)核酸的重要組成部分,參與多種代謝和調(diào)節(jié)活動(dòng)。

    本研究基于高通量測(cè)序?qū)】瞪酵┳优c感病山桐子的葉際細(xì)菌和葉際真菌群落多樣性、組成及功能預(yù)測(cè)進(jìn)行了研究,其中健康山桐子與感病山桐子的葉際細(xì)菌群落多樣性指數(shù)總體來(lái)說(shuō)差異不顯著,但一些豐度較低的菌屬在健康山桐子與感病山桐子之間有明顯差異,如短波單胞菌屬Brevundimonas在健康植株(2.08%)是感病植株(0.74%)的2.8倍,這說(shuō)明了雖然葉際細(xì)菌群落多樣性指數(shù)無(wú)顯著差異,但是兩者之間的群落組成仍存在差異[42]。還有一些相對(duì)豐度不高的微生物菌落,不代表其在植物中沒(méi)有作用或作用微弱,在某些情況下它們是影響植物多種生理功能的主要因素[43],其對(duì)植物的影響還有待進(jìn)一步探究。

    微生物群落相互之間以及與環(huán)境之間息息相關(guān)、互相作用[44-46],本文重點(diǎn)關(guān)注優(yōu)勢(shì)菌落對(duì)山桐子產(chǎn)生的影響,后續(xù)將對(duì)可能產(chǎn)生關(guān)鍵作用的非優(yōu)勢(shì)菌落,以及菌落之間聯(lián)合效應(yīng)對(duì)山桐子的作用進(jìn)行深入分析,以期為山桐子更好地生長(zhǎng)發(fā)育提供參考依據(jù)。

    4 結(jié) 論

    健康山桐子健康植株葉際細(xì)菌及真菌豐富度和多樣性均高于感病植株;檢測(cè)出山桐子葉際細(xì)菌主要菌門(mén)為變形菌門(mén),真菌優(yōu)勢(shì)菌落為子囊菌門(mén)和擔(dān)子菌門(mén),優(yōu)勢(shì)菌屬為鏈格孢屬和亞隔孢殼屬,鏈格孢屬真菌可能是山桐子感病的關(guān)鍵因子;功能預(yù)測(cè)結(jié)果表明,與代謝、生物合成及能量產(chǎn)生有關(guān)的微生物群落是活躍度最高的。

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