李彥杰,肖國生,劉仁華,楊俊年
(1.重慶三峽學院生命科學與工程學院,重慶 404000;
2.三峽庫區(qū)可持續(xù)發(fā)展研究中心,重慶 404000)
重組人基質(zhì)金屬蛋白酶2(MMP-2)血紅素樣蛋白表達優(yōu)化
李彥杰1,2,肖國生1,劉仁華1,楊俊年1
(1.重慶三峽學院生命科學與工程學院,重慶 404000;
2.三峽庫區(qū)可持續(xù)發(fā)展研究中心,重慶 404000)
為確定重組大腸桿菌(BL21(DE3)/PET42a-PEX)最佳表達條件。在單因素實驗的基礎之上,以目的蛋白PEX表達量為響應值,應用Box-Behnken中心組合設計建立數(shù)學模型,進行響應面分析。響應面分析確定的最優(yōu)因素水平組合為:LB培養(yǎng)基pH為7.50,誘導時菌液OD600為0.60,IPTG誘導濃度為0.60mmol/L,誘導培養(yǎng)時間為5.0h。對此工藝條件進行驗證得到目的蛋白PEX表達量為20.98mg/L。結(jié)果顯示,優(yōu)化了基因重組大腸桿菌表達人PEX的條件,為實現(xiàn)基因重組原核工程菌發(fā)酵法制備重組PEX奠定了基礎。
大腸桿菌,基質(zhì)金屬蛋白酶2,血紅素樣蛋白,Box-Behnken設計
基質(zhì)金屬蛋白酶(matrixmetalloproteinase,MMPs)是一組Zn2+依賴性內(nèi)源性蛋白水解酶超家族,在降解包括骨在內(nèi)的全身各種組織細胞外基質(zhì)(extracellular matrix,ECM)過程中扮演著重要角色[1-3]。MMP-2是該家族的重要一員,主要由成纖維細胞、角質(zhì)形成細胞、內(nèi)皮細胞、軟骨細胞、成骨細胞和單核細胞等多種細胞分泌合成[3-5]。MMP-2參與降解IV型膠原蛋白,I型膠原蛋白和細胞外糖蛋白,在腫瘤侵襲轉(zhuǎn)移中起關(guān)鍵作用[3,6]。基質(zhì)金屬蛋白酶(MMPs)血紅素樣蛋白(matrixmetalloproteinase 2 hemopexin-like C-terminal domain,PEX)是除MMP-7、MMP-23和MMP-26外所有MMPs在羧基端共有的結(jié)構(gòu)域,體內(nèi)提取的PEX是MMPs的內(nèi)源性抑制劑[7-10]。研究發(fā)現(xiàn)MMP-2-PEX能抑制MMP-2對ECM的降解、血管的形成、細胞的遷移和增殖[11-15]。提取人神經(jīng)膠質(zhì)瘤U87細胞總RNA,RTPCR克隆人基質(zhì)金屬蛋白酶2(MMP-2)血紅素樣蛋白的cDNA序列PEX,構(gòu)建原核表達載體PET42a-PEX,轉(zhuǎn)化大腸桿菌BL21(DE3),異丙基-β-D-硫代半乳糖苷(isopropylβ-D-1-thiogalactopyranoside,IPTG)誘導后顯示目的蛋白為可溶性表達[16]。本文采用Box-Behnken設計(Box-Behnken design,BBD)的響應面法(response surface methodology,RSM)優(yōu)化重組人PEX的可溶性表達條件,為實現(xiàn)基因重組原核工程菌發(fā)酵法制備重組PEX奠定基礎。
1.1 材料與儀器
重組大腸桿菌(BL21(DE3)/PET42a-PEX) 本實驗室保存。
M ini-proteantetra小型垂直電泳槽 美國Bio-rad公司;GelDoc XR凝膠成像儀 配有Quantity One分析軟件,美國Bio-rad公司;5418型高速冷凍離心機 德國Eppendorf公司;S20K型pH計 瑞士Mettler-Toledo公司;Biophotometer Plus生物分光光度計 德國Eppendorf公司。
1.2 實驗方法
1.2.1 種子培養(yǎng) 重組大腸桿菌(BL21(DE3)/PET42a-PEX)涂布到含有100mg/L AMP的LB平板上倒置過夜,挑取鑒定正確的單克隆接種到100m L含100mg/L AMP的LB液體培養(yǎng)基中,37℃和220r/m in振蕩培養(yǎng)過夜,然后按5‰接入500m L含100mg/L AMP的LB液體培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng),分別收集OD600值為0.20、0.40、0.60、0.80和1.00的菌液10m L備用。
1.2.2 單因素實驗設計 以目的蛋白PEX表達量為評價指標,研究不同LB培養(yǎng)基pH、誘導時菌液OD600值、IPTG誘導濃度和誘導培養(yǎng)時間對目的蛋白表達量的影響。
1.2.3 目的蛋白表達量分析 裂解單因素誘導表達后細菌培養(yǎng)物,10000r/m in離心10m in,取上清液進行SDS-PAGE,Bio-Rad Gel Doc XR凝膠成像儀掃描電泳膠,用Quantity One 4.4.0軟件分析計算目的蛋白表達量。
1.2.4 響應面的組合實驗 根據(jù)單因素的實驗結(jié)果,利用Design-Expert 8.0軟件進行BBD實驗設計,優(yōu)化PEX可溶性表達工藝。根據(jù)單因素分析結(jié)果,以LB培養(yǎng)基pH(X1),誘導時菌液OD600(X2),IPTG誘導濃度(X3)和誘導培養(yǎng)時間(X4)進行4因素3水平Box-Behnken實驗設計。以-1、0、1代表自變量水平,實驗因素及水平編碼如表1所示。
