郭雷靜,李鑫,張淑芹,陸思靜#(.遼寧醫(yī)學院,遼寧錦州00;.遼寧醫(yī)學院附屬第一醫(yī)院,遼寧錦州 00)
不動桿菌是常見的革蘭陰性桿菌之一,為重要的條件致病菌。近年來不動桿菌臨床標本分離率和耐藥率逐漸升高,其中最受關(guān)注的是鮑曼不動桿菌。2009年CHINET[1]數(shù)據(jù)顯示,鮑曼不動桿菌對β-內(nèi)酰胺類抗生素特別是頭孢菌素類耐藥率均超過50%,分離率占革蘭陰性桿菌第4位;而北京協(xié)和醫(yī)院[2]鮑曼不動桿菌則超過銅綠假單胞菌上升到第2位,僅次于大腸埃希菌,對頭孢菌素類耐藥率均超過70%。我院2010年共檢測出鮑曼不動桿菌62株,其中多重耐藥鮑曼不動桿菌(MDRAB)為38株,占61.29%。目前國內(nèi)、外多項研究表明,產(chǎn)超廣譜β-內(nèi)酰胺酶(ESBLs)機制是細菌對頭孢菌素類抗生素耐藥最重要的原因之一。為了解我院MDRAB攜帶耐藥基因狀況,筆者對38株MDRAB進行了超廣譜酶基因檢測,為探討細菌耐藥機制及指導(dǎo)臨床合理應(yīng)用抗生素提供理論依據(jù)。
2010年遼寧醫(yī)學院附屬第一醫(yī)院住院患者臨床標本不動桿菌共62株,篩選出MDRAB共38株,剔除同一患者相同部位重復(fù)分離株。38株MDRAB中,痰液17份,導(dǎo)管痰10份,分泌物3份,胸水、尿液及膿液各2份,血液、腦脊液各1份。
MicroScan WalkAway 40全自動微生物鑒定系統(tǒng)及其配套的鑒定藥敏復(fù)合板(美國Dade公司生產(chǎn));100 bp ladder DNA marker、瓊脂糖純化試劑盒、dNTP及Taq DNA聚合酶均為大連TaKaRa公司產(chǎn)品;多重聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)引物由北京奧科鼎盛生物科技有限公司生產(chǎn);DNA Thermal Cycler 2400為美國Perkin Elmer公司產(chǎn)品。
采用微量稀釋法測定細菌對抗菌藥物的敏感性,根據(jù)美國臨床實驗室標準化協(xié)會(CLSI)2007年版要求進行抗生素敏感性判斷,用WHONET 5.4軟件分析結(jié)果。抗菌藥物品種分別為頭孢吡肟(FEP)、頭孢曲松(CRO)、頭孢噻肟(CTX)、頭孢他啶(CAZ)、氨芐西林/舒巴坦(SAM)、哌拉西林(PIP)、替卡西林/克拉維酸(TCC)、復(fù)方磺胺甲唑(SXT)、環(huán)丙沙星(CIP)、左氧氟沙星(LVX)、亞胺培南(IPM)、慶大霉素(GEN)、妥布霉素(TOB)、阿米卡星(KAN)。標準質(zhì)控菌株為銅綠假單胞菌ATCC 27853,大腸埃希菌ATCC 25922。
從LB培養(yǎng)基上挑取單個受試菌落加入5 mL LB培養(yǎng)液中,37 ℃、200 r·min-1震蕩孵育16~20 h。取1.5 mL菌液12 000 r·min-1離心5 min,棄去上清,加入80 μL蒸餾水混勻,95 ℃加熱10 min后12 000 r·min-1離心5 min,取上清2 μL作ESBLs基因檢測的模板。
引物序列出處及反應(yīng)條件見表1。
表1 PCR引物序列和產(chǎn)物長度Tab 1 Sequence of PCR primer and the length of products
PCR擴增體系均為25 μL,每個體系中包含:(1)10×loading buffer 2.5 μL;(2)20μmol·L-1的引物各 0.5 μL;(3)1.25 U的 TaqDNA 聚合酶;(4)模板 2 μL;(5)濃度為 10 μmol·L-1dNTP各 0.5 μL,最后加滅菌去離子水至25 μL。
在紫外燈下觀察擴增PCR產(chǎn)物在2%瓊脂糖凝膠電泳中的分析結(jié)果,出現(xiàn)明亮目的條帶者為陽性。陽性條帶行切膠純化后送北京奧科鼎盛生物科技有限公司測序,登陸GenBank用Blast程序分析、比對。
MDRAB在重癥監(jiān)護室(ICU)檢出率最高,其次為呼吸科和神經(jīng)外科,感染部位以呼吸道和手術(shù)切口為最高,分別為67.5%和17.5%。該菌在不同科室的分布見表2。
表2 38株MDRAB分布株數(shù)和百分率Tab 2 Number and percentage of 38 strains of multidrug resistantA.baumannii
圖1 TEM基因PCR結(jié)果電泳圖M.100 bp ladder DNAmarker;N.陰性對照;1~6.WSW01~06Fig 1 Electrophoretogram of PCR product of TEMM.100 bp ladder DNAmarker;N.negative control;1~6.WSW01~06
