韓萌萌,盛安琪,李海峰
(西北農(nóng)林科技大學(xué) 農(nóng)學(xué)院,旱區(qū)作物逆境生物學(xué)國家重點實驗室,陜西 楊凌 712100)
開花植物的生活周期包括2個階段:營養(yǎng)生長階段與生殖發(fā)育階段。在營養(yǎng)生長向生殖生長轉(zhuǎn)換以及生殖生長的過程中,有許多轉(zhuǎn)錄因子的參與,AGAMOUSLIKE6(AGL6) 基因亞家族是MADS-BOX基因的1個亞家族,參與調(diào)控花器官和花分生組織的發(fā)育。
MADS-BOX是一類廣泛存在的轉(zhuǎn)錄因子,其顯著特點是在N端存在由大約60個保守氨基酸組成的MADS-BOX結(jié)構(gòu)域。MADS-BOX基因在生物體生長發(fā)育和適應(yīng)逆境的過程中發(fā)揮著重要作用。MADS-BOX基因的命名來源于4個轉(zhuǎn)錄因子:酵母(Saccharomycescerevisiae)的MCM1(MiniChromosomeMaintenance1)[1]、擬南芥(Arabidopsisthaliana)的AG(AGAMOUS)[2]、金魚草(Antirrhinummajus)的DEF (Deficiens)[3]和人類(Homosapiens)的SRF(SerumResponseFactor)[4]。MADS-BOX基因可以分為2種類型:一種包括動物、真菌中的ARG80/SRF-like基因以及植物的M型;另一種則包括動物、真菌中的MEF2-like基因和植物中的MIKC型[5]。
MADS-BOX基因種類繁多[6],參與調(diào)控植物多方面的發(fā)育進程,特別是在決定花器官特征方面發(fā)揮著重要的調(diào)控作用[7-8]。通過對金魚草和擬南芥一系列突變體的分析,20世紀90年代初科學(xué)家提出了控制花器官發(fā)育的ABC模型,以此來闡述花器官發(fā)育的分子機理[9-10]。隨著擬南芥D類基因STK(SEEDSTICK)[11-12]和E類基因SEP1(SEPALLATA1)-SEP4[13-15]的發(fā)現(xiàn),ABC模型被擴展為ABCDE模型[16-18]。擬南芥小花從外到內(nèi)共有4輪花器官,分別是花萼、花瓣、雄蕊和雌蕊。其中A類基因決定花萼的特征;A類基因和B類基因共同調(diào)控花瓣的發(fā)育;B類基因和C類基因共同決定雄蕊的發(fā)育;C類基因決定心皮的發(fā)育。除了A類基因中的AP2之外,這些基因都是MADS-BOX基因。
除了N端保守的MADS-BOX結(jié)構(gòu)域外,植物MIKC型轉(zhuǎn)錄因子還包括3個結(jié)構(gòu)域:(1)由大約70個氨基酸組成的中度保守的K結(jié)構(gòu)域,主要介導(dǎo)形成同源或者異源二聚體;(2)位于MADS-BOX結(jié)構(gòu)域與K結(jié)構(gòu)域之間的由大約30個不保守氨基酸組成的I結(jié)構(gòu)域;(3)位于C端可變序列組成的激活結(jié)構(gòu)域[19-21]。根據(jù)結(jié)構(gòu)不同,MIKC型基因又可分為MIKCc型和MIKC*型[22-23]。在花發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用的ABCDE類基因大部分都屬于MIKCc型。擬南芥、水稻(Oryzasativa)和新型禾本科模式植物二穗短柄草(Brachypodiumdistachyon)中分別有39、38和32個MIKCc型基因[24-25]。
大部分AGL6的MADS-BOX和K結(jié)構(gòu)域的序列比較保守,而C末端序列相對不保守。例如木蘭屬的5個AGL6基因編碼的蛋白質(zhì)在C末端序列多了7個氨基酸[26]。本實驗室克隆到1個二穗短柄草AGL6基因編碼的蛋白質(zhì),與木蘭屬的這5個AGL6轉(zhuǎn)錄因子一樣,在C末端序列多了7個氨基酸(未發(fā)表)。
