湯 睿,申雁冰,格日勒,牛丹丹,王 敏
(工業(yè)發(fā)酵微生物教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津市工業(yè)微生物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津科技大學(xué)生物工程學(xué)院,天津 300457)
一種與膽固醇7,8位脫氫相關(guān)蛋白的表達(dá)研究
湯 睿,申雁冰,格日勒,牛丹丹,王 敏
(工業(yè)發(fā)酵微生物教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津市工業(yè)微生物重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津科技大學(xué)生物工程學(xué)院,天津 300457)
家蠶(Bombyx mori)的Nvd-Bm蛋白是一種與膽固醇7,8–脫氫酶相關(guān)的蛋白.根據(jù)NCBI中報(bào)道的家蠶中的膽固醇7,8–脫氫酶基因序列(GenBank登錄號:AB232986.1),采用密碼子優(yōu)化及基因克隆技術(shù),擴(kuò)增獲得膽固醇7,8–脫氫酶目標(biāo)基因nvd-Bm,并構(gòu)建了重組穿梭載體pPIC9K-nvd-Bm,通過電轉(zhuǎn)化,成功構(gòu)建了含有pPIC9K-nvd-Bm的畢赤酵母(Pichia pastoris)GS115異源真核表達(dá)工程菌株.經(jīng)SDS-PAGE蛋白電泳分析表明,含有pPIC9K-nvd-Bm的畢赤酵母GS115表達(dá)菌株能夠成功表達(dá)目標(biāo)蛋白,為膽固醇的7,8–脫氫產(chǎn)物即7–脫氫膽固醇的生物轉(zhuǎn)化奠定了基礎(chǔ).關(guān)鍵詞:家蠶;膽固醇7,8–脫氫酶;密碼子優(yōu)化;畢赤酵母;誘導(dǎo)表達(dá)
維生素D是一種作用于鈣、磷代謝的維生素[1],它能夠維持人及其他動(dòng)物體內(nèi)的血磷和血鈣的平衡,促進(jìn)骨質(zhì)鈣化以及腸道對鈣磷等元素的吸收[2].其中最重要的是維生素D2(麥角骨化醇)和維生素D3(膽鈣化醇).維生素D3在維生素D生物代謝中活性最高,主要由高級動(dòng)物的表皮和真皮內(nèi)含有的7–脫氫膽固醇經(jīng)紫外線(波長265~228,nm)照射轉(zhuǎn)變而成,也可來自如肝類、魚肝油等動(dòng)物組織中[3–5].而7–脫氫膽醇主要由膽固醇經(jīng)膽固醇7,8–脫氫酶作用轉(zhuǎn)變生成,膽固醇7,8–脫氫酶是合成維生素D3的重要生物催化劑.
膽固醇7,8–脫氫酶主要參與蛻皮動(dòng)物類固醇生物合成過程第一步重要反應(yīng),其主要功能是催化膽固醇轉(zhuǎn)化為7–脫氫膽固醇.目前膽固醇7,8–脫氫酶在分子水平上的作用機(jī)制尚不清楚[6].Yoshiyama等[7]發(fā)現(xiàn),家蠶前胸腺中的neverland基因(nvd-Bm)與7,8–脫氫酶相關(guān).通過RNA干擾和基因敲除技術(shù)獲得的nvd-Bm缺失家蠶幼蟲,其體內(nèi)蛻皮激素的產(chǎn)生量明顯降低而影響其生長,這一干擾可以通過補(bǔ)充7–脫氫膽固醇解除.夏小斌等[8]及Capyk等[9]在秀麗隱
桿線蟲(Caenorhabditis elegans)中發(fā)現(xiàn)了功能類似的基因daf-36(GenBank登錄號:NM_073228.4),并證明該酶屬于Rieske非血紅素鐵加氧酶,包含一段Rieske[2Fe-2S]區(qū)域以及一段非亞鐵血紅素關(guān)聯(lián)區(qū),可催化膽固醇轉(zhuǎn)化為7–脫氫膽固醇,表明nvd-Bm基因具有編碼膽固醇7,8–脫氫酶的作用.
