邢麗丹,糜祖煌,徐鑫鑫,汪 汀,田莎莎,原鴻雁,張 盼,紀(jì)曉昀,蘇兆亮,許化溪
2.江蘇省無錫市克隆遺傳技術(shù)研究所。
鮑曼不動(dòng)桿菌是一類醫(yī)院常見的不發(fā)酵糖革蘭陰性桿菌,屬條件致病菌。在人類,鮑曼不動(dòng)桿菌可定植于皮膚、傷口、呼吸道和消化道,在免疫力低下時(shí)可感染機(jī)體發(fā)?。?]。近年來由于抗菌藥物的大量使用和各種侵襲性診療操作的實(shí)施,鮑曼不動(dòng)桿菌的檢出率和耐藥率越來越高,甚至在一些科室呈暴發(fā)流行,引起了臨床和實(shí)驗(yàn)室醫(yī)師的廣泛關(guān)注。鮑曼不動(dòng)桿菌具有自動(dòng)上調(diào)或主動(dòng)獲得耐藥決定因子的能力[2],其耐藥性正在逐年的增高,而且臨床感染多以多重耐藥菌株為主,對臨床治療帶來了極大的困難和挑戰(zhàn)。對于感染鮑曼不動(dòng)桿菌患者的治療通常采用β內(nèi)酰胺類、氨基糖苷類和氟喹諾酮類抗菌藥物,但隨著這些抗菌藥物使用的增加,耐藥菌株越來越多。為了解本地區(qū)鮑曼不動(dòng)桿菌的流行和耐藥情況,本研究對江蘇大學(xué)附屬醫(yī)院和鎮(zhèn)江市第一人民醫(yī)院于2012年8—11月分離的多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌的氨基糖苷類耐藥基因aac(3)-I、aac(6’)-Ib、aph(3’)和16S rRNA甲基化酶基因armA 進(jìn)行了檢測,旨在為臨床氨基糖苷類抗生素的合理應(yīng)用提供參考。現(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。
臨床分離的36株鮑曼不動(dòng)桿菌均來自2012年8—11月江蘇大學(xué)附屬醫(yī)院和鎮(zhèn)江市第一人民醫(yī)院36例住院患者的臨床樣本,剔除同一患者同一部位重復(fù)分離的菌株?;颊吣?6例,女10例,年齡9~93歲。樣本分布為:痰液34份,靜脈置管1份,腹水1份。
(一)藥物敏感試驗(yàn) 采用K-B紙片擴(kuò)散法測定多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌對抗菌藥物的敏感性,MH瓊脂和藥敏紙片分別為博賽生物科技有限公司和OXOID公司產(chǎn)品,以大腸埃希菌ATCC 25922和銅綠假單胞菌ATCC27853作為質(zhì)控菌株,并根據(jù)2010年版CLSL標(biāo)準(zhǔn)判斷藥敏試驗(yàn)結(jié)果。
(二)細(xì)菌處理 挑選純培養(yǎng)菌落置入0.5 mL離心管內(nèi)(內(nèi)置50μL裂解液和蛋白酶K的混合物),PCR儀上55℃1 h(消化細(xì)菌菌體)后95℃10 min(破壞裂解液內(nèi)的蛋白酶K),然后每管補(bǔ)充200μL純水,即為DNA模板液,置于-20℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
(三)基因檢測 PCR法檢測氨基糖苷類耐藥基因,靶基因引物序列見表1。
PCR擴(kuò)增體系為:每反應(yīng)體系P1、P2引物各0.5μmol/L,dNTPs各200 mmol/L,KCl 10 mmol/L,(NH4)2SO48 mmol/L,MgCl22 mmol/L,Tris-HCl(pH9.0)10 mmol/L,NP400.5%,BSA0.02%,Taq DNA pol 1 u??偡磻?yīng)體積20μL(其中模板液5μL)。PCR擴(kuò)增熱循環(huán)參數(shù)為:93℃預(yù)變性2 min,然后93℃60 s→55℃60 s→72℃60 s,循環(huán)35個(gè)周期,最后72℃延長2 min。耐藥基因檢測試劑盒、靶基因PCR引物序列和陽性對照DNA由無錫市克隆遺傳技術(shù)研究所提供。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)2%瓊脂糖凝膠電泳后,在紫外凝膠電泳成像儀下觀察,并記錄結(jié)果。
(四)基因測序 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物在美國應(yīng)用生物系統(tǒng)公司提供的ABI3730型毛細(xì)管全自動(dòng)測序儀上測序,委托上海翰宇生物技術(shù)有限公司完成。