表1 實驗因素和水平編碼表Table 1 Coding of levels and factors chosen for the trials
2.1 目的蛋白表達的單因素分析
圖1 LB培養(yǎng)基pH對PEX表達的影響Fig.1 Effectof pH in LB on expression of PEX
2.1.1 LB培養(yǎng)基pH對目的蛋白表達的影響 固定誘導時菌液OD600為0.40,IPTG濃度為0.40mmol/L,誘導時間3.0h,LB培養(yǎng)基pH分別設定為6.00、6.50、 7.00、7.50、8.00,結(jié)果見圖1。由圖1可知,隨著pH由6.00增高至7.00,目的蛋白表達量逐步上升,并在pH在7.00達到最大值,這是因為大腸桿菌在發(fā)酵中產(chǎn)酸會使培養(yǎng)基pH下降,而培養(yǎng)基pH下降后會抑制大腸桿菌的生長繁殖。當pH大于7.50,目的蛋白表達量開始下降。故選擇LB培養(yǎng)基pH為7.0。
2.1.2 誘導時菌液OD600對目的蛋白表達的影響 固定誘導時LB培養(yǎng)基pH為7.00,IPTG濃度為0.40mmol/L,誘導時間3.0h,誘導時菌液OD600值分別設定為0.20、0.40、0.60、0.80、1.00,結(jié)果見圖2。由圖2可知,OD600為0.20時,目的蛋白表達量很低,這是因為此時培養(yǎng)液中重組工程菌絕對數(shù)量較小所致。隨著OD600上升,目的蛋白表達量逐步上升,并在OD600為0.60時表達量最高。OD600大于0.60,目的蛋白表達量下降,這可能與因為菌液OD600過大時,菌液中活菌數(shù)絕對數(shù)量下降有關(guān)。故選擇誘導時菌液OD600為0.60。
圖2 菌液OD600對PEX表達的影響Fig.2 Effectof bacterial liquid OD600 on expression of PEX
2.1.3 IPTG誘導濃度對目的蛋白表達的影響 固定誘導時LB培養(yǎng)基pH為7.00,OD600為0.60,誘導時間3.0h,IPTG誘導濃度分別設定為0.20、0.40、0.60、0.80、1.00mmol/L,結(jié)果見圖3。由圖3可知,隨著IPTG誘導濃度由0.20mmol/L增高至0.60mmol/L,目的蛋白表達量逐步增加至最高。IPTG誘導濃度由0.60mmol/L增高至0.80mmol/L,目的蛋白表達量緩慢降低。這可能是因為高濃度IPTG的細胞毒性作用抑制了宿主菌的生長繁殖。故IPTG誘導濃度選擇0.60mmol/L。
圖3 IPTG誘導濃度對PEX表達的影響Fig.3 Effect of induce concentration of IPTG on expression of PEX
2.1.4 誘導培養(yǎng)時間對目的蛋白表達的影響 固定固定誘導時LB培養(yǎng)基pH為7.00,OD600為0.60,IPTG誘導濃度為0.60,誘導培養(yǎng)時間分別設定為2.0、3.0、4.0、5.0、6.0h,結(jié)果見圖4。由圖4可知,誘導培養(yǎng)2.0、3.0h時,目的蛋白表達量較低。誘導培養(yǎng)4.0h時,目的蛋白表達量最高,隨著誘導培養(yǎng)時間增加,目的蛋白表達量緩慢降低。故選擇誘導培養(yǎng)時間為4.0h。
圖4 誘導培養(yǎng)時間對PEX表達的影響Fig.4 Effectof induce time on expression of PEX
2.2 響應面的實驗設計與結(jié)果分析
2.2.1 實驗設計方案與結(jié)果分析 實驗設計方案及結(jié)果見表2。
表2 Box-Behnken實驗設計方案及結(jié)果Table 2 Design of Box-Behnken experiment
利用Design-Expert 8.0軟件對表2中的實驗數(shù)據(jù)進行回歸分析,擬合回歸模型為二次方程:Y=18.81+ 4.86X1+0.14X2+0.34X3+3.20X4+0.17X1X2+0.34X1X3+ 2.13X1X4-0.91X2X3+0.087X2X4-0.27X3X4-6.82X12-0.77X22-0.94X32-2.77X42?;貧w模型顯著性檢驗結(jié)果見表3。
由表3可知,回歸模型極顯著(p<0.01)。模型及一次項X1、X4,二次項X12、X42和交互項X1X4極顯著(p< 0.01),模型中其余項均不顯著(p>0.05),表明各因素對目的蛋白的表達量不是簡單的線性關(guān)系。計算擬合模型的判定系數(shù)R2=0.9763,校正判定系數(shù)RAdj2= 0.9527,預測判定系數(shù)RPred2=0.8720,且失擬項不顯著(p>0.05),表明模型擬合程度比較好,可以用此模型對目的蛋白PEX表達量進行分析、預測和確定最佳表達工藝條件。
表3 回歸模型顯著性檢驗Table 3 Test for significance of regressionmodel