AGL6也是MIKCC型基因,但其不屬于ABCDE類基因的任何一種,有關(guān)AGL6基因?qū)òl(fā)育調(diào)控機制的研究尚不夠深入。本文對AGL6基因存在的范圍和進化地位進行了闡述,并對該基因的表達模式和生物學(xué)功能進行了綜述,以期為了解該基因在花發(fā)育過程中的功能奠定基礎(chǔ)。
至少在300萬年以前,AGL6亞家族基因就出現(xiàn)在裸子植物和被子植物的共同祖先中。目前,已有相當數(shù)量的AGL6基因從裸子植物如買麻藤(Gnetummontanum)、銀杏(Ginkgobiloba)和不同的松柏類植物中被分離克隆出來[6]。在基礎(chǔ)被子植物、基礎(chǔ)雙子葉植物、核心雙子葉植物、單子葉植物和木蘭科植物中,都發(fā)現(xiàn)了AGL6基因的存在[27]。例如在雙子葉模式植物擬南芥、矮牽牛(Petuniahybrida)和單子葉模式植物水稻、玉米(Zeamays)等植物中,都克隆到了AGL6基因[28-33]。最近,Kim等[26]在裸子植物蘇鐵屬澤米(Zamiavazquezii)、百歲蘭屬百歲蘭(Welwitschiamirabilis)、被子植物木蘭綱外來萍蓬草(Nupharadvena)、八角茴香科黃花八角(Illiciumparviflorum)等物種中克隆到了多個AGL6基因。本實驗室也在普通小麥的A、B和D基因組中分別克隆到1個AGL6基因, 在二穗短柄草基因組中克隆到了1個AGL6基因(未發(fā)表)。
在新近測序完成的黃瓜(Cucumissativus)基因組中有2個AGL6基因[34],大豆(Glycinemax)中有3個AGL6基因[35],這可能是基因復(fù)制的結(jié)果。Viaene等[36]認為,AGL6基因在進化過程中發(fā)生了4次復(fù)制:1次發(fā)生在核心雙子葉植物的基部;1次發(fā)生在基礎(chǔ)被子植物的多樣性進程中;2次發(fā)生在單子葉植物的進化過程中。
大多數(shù)植物中的AGL6基因在進化樹上同屬于一個分支[27,37],大多數(shù)禾本科植物只有1個AGL6基因,其與水稻的OsMADS6同源[27,37]。但是,在水稻和高粱(Sorghumbicolor)等幾種植物中出現(xiàn)了例外,在這些禾本科植物中存在另外1個AGL6基因,其獨立形成了AGL6亞家族的另一個分支[27,37]。另外,系統(tǒng)進化分析結(jié)果表明,AGL6亞家族與SQUA/AP1、AGL2基因亞家族的關(guān)系非常近,互為姊妹家族[6,26]。它們可能起源于共同的祖先,在373萬年以前同屬于一個超級基因家族,在被子植物從裸子植物中分化出來之前,這些基因形成了3個亞家族;但目前在裸子植物中只發(fā)現(xiàn)了AGL6基因,原因可能是AGL6、SQUA/AP1、AGL2基因共同存在于種子植物最近的共同祖先中,但在進化過程中,SQUA/AP1和AGL2基因從裸子植物中消失了[26]。
基因的表達模式與其生物學(xué)功能相對應(yīng)。在進化過程中,AGL6基因的表達模式也在發(fā)生著變化。
在核心雙子葉植物中,AGL6基因不但在花器官中表達,在營養(yǎng)器官中也有表達。例如葡萄(Vitisvinifera)中的VvAGL6a基因主要在卷須中表達,而VvMADS3基因既在卷須中表達,又在花中表達[36]。甜橙(Citrussinensis)中的euAGL6基因CsAGL6主要在花中表達,而復(fù)制的AGL6-like基因CsAGL62則在莖和花中都表達[36]。在獼猴桃(Actinidiachinensis)中,euAGL6基因AcAGL6b雖然在營養(yǎng)器官和花器官中都表達,但主要在花萼和花瓣中表達,而AGL6-like基因AcAGL6a則主要在花器官中表達[36]。
