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      含截尾數(shù)據(jù)的時間相依的ROC曲線分析*

      2014-03-10 07:04:17上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物統(tǒng)計學(xué)教研室200025張莉娜
      中國衛(wèi)生統(tǒng)計 2014年5期
      關(guān)鍵詞:相依臨床試驗面積

      上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物統(tǒng)計學(xué)教研室(200025) 張莉娜

      含截尾數(shù)據(jù)的時間相依的ROC曲線分析*

      上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院生物統(tǒng)計學(xué)教研室(200025) 張莉娜

      目的將時間相依的ROC曲線應(yīng)用到臨床試驗的分析中。方法采用多中心、隨機(jī)、雙盲雙模擬、陽性藥物平行對照的治療成人慢性乙型肝炎的Ⅱ期臨床試驗,通過三個模型,用時間相依的ROC分析方法考察兩個次要療效指標(biāo)HBVDNA、ALT對療效判定的診斷能力、兩者的綜合診斷能力以及各指標(biāo)診斷能力的組間比較。結(jié)果對乙型肝炎療效的診斷方面,HBVDNA比ALT診斷能力更強(qiáng),HBVDNA和ALT兩個指標(biāo)的綜合診斷能力最強(qiáng),但與HBVDNA單指標(biāo)診斷能力差別無統(tǒng)計學(xué)意義。HBVDNA、ALT以及兩者對療效的綜合診斷能力上,試驗組都要略高于對照組,且組間差別有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。結(jié)論對于一個歷時較長的臨床試驗來說,由于病例依從性的問題會存在一定的脫落,療效的判定存在截尾數(shù)據(jù),并且也是時間相依的,此時對各診斷指標(biāo)診斷能力的考察就應(yīng)該用時間相依的ROC曲線分析更符合實際。

      截尾數(shù)據(jù) 時間相依 一致性概率 ROC曲線

      含截尾數(shù)據(jù)的時間相依的ROC曲線分析是把生存分析和ROC曲線分析相結(jié)合起來分析的一種統(tǒng)計分析方法,其目的是為了分析某診斷指標(biāo)的診斷能力,但同時也考慮到了數(shù)據(jù)存在截尾以及療效的獲得是時間相依等因素。在新藥臨床試驗中,對藥物療效的判斷往往不止一個療效指標(biāo),可能有一個主要療效指標(biāo)和多個次要療效指標(biāo),這時可以用主要療效指標(biāo)作為“金標(biāo)準(zhǔn)”來考察各個次要療效指標(biāo)對療效的診斷能力。而對于一個歷時較長的臨床試驗來說,由于病例依從性的問題會存在一定的脫落,療效的判定存在截尾數(shù)據(jù),并且也是時間相依的,此時對各診斷指標(biāo)診斷能力的考察就應(yīng)該用時間相依的ROC曲線分析。

      另外,對同一種疾病用藥療效的診斷,往往有各種不同的診斷方法或手段,涉及的診斷指標(biāo)是非常多的。不同的指標(biāo)對疾病各方面敏感性是不一樣的,因此在對用藥療效做出診斷時如何充分利用這些指標(biāo)的診斷信息,就顯得非常重要。

      目前國內(nèi)醫(yī)學(xué)統(tǒng)計方面對此方法應(yīng)用甚少涉及,未見較為全面闡述,故本文以一個藥物臨床試驗為例,以Cox比例風(fēng)險模型為基礎(chǔ),通過三個模型分別給出了單指標(biāo)和多指標(biāo)線性組合的時間相依的ROC分析方法。本文意在對讀者展示該類含截尾數(shù)據(jù)的臨床實驗數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)特點(diǎn),統(tǒng)計方法原理與介紹,以及結(jié)果的解讀,以期為臨床實驗工作者實際應(yīng)用提供一個參考。

      資 料

      某新藥是近年新合成的核苷類似物,具有抗逆轉(zhuǎn)錄病毒、嗜肝病毒和皰疹病毒的廣譜抗病毒作用。國外臨床試驗研究表明,該新藥對于乙型肝炎病毒具有顯著的抑制作用。為了評價該新藥治療成人慢性乙型肝炎的有效性,采用多中心、隨機(jī)、雙盲雙模擬、陽性藥物平行對照的Ⅱ期臨床試驗,療程為一年,主要依據(jù)HBVDNA定量和HBeAg陰轉(zhuǎn)率、肝功能ALT的復(fù)常率來判斷臨床療效。

      (1)HBeAg陽性患者療效評價標(biāo)準(zhǔn):

      完全反應(yīng):HBeAg、HBVDNA均陰轉(zhuǎn),ALT復(fù)常。

      部分反應(yīng):HBeAg、HBVDNA一項陰轉(zhuǎn),ALT復(fù)常。

      無反應(yīng):未達(dá)到上述指標(biāo)者。

      (2)HBeAg陰性患者療效評價標(biāo)準(zhǔn):

      完全反應(yīng):HBVDNA均陰轉(zhuǎn),ALT復(fù)常。

      部分反應(yīng):HBVDNA定量下降2個log以上,但未陰轉(zhuǎn),ALT復(fù)常。

      無反應(yīng):未達(dá)到上述指標(biāo)者。

      完全反應(yīng)或部分反應(yīng)評價為有效,無反應(yīng)評價為無效。

      共228例受試者,其中試驗組112例,對照組116例。原始資料名為yigan,數(shù)據(jù)結(jié)構(gòu)見表1。

      表1 兩組慢性乙型肝炎患者基線及治療后療效、LOGHBVDNA和ALT情況

      在這個臨床試驗中,臨床療效是主要指標(biāo),HB-VDNA和ALT是次要指標(biāo)。在比較試驗組和對照組療效后,同時還想評價HBVDNA、ALT對療效判定的診斷能力以及其療效的診斷能力在兩組中是否有差別。由于這是一個長達(dá)一年的臨床試驗,由于依從性的問題,對療效的判定存在一定的截尾數(shù)據(jù),療效的判定是時間相依的。

