田 蒙, 宋 歌, 胡金天
Treacher collins綜合征的基因?qū)W研究進展
田 蒙, 宋 歌, 胡金天
Treacher collins綜合征; 基因?qū)W; 研究進展
Treacher collins綜合征(treacher collins syndrome,TCS)又稱下頜面骨發(fā)育不全綜合征,是一種影響面部發(fā)育的常染色體顯性遺傳性疾病,在新生兒中的發(fā)生率約為1∶50 000,患者當(dāng)中約40%病例具有家族病史,而超過60%病例為無家族史散發(fā)的新生突變。1846年,該綜合征的首個臨床病例被報道。1900年,E Treacher Collins首次將本病描述為顴骨和下眼瞼缺損的綜合征。1949年,A Franceschetti和D Klein詳細描述了整個綜合征的全部特征。目前,國內(nèi)外學(xué)者針對Treacher collins綜合征進行了較為深入的遺傳學(xué)研究,已將致病基因TCOFl在染色體進行了定位,同時隨著研究的進展發(fā)現(xiàn)POLR1C和POLR1D這兩個基因也是TCS的致病基因?,F(xiàn)就Treacher collins綜合征的基因?qū)W研究進展作一綜述。
1983年,P Balestrazzi報道1例患有TCS的3歲女孩存在t(5;13)(q11;p11)平衡易位,并將本病基因定位于5號染色體上。1991年,MJ Dixon等對12個TCS家系進行了連鎖分析,提出TCS的基因位點與6 P21.31/16 P13.1l易位相關(guān),并將TCOF1的基因進一步定位于染色體5q31~5q34區(qū)域。同年,EW Jabs等應(yīng)用遺傳放射雜交技術(shù),將此基因定位區(qū)域縮小至5q31.2~5q32。1993年,MJ Dixon等使用遺傳連鎖分析和熒光原位雜交技術(shù)相結(jié)合的方法,再一次將TCOF1基因定位于5q32~5q33.1區(qū)段的一個更狹小的區(qū)域內(nèi)。1996年,TCS協(xié)作組首先發(fā)現(xiàn)了TCS患者TCOF1基因的5個致病突變位點。同年,Gladwin等[1]也發(fā)現(xiàn)了5處與TCS協(xié)作組報道不同的突變位點。1996年,Loftus等[2]利用完整的酵母人工染色體和此區(qū)域的部分連續(xù)克隆體為標(biāo)記物,建立了該基因相應(yīng)的轉(zhuǎn)錄圖,并應(yīng)用cDNA末端快速擴增法和重組cDNA克隆技術(shù),得到TCOF1基因完整的編碼序列。人TCOF1基因共由26個外顯子組成,各外顯子大小為49~565 bp。TCOF1基因編碼的蛋白質(zhì)產(chǎn)物為Treacle蛋白,目前Treacle蛋白的具體功能尚不清楚。此后,TCOF1基因外顯子突變檢測成為研究的熱點。Splendore等[3-4]發(fā)現(xiàn),最常見的是外顯子24中5 bp的缺失突變,占17%,同時還發(fā)現(xiàn)外顯子10、15、16、23、24 突變占TCOF1突變的50%以上,從而認為上述外顯子為TCOF1基因的熱點突變。2004年,So等[5]發(fā)現(xiàn)了外顯子6A和16A,并建議修改TCOF1的基因結(jié)構(gòu),希望加入外顯子6A?;谶@些發(fā)現(xiàn),Splendore等[6]更新了TCOF1突變數(shù)據(jù)庫。目前為止發(fā)現(xiàn)的TCOF1突變類型包括錯義、無義、缺失、插入、剪切位點突變等,還包括DNA片段重排,大部分TCOF1突變是由缺失、插入、剪切位點突變、錯義突變導(dǎo)致的移碼突變,從而導(dǎo)致蛋白質(zhì)肽鏈合成提前終結(jié)。
