馬義騰,張 靜,吳靖芳,寇金慶,張江蘭,張 耕
(1.河北北方學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)本科2010級(jí)2班,河北 張家口 075000;2.河北北方學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院組織胚胎學(xué)教研室,河北 張家口 075000;3.河北北方學(xué)院臨床醫(yī)學(xué)本科2010級(jí)1班,河北 張家口 075000)
胃潰瘍的形成及愈合涉及到胃黏膜侵襲因素與黏膜、自身防御-修復(fù)因素,而表皮生長(zhǎng)因子 (epider-mal growth factor,EGF)是一種具有促進(jìn)細(xì)胞增殖和分化的重要生物活性肽,在維持黏膜完整性方面具有重要作用,它通過(guò)與細(xì)胞表面的受體 (epidermal growth factor receptor,EGFR)結(jié)合而發(fā)揮作用[1]。二者在基因水平的表達(dá)是其在蛋白水平發(fā)揮功能的基礎(chǔ),因此我們建立大鼠胃潰瘍模型,通過(guò)采用半定量轉(zhuǎn)錄-聚合酶鏈反應(yīng) (reverse transcription-polymerase chain reaction,RT-PCR)法檢測(cè)大鼠胃黏膜EGF mRNA、EGFR mRNA在胃潰瘍自愈期間的表達(dá)情況,探討二者在胃黏膜修復(fù)中的意義及半定量RT-PCR法用于此項(xiàng)檢測(cè)的價(jià)值。
Redzol、DEPC購(gòu)自北京賽百盛生物工程有限公司,dNTP Mix、DL2000,Goldview、M-MLV反轉(zhuǎn)錄酶,RNase抑制劑購(gòu)自Gene Copoeia公司;2×Taq PCR體系購(gòu)自北京盛旭百川生物工程公司,引物由北京賽百盛生物工程有限公司合成。
8周齡雄性SD大鼠 (購(gòu)自北京維通利華實(shí)驗(yàn)動(dòng)物技術(shù)有限公司)共36只,體質(zhì)量 (180~230)g。分為潰瘍組和正常組。潰瘍組在胃體前壁近胃竇處注射0.01mL冰乙酸制備胃潰瘍模型;正常組不做處理。潰瘍組分別于制成模型后1、4、6、10、14d(每組6只)取材,正常組 (6只)與潰瘍1d組同時(shí)取材。取材前各組動(dòng)物禁食12h,經(jīng)3%戊巴比妥鈉腹腔注射麻醉后,迅速開(kāi)胸取胃,取潰瘍旁胃組織及正常組近胃竇胃組織約100mg經(jīng)DEPC水清洗后迅速置于液氮中以備RT-PCR檢測(cè)。
①提取胃黏膜總RNA:100mg組織剪碎,加入1mL Redzol充分研磨,將裂解液移入到1.5mL EP管中,室溫放置5min。加200μL氯仿,劇烈搖動(dòng)30s,室溫3min,12 000r·min-1(4℃)離心15 min。取上層無(wú)色水相移入另一EP管中,加等體積異丙醇,室溫下放置10min,12 000r·min-1(4℃)離心15min。管底部可見(jiàn)白色RNA沉淀。棄上清,加1mL 75%乙醇洗滌,7 500r·min-1(4℃)離心5 min,棄上清,室溫干燥5~10min后溶于一定量DEPC水中,保存于-70℃超低溫冰箱中;②RNA完整性檢測(cè):5μL RNA加1μL上樣緩沖液在1.5%瓊脂糖中電泳,用UVP GELDOC-IT凝膠成像系統(tǒng)觀察;③RNA純度及濃度測(cè)定:DEPC水按一定比例稀釋后RNA經(jīng)紫外分光光度計(jì)分別測(cè)量260、280nm的吸光度值,根據(jù)比值檢測(cè)RNA純度,同時(shí)根據(jù)260nm吸光度值 (absorbance,A),計(jì)算每組RNA濃度,并進(jìn)行調(diào)整,使其保持一致;④反轉(zhuǎn)錄:反應(yīng)總體系20μL,其中總RNA 2.5μL,隨機(jī)引物1μL,M-MLV 1μL,dNTPs 2μL,RNase抑制劑1μL;⑤PCR擴(kuò)增反應(yīng):總體系20μL,其中cDNA 2μL,EGF引物序列為:上游5′-GCCAAGCTCAGAAGGCTAC-3′,下游5′-CAGGCCAGCCTCGTCTCAT-3′,擴(kuò)增條件94℃30s,54℃30s,72℃1min,循環(huán)35次,產(chǎn)物361bp;EGFR引物序列為:上游5′-TCGGTGCTGTGCGATTTA-3′,下游5′-TTTCTGGCAGTTGCTCCTC-3′,擴(kuò)增條件94℃30s,53℃30s,72℃1min,循環(huán)35次,產(chǎn)物194bp;GAPDH引物序列為:上游5′-CAGTGCCAGCCTCGTCTCAT-3′,下游5′-AGGGGCCATCCACAGTCTTC-3′,擴(kuò)增條件94℃30s,58℃30s,72℃1min,循環(huán)35次,產(chǎn)物595bp。PCR產(chǎn)物測(cè)定及分析:PCR反應(yīng)產(chǎn)物在1.5%瓊脂糖中電泳,用UVP GELDOCIT凝膠成像系統(tǒng)觀察。
