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      牛源犬新孢子蟲IMP1基因的克隆與序列分析

      2014-01-17 12:03:26張蕾賈立軍魯承
      安徽農(nóng)業(yè)科學(xué) 2014年15期
      關(guān)鍵詞:核苷酸孢子克隆

      張蕾,賈立軍,魯承

      (延邊大學(xué)農(nóng)學(xué)院動(dòng)物醫(yī)學(xué)系,吉林延吉133002)

      新孢子蟲病(Neosporiasis)是由犬新孢子蟲引起的多種家畜的一種原蟲病,該病可引起孕畜的流產(chǎn)、死胎,以及新生胎兒的運(yùn)動(dòng)障礙和神經(jīng)系統(tǒng)疾病[1]。1988年Dubey等從癱瘓后肢的犬體分離了蟲體,將其命名為犬新孢子蟲[2]。犬新孢子蟲為專性細(xì)胞內(nèi)寄生原蟲,隸屬于復(fù)頂亞門原生動(dòng)物門新孢子蟲亞綱孢子蟲綱新孢子蟲屬。新孢子蟲病分布于世界各地,瑞士、挪威、芬蘭、哥斯達(dá)黎加、愛爾蘭、菲律賓、越南、泰國(guó)、以色列、俄羅斯、古巴等國(guó)都有因?yàn)樾骆咦酉x病引發(fā)母牛流產(chǎn)的事件[3]。該病給畜牧業(yè)造成了巨大的經(jīng)濟(jì)損失,嚴(yán)重危害了養(yǎng)殖業(yè)的健康發(fā)展[4-5]。IMP1是2011年在巨型艾美耳球蟲內(nèi)發(fā)現(xiàn)的一類具有免疫保護(hù)性的蛋白,但該蛋白的來源和功能尚不明確。Cui等對(duì)犬新孢子蟲IMP1基因蛋白進(jìn)行了鑒定和定位的初步研究[6]。為了解牛源犬新孢子蟲IMP1基因的生物學(xué)特性,筆者對(duì)IMP1基因進(jìn)行克隆與序列分析,旨在為IMP1基因的表達(dá)及后續(xù)研究奠定基礎(chǔ)。

      1 材料與方法

      1.1 材料

      1.1.1 菌株與蟲株。Ecoli.DH5α 菌株、犬新孢子蟲吉林株和感受態(tài),均來自延邊大學(xué)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)實(shí)驗(yàn)室。

      1.1.2 主要試劑。DNA Marker2000、pMD18-T Simple Vector、XhoⅠ、Eco RⅠ和 ExTaq DNA 聚合酶,購(gòu)自寶生物工程公司(大連);質(zhì)粒提取試劑盒、蛋白酶K、溶菌酶和DNA凝膠回收試劑盒,購(gòu)自O(shè)MEGA公司;其他試劑均為國(guó)產(chǎn)分析純級(jí),市售。

      1.2 方法

      1.2.1 引物的設(shè)計(jì)及合成。應(yīng)用Primer Premier5.0及Oligo6.0軟件設(shè)計(jì)了一對(duì)引物P1、P2,引物由上海英駿生物技術(shù)公司合成。(P1)上游:5'CGGGATCCATGGGAGGCGTTTGCTCTAA 3';(P2)下游:5'CGGAATTCTTCAATGCCGGTCAGAAGC 3'。

      1.2.2 IMP1基因的PCR擴(kuò)增與鑒定。以犬新孢子蟲吉林株基因組DNA為模板,PCR反應(yīng)總體系為25μl:2μl dNTP,模板 DNA 5 μl,上下游引物各 1 μl,Taq 酶 0.25 μl,2.5 μl 10×PCR Buffer,ddH2O 13.25 μl。優(yōu)化 PCR 反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5 min,94℃變性45 s,58℃退火1min,72℃延伸1 min,進(jìn)行30個(gè)循環(huán),最后72℃條件下延伸10 min。PCR反應(yīng)結(jié)束后,將其產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)。

      1.2.3 IMP1基因的克隆。用 pMD18-T Simple Vector與純化回收的IMP1片段進(jìn)行連接,轉(zhuǎn)入E.coli.DH5α感受態(tài)細(xì)胞,涂布于LB固體培養(yǎng)基上(含有Amp抗性)篩選陽性菌落。

      1.2.4 重組質(zhì)粒的PCR鑒定與酶切鑒定。提取重組質(zhì)粒DNA,應(yīng)用P1、P2進(jìn)行 PCR 鑒定;應(yīng)用 Eco RⅠ和 Bam HⅠ進(jìn)行雙酶切鑒定。

      1.2.5 IMP1基因片段的序列測(cè)定與分析。將鑒定正確的陽性克隆質(zhì)粒送往上海英俊生物技術(shù)公司進(jìn)行測(cè)序,并使用分子生物學(xué)軟件DNAstar系統(tǒng)對(duì)測(cè)序結(jié)果進(jìn)行分析。