2.2.2 回歸模型的驗證實驗 利用Design-Expert 8.0數(shù)據(jù)分析軟件,由模型的二次方程計算得4個因素最優(yōu)值為:LB培養(yǎng)基pH為7.48,誘導時菌液OD600為0.63,IPTG誘導濃度為0.62mmol/L,誘導培養(yǎng)時間為4.8h。在此組合下響應值Y在實驗區(qū)域內(nèi)可達最優(yōu)點,即重組人PEX表達量最大,理論值為21.21mg/L。為驗證上述優(yōu)化結(jié)果,按照確定的最優(yōu)條件,實際取LB培養(yǎng)基pH為7.50,誘導時菌液OD600為0.60,IPTG誘導濃度為0.60mmol/L,誘導培養(yǎng)時間為5.0h進行發(fā)酵表達,重復實驗3次,重組人PEX的實測平均值為20.98mg/L,與模型的預測值較為接近,進一步說明此回歸模型的擬合程度較好。
外源基因在大腸桿菌表達系統(tǒng)中的高效表達,除受表達系統(tǒng)的啟動子、終止子、核糖體結(jié)合位點和密碼子偏愛性等影響之外,還受如培養(yǎng)溫度、培養(yǎng)基pH、IPTG誘導濃度、誘導表達時間、誘導時菌液OD600值和培養(yǎng)基營養(yǎng)成分等外界環(huán)境因素的影響。因此選擇合適的誘導培養(yǎng)條件,可有效提高目的基因的表達量,從而降低實驗成本,提高表達效率。
響應面分析通過研究實驗指標與多個實驗因素間的回歸關(guān)系建立回歸方程,然后求解最優(yōu)值。響應面實驗設計分析要求實驗因素已在最優(yōu)值范圍附近,因此本研究首先通過單因素實驗選定了參與響應面實驗的LB培養(yǎng)基pH、誘導時菌液OD600、IPTG誘導濃度和誘導培養(yǎng)時間4個因素,并設立不同水平,然后應用響應面分析法建立了目的蛋白表達量的二次多項數(shù)學模型,并通過手動優(yōu)化模型。通過對優(yōu)化后模型方程求解,得到最佳的工藝條件是:LB培養(yǎng)基pH為7.50,誘導時菌液OD600為0.60,IPTG誘導濃度為0.60mmol/L,誘導培養(yǎng)時間為5.0h。此條件下目的蛋白表達量為20.98mg/L。驗證實驗PEX表達量接近最大預測值,顯示擬合模型對于基因重組原核工程菌發(fā)酵法制備重組PEX具有實踐意義。
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Optim ization of expression conditions of recombinant human-source matrix metalloproteinase 2 hemopexin-like C-term inal domain
LIYan-Jie1,2,XIAO Guo-sheng1,LIU Ren-hua1,YANG Jun-nian1
(1.College of Life Science and Engineering,Chongqing Three Gorges University,Chongqing 404000,China;
2.Research Centre for Sustainable Development,Three Gorges Reservoir Region,Chongqing 404000,China)
To op tim ize fermentation cond itions of Genetically Engineered Escherichia coli(BL21(DE3)/PET42a-PEX),Box-Behnken design was used to estab lish mathematical model based on sing le-factor tests.The response surface methodology(RSM)analysis result showed that the op timal scale of fac tors was:Luria-Bertani liquid culture medium pH7.50,bac terial liquid op tical density(OD600)0.60,induce concentration of IPTG 0.60mmol/L,induce time 5.0h.Under these op tim ized cond itions,the yield of PEX was 20.98mg/L.Op tim ization of exp ression cond itions of genetically engineered Escherichia coli exp ressing recombinant human-source matrixmetallop roteinase 2 hemopexin-like C-term inaldomain was studied,and laid the foundation of generation of human recombinant PEX by fermentation.
Escherichia coli;matrixmetallop roteinase 2;hemopexin-like C-term inaldomain;Box-Behnken design
Q815
A
1002-0306(2012)20-0248-04
2012-04-28
李彥杰(1979-),男,碩士,講師,研究方向:生物技術(shù)。
教育部科學技術(shù)研究重點項目(211150);重慶三峽學院項目(2008-sxxyqn-31)。