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      弱陽離子磁珠聯(lián)合MALDI-TOFMS技術檢測腎盂尿路上皮癌血清差異蛋白

      2013-03-22 05:58:00董德鑫李漢忠石冰冰張玉石徐維鋒
      基礎醫(yī)學與臨床 2013年11期
      關鍵詞:診斷模型磁珠腎盂

      董德鑫,李漢忠,石冰冰,張玉石,徐維鋒

      (中國醫(yī)學科學院北京協(xié)和醫(yī)院泌尿外科,北京100730)

      腎盂尿路上皮癌術前診斷困難,需要與腎盂里的凝血塊和息肉等進行鑒別,而尿找瘤細胞等確診陽性率較低[1]。本研究利用基質輔助激光解吸附電離飛行時間質譜技術(matrix assisted laser desorption ionization time of flightmass spectrometry,MALDI-TOFMS)比較腎盂尿路上皮癌組和對照組的血清樣本,尋找對于腎盂尿路上皮癌具有鑒別意義的血清差異蛋白峰,彌補尿找瘤細胞陽性率不高的缺點,提高腎盂尿路上皮癌的術前診斷率。

      1 材料與方法

      1.1 研究對象:腎盂尿路上皮癌組:2010年12月至2011年4月期間,于北京協(xié)和醫(yī)院泌尿外科病房采集腎盂癌患者術前血清樣本共計16例,其中男性10例,女性6例,年齡范圍54~79歲,平均70.3歲。所有患者均行腹腔鏡腎盂癌根治術,術后病理確診為腎盂尿路上皮癌。對照組:采集非腎盂癌對照組術前標本共計11例,均為男性,年齡范圍34~77歲,平均52.5歲。術后病理確診為腎囊腫4例,腎結石4例,良性前列腺增生3例。

      1.2 標本收集:清晨空腹狀態(tài)抽取肘靜脈血3~5 mL,置入真空無抗凝劑BD采血管,2 000 r/min,離心10 min后吸取上層血清,分裝入艾本德管后置于-80℃低溫冰箱凍存。

      1.3 實驗步驟:200μL樣品管加入10μL磁珠結合緩沖液、10μL磁珠和5μL血清吸打混勻,分離后加入100μL磁珠清洗緩沖液,重復上述步驟兩次,加入5μL磁珠洗脫緩沖液,分離后將上清液移入新的0.5μL樣品管,加入5μL磁珠穩(wěn)定緩沖液并吸打混勻。

      取1μL標準品與10μL基質混合,后取1μL混合液點在Anchorchip靶標準品位置。采用美國AutoflexTMMALDITOF-MS質譜儀,不同結晶點,多點采集,累加5~10個結晶點數(shù)據。取磁珠處理后的樣品,同標準品點樣方法,結果分子量偏差小于100 ppm。

      1.4 結果判定:根據整體波形特點,剔除不合格圖譜,并對低分子量區(qū)間波峰分子量進行校正。采集分子質量區(qū)間范圍為1~10 ku,選擇標準品進行分子質量校正。利用Clin-ProTools2.2軟件對質譜圖的數(shù)據進行分析,篩選血清差異蛋白峰,建立腎盂尿路上皮癌的診斷模型。

      2 結果

      2.1 腎盂尿路上皮癌與對照組之間血清差異蛋白峰篩選:質譜儀采集分子質量區(qū)間1~10 ku范圍內全部可識別蛋白峰127個,凝膠模擬示意圖(圖1),具有顯著差異的蛋白峰6個,分子質量分別為 4074.14、145.15、7475.45、1546.94、2547.55和4592.11(P<0.05)。

      2.2 遺傳算法建立腎盂尿路上皮癌診斷模型:利用ClinPro-Tools2.2軟件通過遺傳算法優(yōu)化選擇,篩選出符合條件的14個差異蛋白峰建立診斷模型(表1),交叉驗證后識別能力為100%。

      圖1 兩組樣本血清差異蛋白峰凝膠模擬示意圖Fig 1 Gel simulation diagram of differential protein peaks of two samp les of serum

      表1 篩選出符合條件的14個差異蛋白峰建立診斷模型Table 1 The diagnosismodel is established by 14 differentially expressed proteins

      3 討論

      腎盂尿路上皮癌是發(fā)生在腎盂或腎盞上皮的惡性腫瘤,約占所有腎腫瘤的10%左右。本病大多數(shù)為尿路上皮癌,尿路上皮癌可在任何被覆有移行上皮的尿路部位先后或同時出現(xiàn)?;颊甙l(fā)病年齡多在40歲以上,男女比例約為3∶1,左右發(fā)病無明顯差異,雙側發(fā)病者約2% ~4%[2]。

      約70%~90%的腎盂移行細胞癌患者早期臨床表現(xiàn)的重要癥狀為無痛性肉眼血尿,少數(shù)病人因腫瘤或凝血塊阻塞腎盂輸尿管而引起腰部不適、隱痛及脹痛。腎盂癌術前診斷困難,尤其與腎盂里的息肉、血塊等良性病變鑒別診斷困難,而尿找瘤細胞等檢查陽性率偏低。腎盂占位的術前診斷不同,采取的手術方式截然不同。

      MALDI-TOFMS技術是在新近發(fā)展起來的蛋白質組學新技術,采集的差異蛋白峰分子質量范圍在1~10 Da,結果中許多在統(tǒng)計學上顯著差異的蛋白質分子質量在5000 Da以下,MALDI-TOFMS技術在尋找小分子量差異蛋白上的優(yōu)勢明顯[3]。遺傳算法是近些年發(fā)展起來的一種全局優(yōu)化算法,借用了生物遺傳學的觀點,通過自然選擇、遺傳及變異等作用機制,實現(xiàn)個體的適應性提高。本研究利用ClinPro-Tools2.2軟件對質譜圖的數(shù)據進行分析,就是利用遺傳算法進行組合優(yōu)化,篩選多個差異蛋白峰,建立腎盂尿路上皮癌的診斷模型。該診斷模型敏感性和特異性較高。

      本研究是應用蛋白組學對腎盂尿路上皮癌的初步研究,應用蛋白組學技術篩選差異蛋白峰,并建立腎盂尿路上皮癌的診斷模型具有較高的敏感性和特異性,可以彌補尿找瘤細胞陽性率不高的缺陷,有利于腎盂尿路上皮癌的早期診治。

      [1]Giebel R,Worden C,Rust SM,et al.Microbial fingerprinting using matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flightmass spectrometry(MALDI-TOF MS)applications and challenges[J].Adv Appl Microbiol,2010,71:149-184.

      [2]Raman JD,Scherr DS.Management of patients with upper urinary tract transitional cell carcinoma[J].Nat Clin Pract Urol,2007,4:432 -443.

      [3]Wong MY,Yu KO,Poon TC,etal.Amagnetic bead-based serum proteomic fingerprintingmethod for parallel analytical analysis andmicropreparative purification[J].Electrophoresis,2010,31:1721-1730.

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