(五)序列比對分析 應(yīng)用Chromas讀序工具軟件,測序結(jié)果用Chromas直接作BLAST(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST )比對。
表1 靶基因PCR引物序列及終產(chǎn)物長度Table 1 Target genes and the primers used in PCR assay
多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌是指對5類抗菌藥物中的3類及以上耐藥,包括氨基糖苷類、β內(nèi)酰胺酶抑制劑、頭孢菌素類、碳青霉烯類和氟喹諾酮類抗菌藥物。36株多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌的藥物敏感試驗(yàn)結(jié)果見表2。
氨基糖苷類乙酰轉(zhuǎn)移酶(acetyltransferase)基因aac (3)-1、aac (6′)-1b、磷酸轉(zhuǎn)移酶(phosphotransferase)基因aph(3′)-1和16S rRNA 甲基化酶(16S rRNA methylase)基因armA 均有不同程度的檢出,aph(3′)-1和armA 陽性率較高。氨基糖苷類修飾酶基因檢測結(jié)果見表3。
表2 36株多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌藥敏試驗(yàn)結(jié)果[n(%)]Table 2 Results of susceptibility testing of the 36 multidrug-resistant strains of Acinetobacter baumannii[n (%)]
表3 36株多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌氨基糖苷類耐藥基因結(jié)果[n(%)]Table 3 The prevalence of aminoglycoside-resistant genes in the 36 multidrug-resistant strains of Acinetobacter baumannii[n (%)]
對4種基因的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行DNA測序,并進(jìn)行BLASTn比對分析,結(jié)果與GenBank中已注冊的序列一致,同源性均≥99.0%。
鮑曼不動(dòng)桿菌是典型的條件致病菌,在醫(yī)院特別是ICU常呈暴發(fā)流行[3]。鮑曼不動(dòng)桿菌感染主要發(fā)生在免疫力低下的患者。常見的危險(xiǎn)因素有長期住院尤其為長期入住ICU、多器官損害、中心靜脈或動(dòng)脈置管的使用、導(dǎo)尿管的使用、輔助通氣、血液透析、急癥腹部手術(shù)、腸道定植、胃造口術(shù)或空腸造口術(shù)管的使用和先前使用過任何抗菌藥物等[1]。隨著鮑曼不動(dòng)桿菌感染患者的增多,抗菌藥物的應(yīng)用進(jìn)一步導(dǎo)致了多重耐藥甚至泛耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌的出現(xiàn)。細(xì)菌對抗菌藥物的耐藥主要是由于耐藥基因表達(dá)的各類水解酶。目前用于治療鮑曼不動(dòng)桿菌的主要抗菌藥物有5類,包括頭孢菌素類(頭孢他啶和頭孢吡肟等),碳青霉烯類(亞胺培南和美羅培南),酶抑制劑復(fù)方(哌拉西林-他唑巴坦),氟喹諾酮類(環(huán)丙沙星和左氧氟沙星)和氨基糖苷類(慶大霉素和阿米卡星)。多重耐藥甚至泛耐藥菌株的出現(xiàn)提示了菌株耐藥機(jī)制的多樣性。諸多文獻(xiàn)報(bào)道了鮑曼不動(dòng)桿菌的不同耐藥機(jī)制。外排泵基因的表達(dá)在多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌中發(fā)揮重要的作用[4]。外排泵的5類超家族在鮑曼不動(dòng)桿菌中最流行的是能夠外排很多抗菌藥物的RND泵的過表達(dá),主要是AdeABC基因的過表達(dá)[4],鮑曼不動(dòng)桿菌Ade C能泵出的藥物包括β內(nèi)酰胺類、氨基糖苷類、紅霉素、氯霉素、四環(huán)素類、氟喹諾酮類、甲氧芐啶和溴乙啶[5]。插入序列ISAbal的發(fā)現(xiàn)使碳青霉烯類、頭孢菌素類等耐藥基因高表達(dá)而導(dǎo)致鮑曼不動(dòng)桿菌耐藥[3,6]。