      原理和方法

      1.時間相依的ROC曲線

      (1)完全數(shù)據(jù)的ROC曲線

      其中W為測量指標(biāo),c為閾值,D為二分類的結(jié)果變量,Se為靈敏度,Sp為特異度。根據(jù)不同的閾值計算靈敏度和特異度從而做出ROC曲線。

      (2)時間相依的ROC曲線

      在生存模型中,結(jié)果變量是時間相依的,所以靈敏度和特異度可看作是時間的函數(shù)。由條件概率和貝葉斯理論,有

      其中s(t)=P(T>t)。在不同時間點(diǎn),根據(jù)不同的閾值計算靈敏度和特異度從而做出時間相依的ROC曲線。

      (3)軟件實現(xiàn):以上述資料為例,對于每一個固定時間點(diǎn)T0和閾值C0,計算S(T0|W<C0),P(W<C0)和S(T0),這些都可以用SAS9.1來實現(xiàn)具體計算。SAS程序如下:

      2.時間相依的ROC曲線下面積

      (1)完全數(shù)據(jù)的ROC曲線下面積(非參數(shù)法):

      不失一般性,假定測量值較大為異常,ROC曲線下面積是陽性組測量值大于陰性組測量值的概率,即一致性概率。設(shè)Wi表示陽性組中第i個檢測結(jié)果,Wj表示陰性組中第j個檢測結(jié)果,陽性例數(shù)用n表示,陰性例數(shù)用m表示。則ROC曲線下面積A的估計值可以用下式計算:

      (2)時間相依的ROC曲線下面積:

      ROC曲線下面積可以由一致性概率來估計。G?nen和Heller已經(jīng)證實,一致性概率的估計CPE(concordance probability estimate)可以由Cox比例風(fēng)險模型獲得。

      AUCn標(biāo)準(zhǔn)誤的估計建立在平滑或數(shù)值微分的基礎(chǔ)上。

      (3)軟件實現(xiàn):以上述資料為例,用SAS9.1宏程序得以實現(xiàn)。在宏程序中,DSN表示所分析的數(shù)據(jù)集名稱,COVARIATES表示Cox模型中的協(xié)變量,SURV表示結(jié)果變量的診斷時間,CENS表示診斷結(jié)果:1表示有效,0表示無效(截尾)。

      結(jié) 果

      表2 各模型下兩組ROC曲線下面積估計及比較

      三個模型試驗組的ROC曲線下面積估計值都要略高于對照組,即HBVDNA、ALT以及兩者對療效的綜合診斷能力上,試驗組都要略高于對照組,且組間差別有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。

      三個模型ROC曲線下面積的兩兩比較,模型I和模型II、模型III和模型II的ROC曲線下面積差別有統(tǒng)計學(xué)意義,模型I和模型III的ROC曲線下面積差別無統(tǒng)計學(xué)意義。此結(jié)果說明在對乙型肝炎療效的診斷方面,HBVDNA比ALT診斷能力更強(qiáng),HBVDNA和ALT兩個指標(biāo)的綜合診斷能力最強(qiáng),但與HBVDNA單指標(biāo)診斷能力差別無統(tǒng)計學(xué)意義。

      表3 三個模型ROC曲線下面積的比較

      圖1~3分別是試驗組、對照組及所有病例在用藥一年后各模型下的ROC曲線,從圖中可直觀的看出模型I(LOGHBV)和模型III(LOGHBV+ALT)的ROC曲線面積非常接近,即兩者的診斷能力接近,而模型II(ALT)的ROC曲線面積相對最小,即診斷能力最差。

      圖4~6反映了試驗組、對照組及所有病例在各個時間點(diǎn)的ROC曲線下面積估計,從圖中可看出無論哪個模型在各時間點(diǎn)的AUC波動都很小,一年后曲線略有上升。這一結(jié)果也說明HBVDNA、ALT這兩個指標(biāo)對于療效的診斷能力是相對比較穩(wěn)定的。

      圖1 試驗組用藥1年后各模型下的ROC曲線

      圖2 對照組用藥1年后各模型下的ROC曲線

      圖3 所有病例用藥1年后各模型下的ROC曲線

      圖4 試驗組各時間點(diǎn)的AUC估計

      圖5 對照組各時間點(diǎn)的AUC估計

      圖6 所有病例各時間點(diǎn)的AUC估計

      討 論

      ROC曲線分析被認(rèn)為是一種診斷試驗評價中的理想和經(jīng)典的方法。但在醫(yī)學(xué)研究中,很多時候“金標(biāo)準(zhǔn)”并非能馬上獲得,是和時間存在依存關(guān)系的。并且在很多臨床研究中,由于受試者的依從性常常會有截尾數(shù)據(jù),此時對各指標(biāo)診斷能力的評價就不能用傳統(tǒng)的ROC曲線分析,而應(yīng)該選用時間相依的ROC曲線分析更接近實際。

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      (責(zé)任編輯:郭海強(qiáng))

      *:上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院“085”工程研究生課程模塊化功能群建設(shè)計劃及“985”工程三期研究生課程體系建設(shè)項目“研究生核心課程群建設(shè)(生物醫(yī)學(xué)統(tǒng)計高級教程)”。

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