目前,黃時(shí)海等[10]實(shí)現(xiàn)了基因nvd-Dm在大腸桿菌中的少量表達(dá),表達(dá)效率偏低.本研究主要克隆了來自家蠶的nvd-Bm基因(GenBank登錄號:AB232986.1),采用密碼子優(yōu)化技術(shù),構(gòu)建了nvd-Bm基因的真核表達(dá)工程菌并實(shí)現(xiàn)了重組Nvd-Bm蛋白的高效表達(dá).研究結(jié)果為進(jìn)一步進(jìn)行其與伴侶蛋白的共表達(dá)研究奠定了基礎(chǔ).
1.1 菌株與質(zhì)粒
大腸桿菌(Escherichia coli)DH5α、畢赤酵母(Pichia pastoris)GS115及pPIC9K載體均由本實(shí)驗(yàn)室保存;優(yōu)化后的nvd-Bm基因及5’AOX1 / 3’AOX1引物,由金唯智公司合成.
引物5’AOX1的序列為:5′-GACTGGTTCCAAT TGACAAGC-3′;引物3’AOX1的序列為:5′-GCAAATGGCATTCTGACATCC-3′.
1.2 培養(yǎng)基、酶及試劑
畢赤酵母GS115培養(yǎng)基的配制方法參見Invitrogen公司畢赤酵母操作手冊;大腸桿菌DH5α的培養(yǎng)基采用LB培養(yǎng)基[11].
EcoRⅠ限制性內(nèi)切酶、NotⅠ限制性內(nèi)切酶、DNA Marker、低相對分子質(zhì)量蛋白Marker,大連寶生物公司;T4,DNA連接酶,Promega公司;Taq PCR Master Mix,博邁德公司;酵母提取物、蛋白胨,Oxiod公司;膠回收試劑盒,北京天恩澤基因公司;其他化學(xué)試劑均購自天津市北方天醫(yī)化學(xué)試劑廠.
1.3 膽固醇7,8–脫氫酶基因的獲取
通過查閱文獻(xiàn)及NCBI中比對,獲得nvd-Bm基因全序列(GenBank登錄號:AB232986.1);并利用Vector NTI suite 7.0等分子生物學(xué)軟件,在不改變其蛋白質(zhì)氨基酸序列的前提下,綜合考慮密碼子使用頻率、GC含量的調(diào)整、不穩(wěn)定序列的刪除、mRNA二級結(jié)構(gòu)等影響因素,按照巴斯德畢赤酵母的偏愛性對該序列進(jìn)行密碼子改造優(yōu)化[12].并于目標(biāo)基因nvd-Bm兩側(cè)引入EcoRⅠ和NotⅠ酶切位點(diǎn)后,委托金唯智公司進(jìn)行全基因合成.
1.4 畢赤酵母重組表達(dá)菌株的構(gòu)建
用EcoRⅠ和NotⅠ將由公司合成并連有目標(biāo)基因的重組克隆載體pUC57-nvd-Bm及畢赤酵母表達(dá)載體pPIC9K進(jìn)行雙酶切,回收1.3,kbp的片段及pPIC9K骨架,回收產(chǎn)物用T4 DNA連接酶進(jìn)行連接轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α,篩選得到重組表達(dá)載體pPIC9K-nvd-Bm,對重組表達(dá)載體進(jìn)行PCR鑒定及雙酶切鑒定,并將鑒定正確的轉(zhuǎn)化子進(jìn)行測序驗(yàn)證.
將篩選得到的重組表達(dá)載體pPIC9K-nvd-Bm經(jīng)BglⅡ線性化,電轉(zhuǎn)入畢赤酵母GS115感受態(tài)細(xì)胞中,電擊條件:1.5,kV、25,μF、200,?.轉(zhuǎn)化菌液分別涂布于含4,g/L G418的YPD平板上,30,℃孵育至抗性克隆出現(xiàn).
挑取抗性克隆,通過玻璃珠和酚氯仿抽提酵母基因組,以基因組為模板,利用5’AOX1/3’AOX1引物進(jìn)行PCR篩選成功整合的陽性克隆,挑取陽性克隆菌株于YPD培養(yǎng)基中,30,℃培養(yǎng)20,h后,保存甘油管.