氨基糖苷類抗生素對不發(fā)酵糖革蘭陰性桿菌、腸桿菌科及一些革蘭陽性球菌均有很好的抗菌活性,與β內(nèi)酰胺類抗生素聯(lián)用有協(xié)同抗菌作用,在感染治療中占有重要地位。氨基糖苷類抗生素是通過抑制蛋白與16S rRNA合成和破壞細(xì)菌細(xì)胞膜的完整性的氨基環(huán)多醇?xì)⑺兰?xì)菌[7],其中主要耐藥機(jī)制是產(chǎn)生氨基糖苷類修飾酶[8-9]。氨基糖苷類修飾酶主要包括3類作用機(jī)制各不相同的酶:乙酰轉(zhuǎn)移酶修飾依賴于乙酰輔酶A的N-乙?;?,磷酸轉(zhuǎn)移酶修飾依賴于ATP的O-磷酸化,核苷酸轉(zhuǎn)移酶修飾依賴于ATP的腺苷化,降低了它們對核糖體亞單位的親和力[8,10]。氨基糖苷類修飾酶經(jīng)常在流動(dòng)元素中編碼,如質(zhì)粒、轉(zhuǎn)座子和整合子,它們大都隱藏在不分類的額外的耐藥決定簇如ESBLs和MBLs中[8,10]。在鮑曼不動(dòng)桿菌中,所有主要的氨基糖苷類修飾酶都有報(bào)道,用I類整合子編碼氨基糖苷類修飾酶的基因的存在在多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌中非常流行[11-12]。最近的研究報(bào)道了鮑曼不動(dòng)桿菌中質(zhì)粒介導(dǎo)的16S rRNA甲基化作用,這種機(jī)制可以使鮑曼不動(dòng)桿菌對所有的氨基糖苷類抗生素耐藥[13]。氨基糖苷類抗生素通過作用于細(xì)菌核糖體30S亞基的16S rRNA高度保守的A位點(diǎn),干擾細(xì)菌蛋白質(zhì)的合成,從而引起細(xì)菌死亡,而質(zhì)粒介導(dǎo)的16S rRNA甲基化酶能夠保護(hù)細(xì)菌的30S核糖體的16S rRNA不與氨基糖苷類藥物結(jié)合,造成對氨基糖苷類藥物的高水平耐藥。
多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌醫(yī)院感染患者常有基礎(chǔ)疾病,或曾接受廣譜抗生素治療。本研究36株多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌大部分來自ICU,其次有呼吸內(nèi)科、老年科等。藥敏試驗(yàn)結(jié)果反映了本組多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌的耐藥情況相當(dāng)嚴(yán)重,對亞胺培南、頭孢吡肟、頭孢他啶和頭孢曲松的耐藥率均在94.0%以上,對頭孢哌酮-舒巴坦的耐藥率相對較低(16.7%),可能是因?yàn)轭^孢哌酮和舒巴坦聯(lián)合使用,舒巴坦抑制了β內(nèi)酰胺酶對頭孢哌酮的破壞,增強(qiáng)頭孢哌酮的抗菌活性,而對慶大霉素的高耐藥率與氨基糖苷類耐藥基因有關(guān)[1]。armA為16S rRNA甲基化酶,有報(bào)道表明鮑曼不動(dòng)桿菌的雙圈耐藥現(xiàn)象與armA基因誘導(dǎo)型表達(dá)有關(guān)[14]。氨基糖苷類耐藥基因在安徽合肥、浙江寧波、上海、山東泰安、天津、湖南岳陽、江西南昌等很多地區(qū)的鮑曼不動(dòng)桿菌中廣泛存在[14-20],與鮑曼不動(dòng)桿菌對氨基糖苷類酶的耐藥關(guān)系密切。本研究在一定程度上反映了鎮(zhèn)江地區(qū)鮑曼不動(dòng)桿菌的耐藥情況比較嚴(yán)重,多重耐藥甚至泛耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌的出現(xiàn)提示該菌將是感染治療中的重點(diǎn)和難點(diǎn)。因此,合理使用抗菌藥物是控制耐藥菌醫(yī)院感染的重要手段,也是目前醫(yī)院感染研究的重要課題。
[1] 李朋玲,蔡培泉,糜祖煌.鮑曼不動(dòng)桿菌β-內(nèi)酰胺類抗生素耐藥機(jī)制研究近展[J].中華臨床感染病雜志,2012,5(4):247-252.