用凝膠成像系統(tǒng)觀察并檢測(cè)EGF、EGFR擴(kuò)增產(chǎn)物與GAPDH的吸光度 (A)值,根據(jù)EGF、EGFR與GAPDH的吸光度比值對(duì)其進(jìn)行半定量分析。數(shù)據(jù)均用 (±s)表示,應(yīng)用SPSS17.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行單因素方差分析和q檢驗(yàn)。
胃潰瘍術(shù)后1d,大鼠胃前壁即可見(jiàn)邊界清楚的潰瘍形成,周圍黏膜隆起 (圖1);4、6d組潰瘍更為明顯,隨后潰瘍逐漸縮小,部分愈合。
所提取的mRNA完整性良好 (圖2),28srRNA和18srRNA條帶清楚并完整,無(wú)拖帶和污染。A260/A280比值在1.8~2.0之間,其純度良好。EGF mRNA (圖3A)、EGFR mRNA (圖3B)、GAPDH(圖3C)擴(kuò)增產(chǎn)物分別是250~500bp、100~250bp、500~750bp的一條清晰擴(kuò)增帶,結(jié)果顯示EGF mRNA、EGFR mRNA在術(shù)后表達(dá)逐漸增強(qiáng),二者分別在潰瘍10d、潰瘍6d組表達(dá)最強(qiáng),之后稍減弱(表1,圖4)。
表1 大鼠胃黏膜EGF/GAPDH mRNA、EGFR/GAPDH mRNA OD比值(±s)
表1 大鼠胃黏膜EGF/GAPDH mRNA、EGFR/GAPDH mRNA OD比值(±s)
注:與正常組相比:▲P<0.01;與前一潰瘍組相比:*P<0.05,**P<0.01
正常組 潰瘍1d 潰瘍4d 潰瘍6d 潰瘍10d 潰瘍14d EGF 0.80±0.13 1.10±0.04▲ 1.68±0.06▲** 1.73±0.14▲ 1.99±0.10▲** 1.68±0.05▲**EGFR 0.83±0.04 1.44±0.13▲** 1.53±0.13▲ 1.69±0.10▲* 1.49±0.15▲** 1.37±0.10▲
圖1 大鼠胃潰瘍術(shù)后1d胃粘膜潰瘍形成 (→)
圖2 大鼠胃黏膜總RNA電泳圖
圖3 RT-PCR法測(cè)得的EGF mRNA (4A),EGFR mRNA (4B),GAPDH mRNA (4C)的結(jié)果 M:Marker;N:正常組;1、4、6、10、14分別代表1、4、6、10、14d潰瘍組。
圖4 大鼠胃黏膜EGF/GAPDH mRNA、EGFR/GAPDH mRNA A比值
胃潰瘍是消化道常見(jiàn)的疾病,且有5%的胃潰瘍能發(fā)生惡變,潰瘍后黏膜的修復(fù)過(guò)程關(guān)系到疾病的發(fā)展與轉(zhuǎn)歸,研究表明潰瘍的愈合質(zhì)量與EGF及EGFR的表達(dá)密切相關(guān)[2]。EGF是重要的黏膜修復(fù)因子,是生長(zhǎng)因子家族中第一個(gè)發(fā)揮作用的[3],它與靶細(xì)胞上的受體EGFR結(jié)合后,激活EGFR-ERK信號(hào)傳導(dǎo)系統(tǒng)發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng)[4]。EGF能夠抑制胃酸分泌,促進(jìn)上皮細(xì)胞增生,在保護(hù)胃黏膜免受損傷因子的破壞,維持黏膜完整性方面起到重要的作用[5]。EGFR是具有酪氨酸激酶活性的一種跨膜糖蛋白受體,與EGF具有較高的特異性親合力[6],能傳遞EGF家族的生物學(xué)活性并使其完全表達(dá),并可提高損傷部位旁EGFR數(shù)目,從而促進(jìn)損傷黏膜上皮的修復(fù)[7]。
本實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示大鼠胃潰瘍自愈期間胃黏膜能夠內(nèi)源性地表達(dá)EGF mRNA及EGFR mRNA,并在潰瘍后黏膜愈合早期、中期呈現(xiàn)漸增趨勢(shì),在愈合晚期略有下降,兩種因子的表達(dá)規(guī)律與胃潰瘍的愈合是一致的,并與我們課題組在檢測(cè)兩種因子蛋白水平的變化趨勢(shì)也是一致的[8],兩種因子在基因水平的表達(dá)是決定其在蛋白翻譯水平發(fā)揮功能的基礎(chǔ)。研究表明,EGFR是早期反應(yīng)基因,出現(xiàn)時(shí)間早于中間反應(yīng)基因EGF[9],我們實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示在潰瘍術(shù)后1d,EGFR mRNA表達(dá)即增強(qiáng),至術(shù)后6d表達(dá)最強(qiáng),EGF mRNA于術(shù)后4d增強(qiáng)較為明顯,術(shù)后10d表達(dá)最強(qiáng),與國(guó)外文獻(xiàn)報(bào)道一致。
