一種新的DNA序列進化距離的修正方法
2012-04-29 00:44:03邢林林郭茂祖王娟
智能計算機與應用 2012年4期
邢林林 郭茂祖 王娟
摘要： 進化樹是推演生命歷史的一個重要工具。在構建進化樹的所有算法中，基于進化距離的算法是其中研究的重點。但是，這一方法較為嚴重地依賴著距離矩陣的質量。人們開發(fā)了多種基于生物事實的進化模型來改進距離矩陣的構建過程，很大程度上提高了進化距離的準確性。同時，也提出了許多方法來檢測距離矩陣的質量。文中提出了基于模型的距離以及p距離，采用一種組合的新距離的方式來構建距離矩陣。同時采用直接檢測距離矩陣的統(tǒng)計學計分方法以及構建進化樹，對比實驗結果表明文中的方法實用且有效。
關鍵詞：
中圖分類號：TP391文獻標識碼：A文章編號：2095-2163（2012）04-0035-06
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