[2] Hu WS,Yao SM,F(xiàn)ung CP,et al.An OXA-66/OXA-51-Like carbapenemase and possibly an effux pump are associated with resistance to imipenem in Acinetobacter baumannii[J].Antimicrob Agents Chemother,2007,51(11):3844-3852.
[3] Corvec S,Poirel L,Naas T,et al.Genetics and expression of the carbapenem-h(huán)ydrolyzing oxacillinase gene blaOXA-23 in Acinetobacter baumannii[J].Antimicrob Agents Chemother,2007,51(4):1530-1533.
[4] Coyne S,Courvalin P,Périchon B.Efflux-mediated antibiotic resistance in Acinetobacter spp[J].Antimicrob Agents Chemother,2011,55(3):947-953.
[5] Ruzin A,Keeney D,Bradford PA.AdeABC multidrug effux pump is associated with decreased susceptibility to tigecycline in Acinetobacter calcoaceticus-Acinetobacter banmannii complex[J].J Antimicrob Chemother,2007,59(5):1001-1004.
[6] Héritier C,Poirel L,Nordmann P.Cephalosporinase overexpression resulting from insertion of ISAba1in Acinetobacter baumannii[J].Clin Microbiol Infect Dis,2006,12(2):123-130.
[7] Shakil S,Khan R,Zarrilli R,et al.Aminoglycosides versus bacteria-a description of the action,resistance mechanism,and nosocomial battleground[J].J Biomed Sci,2008,15(1):5-14.
[8] Poole K.Aminoglycoside resistance in Pseudomonas aeruginosa [J].Antimicrob Agents Chemother,2005,49(2):479-487.
[9] Mingeot-Leclercq MP,Glupczynski Y,Tulkens PM.Aminoglycosides:activity and resistance[J].Antimicrob Agents Chemother,1999,43(4):727-737.
[10] Strateva T,Yordanov D.Pseudomonas aeruginosa-aphenomenon of bacterial resistance[J].J Med Microbiol,2009,58(Pt 9):1133-1148.
[11] Peleg AY,Seifert H,Paterson DL.Acinetobacter baumannii:emergence of a successful pathogen[J].Clin Microbiol Rev,2008,21(3):538-582.
[12] Nemec A,Dolzani L,Brisse S,et al.Diversity of aminoglycoside-resistance genes and their association with class 1 integrons among strains of pan-European Acinetobacter baumannii cloes[J].J Med Microbiol,2004,53(Pt 12):1233-1240.
[13] Doi Y,Adams JM,Yamane K,et al.Identical of 16S rRNA methylase-producing Acinetobacter baumannii clinical strains in North America[J].Antimicrob Agents Chemother,2007,51(11):4209-4210.
[14] 汪鵬程,蔡俊,閆敏,等.鮑曼不動(dòng)桿菌對氨基糖苷類藥物耐藥及其攜帶基因的探討[J].國際檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)雜志,2012,33(10):1155-1156.
[15] 陳琳,蔡挺,張順,等.鮑曼不動(dòng)桿菌氨基糖苷類修飾酶和I類整合酶基因研究[J].中國抗生素雜志,2008,33(1):34-40.
[16] 奚俊,應(yīng)春妹.耐氨基糖苷類抗生素鮑曼不動(dòng)桿菌中armA和rmtB甲基化酶基因的檢測[J].中國感染與化療雜志,2010,10(3):209-212.
[17] 姜梅杰,馮莉,張福森.多重耐藥鮑曼不動(dòng)桿菌中氨基糖苷類修飾酶基因及qacEΔl基因的研究[J].中華臨床醫(yī)師雜志,2012,6(11):3062-3064.
[18] 卓啟芳,葛庚芝,畢玲,等.對下呼吸道感染鮑曼不動(dòng)桿菌氨基糖苷類耐藥基因檢測[J].天津醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào),2012,18(3):385-391.
[19] 易敏,姜習(xí)新.鮑曼不動(dòng)桿菌16S rRNA甲基化酶基因和氨基糖苷類修飾酶基因檢測及作用研究[J].實(shí)用預(yù)防醫(yī)學(xué),2012,19(4):605-607.
[20] 劉曉慶,陳嬌,李華,等.鮑曼不動(dòng)桿菌質(zhì)粒上氨基糖苷類耐藥基因的研究[J].中國抗生素雜志,2012,37(5):335-356.