本實(shí)驗(yàn)中,我們采用半定量RT-PCR法檢測(cè)EGF mRNA和EGFR mRNA的表達(dá),RT-PCR法是近幾年常用的一種檢測(cè)RNA的技術(shù)方法,將mRNA先反轉(zhuǎn)錄成cDNA,再進(jìn)行PCR擴(kuò)增,以推測(cè)各樣品中特異mRNA的相對(duì)含量。實(shí)時(shí)定量PCR法雖能精確計(jì)算基因表達(dá)量,但減少了擴(kuò)增后電泳的檢測(cè)步驟,因此不能監(jiān)測(cè)擴(kuò)增產(chǎn)物的大小;同時(shí)此方法實(shí)驗(yàn)成本較高也限制了其廣泛的應(yīng)用。而半定量RT-PCR法對(duì)試驗(yàn)條件的要求不高,方便快捷,一般實(shí)驗(yàn)室即能開(kāi)展,其主要特點(diǎn)是選一個(gè)表達(dá)穩(wěn)定的內(nèi)參基因(β-actin或GAPDH)作為比較標(biāo)準(zhǔn),通過(guò)得到的待測(cè)基因與內(nèi)參基因條帶吸光度比值,來(lái)分析各實(shí)驗(yàn)組RNA的含量[10]。此方法能消除實(shí)驗(yàn)中的誤差,采用的是相對(duì)值而不是絕對(duì)值,在比較各實(shí)驗(yàn)組樣品之間mRNA的表達(dá)差異時(shí)能夠足以說(shuō)明問(wèn)題,因此在各個(gè)研究領(lǐng)域都有著非常廣泛的應(yīng)用。RT-PCR實(shí)驗(yàn)成功與否與實(shí)驗(yàn)操作關(guān)系密切。在提取總RNA時(shí)要嚴(yán)格防止RNA酶污染,組織盡可能碾碎,并充分與RNA抽提試劑混合,以獲得足量的RNA。吸取氯仿離心后上層含RNA的水相時(shí)應(yīng)遵循寧少勿多的原則,避免吸入中間層的DNA和下層的蛋白質(zhì)。同時(shí)要對(duì)RNA進(jìn)行純度分析,紫外光下觀察凝膠電泳后RNA,一般會(huì)出現(xiàn)28S、18S2條帶,而且28S條帶的亮度是18S的2倍時(shí),表明RNA的完整性較好。紫外分光光度計(jì)測(cè)量A260/A280的值在1.8~2.0之間時(shí),說(shuō)明純度比較高,如果比值低,說(shuō)明有蛋白質(zhì)污染,而比值高說(shuō)明RNA已水解成單核酸了。在進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄cDNA第一鏈時(shí)一般可應(yīng)用試劑盒,需要注意的是要對(duì)各樣本的RNA濃度進(jìn)行調(diào)整,通過(guò)A260值計(jì)算出濃度,統(tǒng)一調(diào)整至各組RNA濃度一致,再進(jìn)行反轉(zhuǎn)錄。進(jìn)行半定量PCR反應(yīng)時(shí)要選擇合適的內(nèi)參,β-actin或GAPDH均可。半定量RT-PCR技術(shù)是利用產(chǎn)物與模板的線性關(guān)系,來(lái)檢測(cè)總RNA中目的基因的表達(dá)。但是如果循環(huán)數(shù)較多,擴(kuò)增反應(yīng)會(huì)隨著酶活性下降和反應(yīng)物的消耗進(jìn)入平臺(tái)期。在平臺(tái)期的擴(kuò)增使低水平表達(dá)的目的RNA可能會(huì)增加,產(chǎn)生非特異性,因此要經(jīng)過(guò)反復(fù)實(shí)驗(yàn)選擇合適的循環(huán)數(shù)。退火溫度也是PCR反應(yīng)的關(guān)鍵環(huán)節(jié),是引物和模板結(jié)合時(shí)的溫度參數(shù),是影響PCR特異性的較重要因素。退火溫度足夠低,以保證引物同目的序列有效退火,同時(shí)還要足夠高,以減少非特異性結(jié)合,因此可通過(guò)PCR儀梯度設(shè)置退火溫度選擇最為合適的條件,建立優(yōu)化的PCR體系。
我們實(shí)驗(yàn)表明胃黏膜在胃潰瘍愈合的過(guò)程中可自身產(chǎn)生EGF mRNA和EGFR mRNA,二者在基因水平上的表達(dá)直接影響蛋白水平功能的發(fā)揮,在胃潰瘍愈合過(guò)程中起到了促進(jìn)的作用,同時(shí)半定量RT-PCR法在檢測(cè)基因表達(dá)水平方面是一個(gè)強(qiáng)有力的研究手段,但在關(guān)鍵環(huán)節(jié)中要加以注意,才能得到可靠準(zhǔn)確的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。
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