在木蘭科雙子葉植物中,AGL6基因不在營養(yǎng)器官中表達,魚腥草 (Houttuyniacordata)HcAGL6只在花中表達[36],而AGL6基因在裸子植物和一些核心雙子葉植物的營養(yǎng)器官中表達。原因可能是裸子植物在進化到被子植物的進程中,AGL6基因在營養(yǎng)器官的表達丟失了,但是核心雙子葉植物又獲得了這種表達[36]。
裸子植物買麻藤中的2個AGL6基因GGM9和GGM11在雄性和雌性生殖器官中都表達[6],暗示這2個基因同時調(diào)控雄蕊和雌蕊的發(fā)育。
矮牽牛AGL6基因pMADS4在4輪花器官中都有表達,特別是在胚珠中可持續(xù)和強烈地表達[38]。擬南芥AGL6主要在胚珠中表達,在雄蕊中不表達[39];而AGL13則既在胚珠中表達,又在雄蕊中表達[40]。
在單子葉植物中,對AGL6基因的研究主要集中在禾本科植物上。在這些植物中,AGL6基因主要在花中表達[37]。水稻AGL6基因OsMADS6除在花分生組織中表達外,在內(nèi)稃、漿片和胚珠中也表達,但不在雄蕊中表達[27,41-42];水稻中的另一個AGL6基因OsMADS17則在雄蕊中有表達[42]。玉米中的ZAG3[43]、禾本科植物高粱[37]中的AGL6基因的表達模式與OsMADS6相似。與OsMADS17相似,虎尾草亞科牛筋草(Eleusineindica)AGL6基因在雄蕊中也有表達[37]。本實驗室對小麥和二穗短柄草AGL6基因的研究表明,TaAGL6基因除在幼苗的根中表達之外,在4輪花器官和護穎中也均有表達,其中在內(nèi)稃、漿片和雌蕊中的表達比較強,而在其他器官中的表達比較弱(圖1)。另外,普通小麥不同染色體組上的AGL6基因在不同花器官中的表達強度不同。D染色體組上TaAGL6基因在雄蕊和雌蕊中的表達較強,在護穎和外稃中的表達較弱,而B染色體組上的TaAGL6基因則相反(未發(fā)表)。二穗短柄草中BdAGL6基因只在花中表達,在幼苗的根中和其他營養(yǎng)器官中沒有表達(未發(fā)表)。Wei等[25]的研究結(jié)果表明,二穗短柄草BdAGL6基因在內(nèi)稃、漿片和雌蕊中的表達較強。 Reinheimer等[37]認為,禾本科植物AGL6基因主要在第2輪、第3輪和雌蕊的胚珠中表達。在進化過程中,一些基因失去了在雄蕊或者雌蕊中的表達,獲得了在內(nèi)稃的表達。綜合水稻、玉米、小麥以及二穗短柄草中AGL6基因的表達模式,可以發(fā)現(xiàn)這些基因在內(nèi)稃、漿片和雌蕊(胚珠)中表達水平較高,而在其他花器官中不表達或者表達水平較弱。暗示這些基因可能主要調(diào)控內(nèi)稃、漿片和胚珠的發(fā)育。
圖 1 TaAGL6基因在小麥花器官中的表達模式
到目前為止,只有幾個物種的AGL6基因功能得到解析,研究最清楚的是水稻OsMADS6基因[27,41-42,44]。OsMADS6強等位突變體的花器官全部發(fā)育成了外稃狀結(jié)構(gòu),并且花分生組織失去了決定性[41]。OsMADS6中等強度突變體的內(nèi)稃變成了外稃狀,漿片特征和數(shù)目表現(xiàn)出不同程度的異常,雄蕊數(shù)目減少,另外還形成了一些外稃狀的器官[27,42];部分小花的胚珠發(fā)育也受到了影響,所有小花的花器官數(shù)目增多,少數(shù)小花中央形成了新的小花或者花序。這表明OsMADS6不但影響花器官的發(fā)育,還可影響花分生組織的大小和屬性[27,41-42,45]。對各種雙突變體的分析進一步表明,OsMADS6在調(diào)控花器官和花分生組織發(fā)育方面具有重要功能。例如OsMADS6通過與OsMADS13形成蛋白質(zhì)復(fù)合體而影響胚珠的發(fā)育;與控制心皮發(fā)育的基因DL(DROOPINGLEAF) 共同決定花分生組織的特征,該雙突變體小花中央發(fā)育形成了1個新的花序結(jié)構(gòu)[44];OsMADS6和水稻中B類基因SPW1 (SUPERWOMAN1)基因的雙突變體近一半小花在漿片位置形成了1個新的花序。表明這些小花失去了花分生組織的特征,進一步表明OsMADS6在決定花分生組織屬性方面有一定的功能。OsMADS6還可調(diào)控水稻種子的發(fā)育[45]。水稻中的另1個AGL6基因OsMADS17出現(xiàn)了功能上的分化,在花發(fā)育方面沒有表現(xiàn)出生物學(xué)功能[42]。