圖2 PER-1基因和SHV基因PCR電泳圖M.100 bp ladder DNAmarker;1.WSW30;2~6.WSW32,35~38Fig 2 Electrophoretogram of PCR product of PER-1 and SHVM.100 bp ladder DNAmarker;1.WSW30;2~6.WSW32,35~38
38株MDRAB對14種抗生素的耐藥結(jié)果及超廣譜酶基因檢測結(jié)果見表3。
38株MDRAB中TEM基因陽性33株(86.84%,圖1為部分結(jié)果),PER-1基因陽性5株(13.16%)、SHV基因陽性1株(2.63%)(見圖2)。其中,5株TEM、PER-1基因均陽性,占13.16%;1株TEM、SHV基因均陽性,占2.63%。取TEM、PER-1和SHV基因所有陽性產(chǎn)物純化并送北京奧科鼎盛生物科技有限公司測序,結(jié)果和GenBank上報道的已知序列相比對,證實為TEM、PER-1和SHV,同源性均為99%。
我院分離的38株MDRAB占所有不動桿菌(62株)的61.29%,高于2009年[1]CHINET細菌檢測數(shù)據(jù)的44%。我院的ICU為綜合ICU,同時收住呼吸、神經(jīng)外科和骨創(chuàng)外科等危重癥病人,好轉(zhuǎn)后再轉(zhuǎn)到相應(yīng)科室,加上包括呼吸機在內(nèi)的有創(chuàng)性治療措施的廣泛應(yīng)用,此為MDRAB的傳播和流行提供了很好的機會。因此,加強醫(yī)院管理,積極有效地控制鮑曼不動桿菌感染和傳播是極其重要的。
本研究顯示,38株菌全部符合多重耐藥不動桿菌(對以下3種或3種以上抗生素耐藥:頭孢菌素類、碳青霉烯類、含β-內(nèi)酰胺酶抑制劑的復(fù)合制劑、氟喹諾酮類及氨基糖苷類抗生素)標準。由表3可見,對阿米卡星敏感率為15.79%(6株),耐藥率為84.21%(32株);對妥布霉素敏感率為13.16%(5株),耐藥率86.84%(33株);對頭孢他啶、替卡西林/克拉維酸耐藥率均為92.11%(35株),僅7.89%(3株)對頭孢他啶敏感,但對替卡西林/克拉維酸為中介(7.89%),無敏感菌株。對其余9種抗生素包括頭孢吡肟、頭孢曲松、頭孢噻肟耐藥率均為100%,無敏感菌株。其中的30株菌對14種抗生素全部耐藥,導(dǎo)致幾乎無藥可選。而且相對敏感的氨基糖苷類抗生素因副作用及短期內(nèi)極易產(chǎn)生耐藥性限制了其在臨床的長期、廣泛應(yīng)用。對于感染MDRAB的患者,其治療費用及死亡率勢必增加,預(yù)后極差。
本研究中38株MDRAB中33株均產(chǎn)生TEM型β-內(nèi)酰胺酶。近年來國內(nèi)在鮑曼不動桿菌中已經(jīng)檢測到了TEM、CTX、SHV、PER-1、VEB、GES等基因,但仍以TEM和PER-1檢出率最高。TEM是革蘭陰性桿菌中最常見耐藥基因,可使細菌對青霉素和第3、4代頭孢菌素以及單環(huán)類抗生素耐藥,但對頭霉素及碳青霉烯類抗生素敏感。PER-1在鮑曼不動桿菌中檢出的報道日益增多,其既可為質(zhì)粒編碼又可為染色體編碼,在上游存在插入序列ISPa12,此序列可能與提高其表達有關(guān)[6]。PER-1可以水解廣譜頭孢菌素、頭孢哌酮/舒巴坦及氨芐西林/舒巴坦,但不水解或較弱水解亞胺培南和美羅培南。此外,PER-1還可以導(dǎo)致對氨基糖苷類抗生素的耐藥,如慶大霉素及阿米卡星,因此也更有力地表明了多重耐藥的存在。國外也有大量PER-1的報道,特別是在韓國、土耳其非常流行,也見于法國、比利時和玻利維亞[7,8]。國內(nèi)也有多家醫(yī)院報道了PER-1基因的存在;PER-2在阿根廷、美國也有報道。本研究中發(fā)現(xiàn)了1株攜帶SHV基因的耐藥菌株,在我國北京、廣州、福州等[9]地區(qū)也發(fā)現(xiàn)了SHV的鮑曼不動桿菌。雖然SHV基因不是我院的鮑曼不動桿菌多重耐藥最主要的原因,但也要引起警惕。發(fā)現(xiàn)5株同時攜帶TEM和PER-1基因,1株同時攜帶TEM和SHV,應(yīng)密切觀察和監(jiān)控這樣的危險菌株,防止其在院內(nèi)暴發(fā)和流行。
本研究中有5株MDRAB的PCR擴增產(chǎn)物均為陰性,一方面是由于未對所有的耐藥基因進行檢測;另一方面細菌耐藥機制除產(chǎn)超廣譜酶基因酶以外,還同時存在著產(chǎn)其他β-內(nèi)酰胺酶如Ampc酶、青霉素結(jié)合蛋白親和力下降、外膜孔蛋白(OprD)缺失及主動外排泵等其他的耐藥機制。目前認為,整合子不僅可以介導(dǎo)細菌耐藥性聚集導(dǎo)致多重耐藥產(chǎn)生,而且可以在不同遺傳物質(zhì)和菌株間轉(zhuǎn)移,這些將有待于進一步研究。
表3 38株MDRAB藥物耐藥性及超廣譜酶基因檢測結(jié)果Tab 3 Drug resistance and extented-specturm β-lactamase genes of 38 strains of multidrug resistantA.baumannii
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