1.5 重組質(zhì)粒在畢赤酵母中的誘導(dǎo)表達(dá)及SDSPAGE分析
將篩選出的陽性克隆接種于100,mL BMGY中,30,℃、250,r/min生長至A600≈3,離心收集菌體,轉(zhuǎn)接于BMMY培養(yǎng)基中30,℃培養(yǎng),以最終質(zhì)量分?jǐn)?shù)為0.5%的甲醇溶液進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá).5,d后離心經(jīng)甲醇誘導(dǎo)后的培養(yǎng)液上清液轉(zhuǎn)移至干凈的收集管中,沉淀用裂解緩沖液重懸后通過酸洗玻璃珠渦旋振蕩法進(jìn)行細(xì)胞破碎.分別取菌體培養(yǎng)液上清液及細(xì)胞破碎上清液,通過SDS-PAGE分析蛋白表達(dá)情況.
2.1 膽固醇脫氫酶基因nvd-Bm的獲取及分析
來源于家蠶的膽固醇7,8–脫氫酶基因nvd-Bm(GenBank登錄號:AB232986.1)全長為1,362,bp,GC含量為53.3%.依據(jù)表達(dá)宿主畢赤酵母的密碼子偏愛性,進(jìn)行該基因的密碼子優(yōu)化,改變了其中的335個(gè)堿基對,其GC含量由53.3%降低到52.9%,優(yōu)化后的基因序列見圖1.
NotⅠ和EcoRⅠ雙酶切的質(zhì)粒pUC57-nvd-Bm及pPIC9K的電泳圖如圖2所示.從圖2可以看出:泳道1的1.3,kbp片段、泳道2的9.3,kbp片段,分別與目標(biāo)基因nvd-Bm及pPIC9K預(yù)期結(jié)果相符合,表明已成功獲得目標(biāo)基因片段.
2.2 表達(dá)載體的構(gòu)建
重組質(zhì)粒pPIC9K-nvd-Bm的PCR驗(yàn)證電泳圖如圖3所示.由圖3可以看出:圖中的1.8,kbp片段,與pPIC9K-nvd-Bm菌液PCR預(yù)期結(jié)果相符合,表明目標(biāo)基因nvd-Bm已成功插入畢赤酵母表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K中.取圖3中的pPIC9K-nvd-Bm重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切驗(yàn)證,結(jié)果如圖4所示.圖4中均出現(xiàn)了1.3,kbp片段,進(jìn)一步表明目標(biāo)基因nvd-Bm已成功插入畢赤酵母表達(dá)質(zhì)粒pPIC9K中.選取圖4中驗(yàn)證正確的菌株交由公司進(jìn)行測序,測序結(jié)果與目標(biāo)基因完全一致,表明重組表達(dá)載體pPIC9K-nvd-Bm構(gòu)建成功.
2.3 轉(zhuǎn)化畢赤酵母重組子的篩選和鑒定
含有pPIC9K-nvd-Bm的畢赤酵母工程菌進(jìn)行基因組PCR驗(yàn)證,結(jié)果如圖5所示.圖5出現(xiàn)的1.8,kbp片段,與重組畢赤酵母GS115基因組PCR預(yù)期結(jié)果相符,表明目標(biāo)基因nvd-Bm均已成功整合至畢赤酵母GS115基因組中.
2.4 膽固醇7, 8–脫氫酶的表達(dá)
已構(gòu)建的含有pPIC9K-nvd-Bm的畢赤酵母工程菌經(jīng)甲醇誘導(dǎo)后,分別收集菌體培養(yǎng)液上清液及沉淀.沉淀經(jīng)細(xì)胞破碎后,將菌體培養(yǎng)液上清液及細(xì)胞破碎上清分別經(jīng)蛋白電泳上樣緩沖液重懸煮沸進(jìn)行SDS-PAGE分析.結(jié)果如圖6所示.
由圖6可知:第2泳道,即含有pPIC9K-nvd-Bm的畢赤酵母工程菌培養(yǎng)液在相對分子質(zhì)量約為6.4× 104的位置存在明顯的特異性條帶,由于轉(zhuǎn)錄翻譯起始于載體自身的起始密碼子,翻譯時(shí)會(huì)同時(shí)將載體上的起始密碼子至目標(biāo)基因的起始密碼子間的一段序列一并翻譯出,而該段氨基酸序列相對分子質(zhì)量約為1.3×104,故表達(dá)的蛋白相對分子質(zhì)量會(huì)比實(shí)際蛋白相對分子質(zhì)量5.1×104偏大,約為6.4×104,與預(yù)期相對分子質(zhì)量一致;另外,由于在畢赤酵母中表達(dá)的蛋白會(huì)受到不同程度的糖基化作用,因而電泳中觀測到的蛋白相對分子質(zhì)量會(huì)比目標(biāo)蛋白出現(xiàn)不同程度的偏大.進(jìn)一步經(jīng)蛋白質(zhì)譜鑒定,證明其蛋白一級序列與目標(biāo)蛋白相符,表明目標(biāo)蛋白得到表達(dá),表達(dá)量較高.