有關(guān)玉米AGL6基因ZAG3功能的研究結(jié)果表明,ZAG3突變之后,頂端的穗狀雄花發(fā)育成小花,表明花分生組織獲得了小穗分生組織的一些屬性,這些額外的小花形成額外的花器官和須狀結(jié)構(gòu);雌花會形成額外的稃狀結(jié)構(gòu),胚珠會形成多個須狀結(jié)構(gòu),有些珠心會突出來,暗示胚珠發(fā)育受到了影響[43]。
雙子葉植物矮牽牛AGL6基因PhAGL6突變后,花發(fā)育沒有表現(xiàn)出明顯異常,但是PhAGL6基因pMADS4和矮牽牛E類基因FBP2的雙突變體增強了fbp2花瓣和雄蕊的表型,phagl6fbp2fbp5三突變體的表型又增強了雙突變體的表型,暗示pMADS4具有E類基因的功能[38]。
在擬南芥AGL6 T-DNA插入突變體agl6-2中檢測不到AGL6基因的轉(zhuǎn)錄,但該突變體在開花時間以及花器官發(fā)育方面均沒有表現(xiàn)出明顯異常[46],這可能是由于AGL13的存在引起功能冗余。在煙草花葉病毒35S啟動下,過量表達AGL6的轉(zhuǎn)基因擬南芥表現(xiàn)出了早花的表型[46]。通過激活標簽得到的AGL6表達增強的株系agl6-1D也表現(xiàn)出早花的表型,通過RNA干擾得到的轉(zhuǎn)基因植株表現(xiàn)為晚花,這表明AGL6是一個促進開花的基因。進一步的研究表明,AGL6可能通過抑制FLC的表達和促進FT的表達而促進開花[47]。另外,agl6-1D植株中葉子移動的周期縮短,暗示AGL6可能具有控制生物鐘的功能[48]。最近,研究人員發(fā)現(xiàn)擬南芥AGL13具有調(diào)控雄蕊和雌蕊發(fā)育的功能[40]。這些研究結(jié)果表明,擬南芥的AGL6和AGL13可能有一定的功能冗余,同時又有一定的分化。
通過在擬南芥中的異源表達發(fā)現(xiàn),文心蘭(OncidiumGower Ramsey)AGL6基因OMADS7除了雄蕊之外,在其他花器官中都有表達。在煙草花葉病毒啟動子驅(qū)動下,異源表達OMADS7的轉(zhuǎn)基因擬南芥表現(xiàn)出早花,同時形成心皮狀的花萼結(jié)構(gòu)[49]。同樣,異源表達風信子(Hyacinthusorientalis)HoAGL6的轉(zhuǎn)基因擬南芥也表現(xiàn)出了早花和花器官轉(zhuǎn)變的表型,暗示這些物種的AGL6基因可能參與調(diào)控開花時間和花器官發(fā)育[50]。另外,對園藝植物春蘭(Cymbidiumgoeringii)以及春蘭×大花蕙蘭(Cymbidiumhybdium)雜種的AGL6基因功能的初步研究結(jié)果表明,過量表達春蘭×大花蕙蘭雜種CgAGL6基因的煙草開花時間提前,花瓣和雄蕊出現(xiàn)異常[51-52]。
綜上所述,AGL6基因主要在生殖發(fā)育階段發(fā)揮作用,包括調(diào)控開花時間、花器官數(shù)目、花器官特征及影響花分生組織的特征決定性和種子的發(fā)育等。
AGL6基因在植物中普遍存在,目前只有少數(shù)幾個AGL6基因的功能得以闡明,更多AGL6基因的功能亟需研究。同時,目前對AGL6基因的研究主要集中在序列克隆及表達模式和功能分析等方面,對其作用的具體分子機理有待深入研究。如何將AGL6的研究結(jié)果應(yīng)用于作物遺傳改良的實際中,也是研究人員面臨的課題。
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