近年來,對于TCOF1基因?qū)W的研究也有了一些新的發(fā)現(xiàn)。Macaya等[7]報道1例TCS患者不僅存在以往報道過的c.122C>T突變,同時還存在一個新的同義突變c.3612A>C,進行家系分析時發(fā)現(xiàn),基因表型正常的數(shù)個家系成員和TCS成員的c.122C>T基因突變有分離,c.3612A>C突變僅存在于患者中。分析淋巴細胞中RNA發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物缺失外顯子22,這些研究結(jié)果表明患者是由于同義突變c.3612A>C引起的TCOF1單倍劑量不足導(dǎo)致的,這項研究強調(diào)了臨床和血統(tǒng)評估在解釋已知的和新出現(xiàn)的序列改變的重要性。Kumar等[8]在研究一家系三代人中4例患有TCS時獨特地發(fā)現(xiàn),1例患者同時存在3q2和5q3的缺失突變,而其余3例患者只有5q3的缺失。由于第1例患者同時存在3q2和5q3缺失,所以這并不能說明3q2的缺失是導(dǎo)致TCS的原因,故需要針對更多的患者進行詳細地基因分析來明確診斷。Marszalek-Kruk等[9]在研究一對患有TCS的同卵雙生姐妹時,發(fā)現(xiàn)了一個新的雜合插入突變c.484_668ins185 bp,她們的父親、兄弟、叔叔都沒有此種突變,這種插入突變引起了讀碼框架的轉(zhuǎn)變和在167 aa處翻譯提前終止。這個插入突變是目前發(fā)現(xiàn)最長的TCOF1插入突變,也是唯一一個發(fā)現(xiàn)在單卵雙胞胎姐妹中的插入突變。2012年,Beygo等[10]首次利用多重連接探針擴增技術(shù)報道了關(guān)于TCOF1基因單一外顯子缺失,這個缺失突變是目前在TCS患者中發(fā)現(xiàn)的最長的一個,長度達3.367 kb,整個外顯子3缺失,導(dǎo)致外顯子5終止密碼子前移,引起移碼突變,在RNA水平上分析這個外顯子的缺失,可能導(dǎo)致Treacle的單倍劑量不足。似乎這種長的缺失突變的發(fā)生率是很低的,精確的發(fā)生率需要更多的研究來提供;對于這種不存在TCOF1、POLR1D和POLR1C點突變的TCS患者,長的基因缺失應(yīng)該也作為TCS的診斷。同年,Bowman等[11]在研究182例 TCS患者時發(fā)現(xiàn),基因重組在TCS患者中占有重要比例,這是第1篇關(guān)于基因重組導(dǎo)致TCS的報道,這個發(fā)現(xiàn)擴大了TCOF1的突變范圍譜,同時指出劑量分析應(yīng)該和序列分析一起來增加TCS患者的診斷敏感度。Zhang等[12]在研究中國的2例 TCS患者時,發(fā)現(xiàn)在TCOF1基因中存在一個新的雜合子突變 (c.4420C>T),這個突變存在于TCS患者中,而不存在于任何不受影響的家庭成員或200例無關(guān)的對照組中。從而得出結(jié)論,新發(fā)現(xiàn)的TCOF1 c.4420C>T突變是導(dǎo)致中國患者TCS的一個病因。
2011年,Dauwerse等[13]利用全基因組掃描技術(shù),在對1例TCOF1基因篩查陰性的患有Treacher Collins綜合征的3歲男孩進行檢查時發(fā)現(xiàn),在常染色體13q12.2區(qū)域有一個156 kb缺失的新生突變,該突變導(dǎo)致POLR1D全基因和LNX2基因的第一外顯子缺失。隨后作者對具有典型TCS特征,但TCOF1基因篩查陰性的252例患者進行篩查時,發(fā)現(xiàn)了20個額外的POLR1C雜合突變,此外,還發(fā)現(xiàn)3例患有TCS的個體中存在POLR1C的2個等位基因突變,這些研究結(jié)果證實了2個額外的基因參與TCS的形成,即POLR1C和POLR1D基因也是TCS的致病基因,這些基因編碼核糖體RNA聚合酶Ⅰ和Ⅲ。近年來,Schaefer等[14]對2個無血緣關(guān)系的TCS家庭進行TCOF1、POLR1C、POLR1D測序。結(jié)果發(fā)現(xiàn),4個受影響的孩子存在相同的純合子突變POLR1D(c.163C>G,p.Leu55 Val)。這是第1篇關(guān)于 POLR1D 突變導(dǎo)致TCS常染色體隱性遺傳的報道。其結(jié)果進一步說明了TCS的遺傳異質(zhì)性,同時強調(diào)了將臨床專業(yè)知識和遺傳分子鑒定相結(jié)合給予適當(dāng)?shù)幕蜻z傳咨詢的重要性。