化學(xué)法合成7–脫氫膽固醇的生產(chǎn)工藝一般需要4步合成反應(yīng),轉(zhuǎn)化率為62%左右,反應(yīng)途徑長、副產(chǎn)物多、反應(yīng)條件不易控制[13].生物轉(zhuǎn)化法具體高效、綠色的特性,使其成為許多化學(xué)藥物和醫(yī)藥中間體化學(xué)合成工藝的替代技術(shù)[14].
目前雖已有關(guān)于基因nvd-Dm在大腸桿菌中表達(dá)的相關(guān)報(bào)道,但由于其未依據(jù)大腸桿菌的偏愛性進(jìn)行密碼子優(yōu)化,故表達(dá)效率偏低.另外,由于目標(biāo)基因來自于昆蟲細(xì)胞,其轉(zhuǎn)錄翻譯更適合在真核表達(dá)體系中進(jìn)行.本研究對獲得的膽固醇7,8–脫氫酶基因nvd-Bm(GenBank登錄號:AB232986.1)于畢赤酵母中進(jìn)行了外源表達(dá),并依據(jù)畢赤酵母偏愛性進(jìn)行了密碼子優(yōu)化,優(yōu)化后的基因與黃時(shí)海等[11]于大腸桿菌中進(jìn)行的外源表達(dá)相比,有效地提高了膽固醇7,8–脫氫酶Nvd-Bm的表達(dá)效率.本研究還構(gòu)建了重組質(zhì)粒pPIC9K-nvd-Bm,并通過電轉(zhuǎn)化方法,構(gòu)建了含有pPIC9K-nvd-Bm的畢赤酵母GS115工程菌,SDSPAGE蛋白電泳分析表明,目標(biāo)蛋白Nvd-Bm均已成功表達(dá),但均主要存在于胞內(nèi).下一步工作可通過改造pPIC9K-nvd-Bm重組質(zhì)粒信號肽序列引導(dǎo)目標(biāo)蛋白高效胞外分泌,進(jìn)一步提高其分泌表達(dá)量.此外,7,8–脫氫酶的基因組成目前尚不清晰,僅獲得其編碼基因表達(dá)蛋白,往往難以表現(xiàn)出酶活性.因此本課題組將進(jìn)一步研究其與伴侶蛋白的共表達(dá),為膽固醇7,8–脫氫酶的活性檢測奠定基礎(chǔ).
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責(zé)任編輯:周建軍
Expression of the Protein Related to Cholesterol 7,8-Dehydrogenation
TANG Rui,SHEN Yanbing,GE Rile,NIU Dandan,WANG Min
(Key Laboratory of Industrial Fermentation Microbiology,Ministry of Education,Tianjin Key Laboratory of Industrial Microbiology,College of Biotechnology,Tianjin University of Science & Technology,Tianjin 300457,China)
Bombyx moriNvd-Bm protein is associated with cholesterol 7,8-dehydrogenase. Based on DNA sequence encoded cholesterol 7,8-dehydrogenase reported on the NCBI(GenBank:AB232986.1),cholesterol 7,8-dehydrogenase gene was cloned fromBombyx mori. Through codon optimization,cholesterol 7,8-dehydrogenase gene was obtained and the optimized gene was cloned into a yeast expression vector. Heterologously expressed target gene inP. pastorisGS115 resulted in the creation of engineeredP. pastorisGS115 / pPIC9K-nvd-Bm strains. Expression of the target protein in the engineeredP. pastorisGS115 / pPIC9K-nvd-Bm strains was demonstrated by SDS-PAGE. This study provided a foundation for the biological synthesis of 7-dehydrocholesterol.
Bombyx mori;cholesterol 7,8-dehydrogenase;codon optimization;Pichia pastoris;induced expression
Q812
A
1672-6510(2014)06-0027-05
10.13364/j.issn.1672-6510.2014.06.006
2014–01–10;
2014–05–08
國家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)資助項(xiàng)目(2011AA02A211)
湯 睿(1989—),女,河北人,碩士研究生;通信作者:王 敏,教授,minw@tust.edu.cn.