整合素αvβ3基因單核苷酸多態(tài)性與漢坦病毒感染

陳小平 侯 煒＊

病毒學國家重點實驗室，武漢大學基礎醫(yī)學院醫(yī)學病毒研究所，武漢430071；＊通訊作者

目的：腎綜合癥出血熱（HFRS）是由漢坦病毒（HV）引起的，以發(fā)熱、低血壓休克、出血及腎功能損害為臨床特征的自然疫源性疾病。我國是高發(fā)地區(qū)。單核苷酸多態(tài)性（SNP）是人類基因組中最常見的基因多態(tài)性，是繼RFLP、STR之后的第3代遺傳學標記?，F(xiàn)已證實β3整合素是致病性HV的主要受體。整合素是由α和β亞單位通過非共價鍵組成的異二聚體，其中由β3亞基組成的有αVβ3和αIIbβ3兩種。本研究通過對整合素αVβ3基因ITGAV、ITGB3候選SNP位點的基因分型，探討整合素αVβ3基因SNP與HV感染的關(guān)系；同時研究雙向等位基因特異性PCR（BI-PASA PCR）技術(shù)在單核苷酸突變富集區(qū)域（序列長度小于一個TaqMan基因分型探針的長度）的SNP位點基因分型上的應用。方法：利用TaqManSNP探針實時定量PCR和BI-PASA PCR技術(shù)對候選的SNP位點進行基因分型，分析目的基因SNP等位基因在HFRS各癥狀組及健康人群中的頻率分布差異，通過比較不同臨床類型候選SNP等位基因、基因型頻率分布差異，確定與HV感染及HFRS臨床類型有關(guān)的位點及基因型。結(jié)果：TaqMan探針實時定量PCR和BI-PASA PCR對rs5918和rs3768777、rs3738919、rs5921、rs13306487位點進行了基因分型，通過測序驗證基因分型的結(jié)果準確可靠，其中rs13306487位點的上下游附近序列（長度小于一個TaqMan基因分型探針）均存在其它SNP位點。候選的SNP位點（rs3768777、rs3738919、rs5921、rs13306487、rs5918）等位基因在 HFRS各癥狀組及健康人群中的頻率分布無差異（P均＞0.05）。結(jié)論：整合素αVβ3基因ITGAV、ITGB3的SNP位點rs3768777、rs3738919、rs5921、rs13306487、rs5918SNP與 HV感染無相關(guān)性。