2011年,Cesaretti等[15]報道2例無鼻畸形且存在 TCS臨床表現(xiàn)的姐弟倆,不存在TCOF1、POLR1D和 POLR1C的基因突變,這并不能說明患者就不患有TCS,對此患者的進一步研究將有可能揭示與TCS及相關(guān)綜合征相關(guān)的新基因。在TCS的3個致病基因中,TCOF1相關(guān)的TCS占研究人群的71% ~93%[4,12]。Dauwerse 等[13]研究發(fā)現(xiàn),在252 個TCOF1陰性的TCS患者中有22例患者存在POLR1C和POLR1D突變,即POLR1C和POLR1D突變的概率占TCOF1陰性患者的9%左右,小于全部TCS患者的2%,大于11%的患者仍找不到遺傳來源。近年來,很多學(xué)者從不同的角度對TCS進行相關(guān)研究,Gordon等[16]提出下頜骨發(fā)育不全合并小頭畸形,可以由染色體17q21的EFTUD2基因雜合突變引起,特別是下頜骨發(fā)育不全合并食管閉鎖的患者,最近歸因于包含EFTUD2基因在內(nèi)的17q21缺失或EFTUD2雜合突變導(dǎo)致。Kadakia等[17]選取1991-2013年的文章,利用遺傳學(xué)的最新文獻和TCS的病理生理學(xué)進行系統(tǒng)回顧,除了表明TCOF1、POLR1C和POLR1D是導(dǎo)致TCS的病因外,最近的資料顯示,p53雜合性可以預(yù)防TCS,p53和TCOF1半合子胚胎不影響核糖體功能,這暗示p53或p53下游在TCS發(fā)病機制中起一定的作用。這些發(fā)現(xiàn),增加了一個新興的TCS關(guān)聯(lián)突變數(shù)據(jù)庫,這可以用來建立TCS診斷和進一步闡明其發(fā)病機制。一直存在假說,神經(jīng)嵴細胞的缺陷、遷移和分化異常,導(dǎo)致包括Treacher-Collins綜合征在內(nèi)的顱面畸形,然而,連接核糖體生物起源和NCC發(fā)展的基礎(chǔ)機制仍然知之甚少。針對于此,Zhao等[18]報道了一個新的斑馬魚點突變,并預(yù)測在斑馬魚wdr43基因中提前出現(xiàn)終止密碼子,其與酵母UTP5直接同源。此突變早期可引發(fā)神經(jīng)、眼、心和咽弓缺陷,后期限制NCC向顱面軟骨的發(fā)育。其研究證明了wdr43在核糖體生物合成中的作用,同時這種突變體缺陷是由一種p53依賴通路調(diào)節(jié)的。最后表明,各種各樣的核仁蛋白質(zhì)的正確定位,包括TCOF1也是依賴于WDR43的。其研究結(jié)果為Wdr43在發(fā)育、核糖體的生物合成以及核糖體誘導(dǎo)的包括TCS在內(nèi)的顱面表型的表達提供了新的角色見解。TCS是導(dǎo)致下頜面骨發(fā)育不全的主要原因,通常TCS患者不存在智力障礙,然而最近,在同時患有下頜面骨發(fā)育不全、小頭畸型、智力障礙和食管閉鎖的患者中發(fā)現(xiàn)了EFTUD2基因。Vincent等[19]報道了2例同時存在下頜面骨發(fā)育不全和智力障礙的TCS患者存在幾個大的基因缺失,其中包括TCOF1基因。并討論了其他基因,如CAMK2A或SLC6A7基因缺失與患者認知發(fā)展延遲的關(guān)聯(lián)性,其認為,遺傳性疾病中觀察到的2例患者將被視為是一個連續(xù)的基因缺失綜合征,同時受TCOF1基因和其他基因如CAMK2A缺失的綜合影響,最后建議對存在智力障礙的TCS患者的5P32缺失進行系統(tǒng)地調(diào)查研究。
綜上所述,目前為止對TCS的基因?qū)W研究取得了很大的進步,使我們對TCS的基因水平發(fā)病機制有了一定的認識,然而,有些問題還不是很清楚,如仍有大于11%的患者即不存在TCOF1突變,也不存在POLR1C和POLR1D突變,仍找不到具體的遺傳來源,因此,要完全了解TCS的發(fā)病機制,還需進一步地科學(xué)探索。
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國家自然科學(xué)基金資助項目(81300863,81372085);協(xié)和青年基金資助和中央高校基本科研業(yè)務(wù)費專項資金資助(3332013091)
100089 北京,兵器工業(yè)北京北方醫(yī)院外科(田 蒙);中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院整形外科醫(yī)院整形四科(章慶國,胡金天)
田 蒙(1986-),女,山東臨沂人,碩士.
胡金天,100144,中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院整形外科醫(yī)院 整形四科,電子信箱:hujintian@vip.163.com
10.3969/j.issn.1673-7040.2014.09.017
2014-04-23)