      2 結(jié)果與分析

      2.1 目的基因的擴(kuò)增 以提取的犬新孢子蟲吉林株基因組DNA為模板,P1、P2為引物,擴(kuò)增出片段長(zhǎng)度為762 bp的IMP1基因片段(圖1)。

      2.2 重組質(zhì)粒pMD18-IMP1的鑒定 將IMP1基因與pMD18-T Simple Vector質(zhì)粒連接,從而獲得重組克隆質(zhì)粒pMD18-IMP1,進(jìn)行PCR擴(kuò)增,得到與目的基因片段大小一致條帶,說明重組質(zhì)粒中含有IMP1基因。經(jīng)Eco RⅠ和Bam HⅠ雙酶切鑒定,得到762 bp的目的片段和2 692 bp的載體片段(圖2),說明IMP1基因成功克隆到pMD18-T Simple Vector上。

      圖1 目的基因PCR擴(kuò)增結(jié)果

      圖2 重組質(zhì)粒pMD18-IMP1的酶切鑒定結(jié)果

      2.3 重組質(zhì)粒pMD18-IMP1的序列測(cè)定 測(cè)序結(jié)果表明,克隆得到的IMP1基因核苷酸長(zhǎng)度為762 bp,編碼243個(gè)氨基酸。核苷酸序列197位上測(cè)序?yàn)锳,而NCBI中為T,與Gen Bank(XM_003879531.1)中IMP1基因核苷酸的同源性為99.9%(圖3)。而氨基酸66位編碼的賴氨酸,突變之后編碼甲硫氨酸,氨基酸同源性為99.6%(圖4)。

      圖3 IMP1基因序列與GenBank上(XM_003879531.1)序列同源性比較

      圖4 IMP1基因編碼氨基酸序列的同源性比較

      3 討論

      禹海杰通過間接免疫熒光技術(shù)對(duì)弓形蟲速殖子不同時(shí)期IMP1蛋白的表達(dá)特性研究發(fā)現(xiàn),在游離、吸附于細(xì)胞表面、入侵中、入侵后及納蟲空泡中的速殖子IMP1均有表達(dá),均被定位于蟲體表面,且在有些蟲體的頂端表達(dá)更為強(qiáng)烈[7]。Cui等對(duì)犬新孢子蟲IMP1基因蛋白研究表明,IMP1基因蛋白編碼1 182 bp的開放閱讀框,編碼393個(gè)氨基酸,編碼的蛋白約42.9 kDa,該氨基酸序列沒有信號(hào)肽和跨膜區(qū),但有9個(gè)?;稽c(diǎn)和14個(gè)磷酸化位點(diǎn)。試驗(yàn)選擇IMP1開放閱讀框內(nèi)基因片段進(jìn)行擴(kuò)增與克隆,目的是為IMP1基因的表達(dá)和生物學(xué)特性的研究奠定基礎(chǔ)。

      試驗(yàn)對(duì)構(gòu)建的IMP1基因重組質(zhì)粒進(jìn)行測(cè)序,得到的IMP1基因核苷酸長(zhǎng)度為762 bp,編碼243個(gè)氨基酸。核苷酸序列197位上測(cè)序?yàn)锳,而NCBI中為T,與GenBank(XM_003879531.1)中IMP1基因核苷酸的同源性為99.9%;氨基酸66位編碼的賴氨酸突變?yōu)榧琢虬彼?,氨基酸同源性?9.6%,該突變是否對(duì)蛋白的表達(dá)及其他特性造成影響還有待于進(jìn)一步研究。

      [1]BJERKAS I,MOHN SF,PRESTHUSJ.Unidentified cyst-forming sporzoon causing encephalomyelitis and myositis in dogs[J].Zeitschr Parasitenkunde,1984,70(2):271 -274.

      [2]DUBEY JP,CARPENTER JL,SPEERCA,etal.A newly recognized fatal protozoan disease of dogs[J].JAm VetMed Assoc,1988,192(9):1269 -1285.

      [3]OOIH K,H UANG C C,YANG C H,et al.Serological survey and first finding of Neospora caninum in Tai-wan,and the detection of its antibodies in various body fluids of cattle[J].Veterinary Parasitology,2000,90:47 -55.

      [4]鄧沖,張維,劉群,等.乳牛流產(chǎn)胎兒中新孢子蟲的鑒定[J].中國(guó)獸醫(yī)科學(xué),2007,37(1):16 -19.

      [5]張守發(fā),丁德,鞠玉琳,等.膠體金免疫層析法與ELISA法對(duì)牛的新孢子蟲血清抗體檢測(cè)結(jié)果的比較[J].中國(guó)獸醫(yī)雜志,2008,44(8):54-55.

      [6]CUIX,LEIT,YANGD Y,etal.Identification and characterization ofa novel Neospora caninum immunemapped protein 1 [J].Parasitology,2012,139(8):998-1004.

      [7]禹海杰.弓形蟲疫苗候選抗原IMP1生物學(xué)特性及其免疫原性研究[D].杭州:浙江大學(xué),2013.

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