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一株犬細(xì)小病毒的分離及VP2基因序列分析
楊龍峰①李英杰①艾萍萍①肖勝南①韓 柳②焦萬(wàn)亮①王建芬①?gòu)堁庸猗賱⒃聼á?(①北京市延慶縣農(nóng)業(yè)局 102100 ②北京誠(chéng)安動(dòng)物醫(yī)院 ③北京市農(nóng)林科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所)
采集病犬的糞便,經(jīng)處理后接種狗腎傳代細(xì)胞系(MDCK),培養(yǎng)96h無(wú)任何細(xì)胞病變,盲傳到第3代時(shí)細(xì)胞系出現(xiàn)明顯的細(xì)胞脫落,核圓縮,形成CPE (cytopathic effect)。繼續(xù)傳代到第7代。第1、2代的細(xì)胞培養(yǎng)物不能凝集豬的紅細(xì)胞,第3代以后的細(xì)胞培養(yǎng)物可以凝集豬的紅細(xì)胞。采用PCR技術(shù),在各代次的培養(yǎng)物中均能擴(kuò)增得到特異性的DNA片斷,經(jīng)序列測(cè)定后鑒定為犬細(xì)小病毒,定名為BJY06。為進(jìn)一步研究該分離株的遺傳演化情況,擴(kuò)增得到了VP2基因的全序列。經(jīng)序列測(cè)定,用DANStar軟件分析表明BJY06毒株為CPV-2a亞型,所得到的VP2基因全長(zhǎng)1755bp,含有完整的閱讀框架,編碼584個(gè)氨基酸。與其它亞型的毒株相比較核苷酸的同源性為98.3%~99.6%。氨基酸同源性為97.1%~100%。
犬細(xì)小病毒 病毒分離 鑒定 PCR VP2 序列分析
1978年,犬細(xì)小病毒(canine parvovirus,CPV)同時(shí)從加拿大(Thomson等)、澳大利亞(Kelly)患腸炎的病犬中分離獲得[1]。CPV可引起犬的出血性腸胃炎和心肌炎,并使白細(xì)胞大量減少,在幼犬中的發(fā)病率和死亡率都很高,癥狀與貓泛白細(xì)胞減少癥相似。本病雖出現(xiàn)的時(shí)間不長(zhǎng),但目前已擴(kuò)散到世界各地,幾乎所有養(yǎng)犬的地方都有本病的存在[2]。1982年10月,我國(guó)報(bào)道在暴發(fā)傳染性出血性腹瀉的病犬的糞便提取物中發(fā)現(xiàn)細(xì)小病毒,隨后,在我國(guó)各地陸續(xù)有本病發(fā)生的報(bào)道。
本試驗(yàn)從臨床發(fā)病犬的糞便中分離到一株犬細(xì)小病毒,定名為BJY2006。對(duì)其VP2基因進(jìn)行了擴(kuò)增測(cè)序,初步確定為2a亞型。對(duì)該病毒的遺傳特性與演化進(jìn)行了研究,以期為更好地為預(yù)防和控制犬細(xì)小病毒病提供資料。同時(shí)為大范圍的對(duì)CPV進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查提供可行的方法。
病料采自于北京市某動(dòng)物醫(yī)院的病犬。狗腎傳代細(xì)胞(MDCK)購(gòu)于中國(guó)獸醫(yī)藥品監(jiān)察所。D-MEM營(yíng)養(yǎng)液、UNIQ-10柱式病毒DNA抽提試劑盒、EZ-10 Spin Column DNA Gel Extration Kit 等購(gòu)買于上海生物工程有限公司。犬細(xì)小病毒快速診斷試紙條購(gòu)買于軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院實(shí)驗(yàn)動(dòng)物中心。參考GeneBank中的已發(fā)表的CPV的VP2核酸序列,使用primer5.0軟件設(shè)計(jì)了兩對(duì)引物,由上海生物工程有限公司合成。
主要儀器 PCR儀(PTC-200)、CO2培養(yǎng)箱(SANYO)、高速冷凍離心機(jī)(SIGMA)。
1.2.1 病毒分離培養(yǎng) 將病犬糞便用PBS緩沖液10倍稀釋,再加1/5量的氯仿混和均勻,靜置2min后4000rpm,離心10min,取上清,經(jīng)0.22μm的微孔濾膜過濾,收取濾液-30℃保存。生長(zhǎng)成單層的MDCK細(xì)胞消化,傳代,37℃培養(yǎng)6h后,觀察細(xì)胞貼壁完全,再加入1/20量的病料濾液,37℃繼續(xù)培養(yǎng),每天2次觀察細(xì)胞病變。96h進(jìn)行傳代培養(yǎng),共傳7代。每代細(xì)胞培養(yǎng)96h收獲,反復(fù)凍融3次,3000rpm,離心10min,收取上清-30℃保存。
1.2.2 HA試驗(yàn)和金標(biāo)試紙條檢測(cè) 取病料濾液、各代次的細(xì)胞培養(yǎng)物根據(jù)文獻(xiàn)介紹的方法做HA試驗(yàn)[3]。根據(jù)金標(biāo)試紙條使用說明書檢測(cè)并記錄結(jié)果。
1.2.3 病毒DNA的提取 根據(jù)UNIQ-10柱式病毒DNA抽提試劑盒說明書進(jìn)行操作。
1.2.4 PCR擴(kuò)增 反應(yīng)體系為50μL,同時(shí)設(shè)立陰性、陽(yáng)性對(duì)照。退火溫度為55℃進(jìn)行PCR反應(yīng),1.0%瓊脂糖凝膠電泳,在顯像儀中觀察結(jié)果并拍照。
1.2.5 DNA的純化 按照EZ-10 Spin Column DNA Gel Extration Kit 試劑盒的說明書進(jìn)行,純化的DNA送大連寶生物工程公司進(jìn)行測(cè)序。
(1)接種病料的MDCK細(xì)胞在傳到第3代時(shí)出現(xiàn)明顯的細(xì)胞病變,病變發(fā)生在接種后50h,表現(xiàn)為細(xì)胞圓縮、顆粒增多,胞核濃縮,脫落,拉網(wǎng),病變逐日嚴(yán)重。對(duì)照細(xì)胞生長(zhǎng)正常,表明細(xì)胞系中有病毒生長(zhǎng)。
(2)糞便濾液、各代次培養(yǎng)物的HA、試驗(yàn)結(jié)果及PCR擴(kuò)增結(jié)果如表1。
表1 不同方法檢測(cè)CPV的結(jié)果
(3)PCR擴(kuò)增及序列測(cè)定結(jié)果:使用引物F2,R2擴(kuò)增到了小于500bp的DNA片斷(圖1),與預(yù)期的大小相符。經(jīng)純化后進(jìn)行序列測(cè)定,堿基數(shù)為426bp,與GeneBank中的已發(fā)表序列比對(duì)同源性為100%。表明分離得到了犬細(xì)小病毒毒株。使用引物F1、R1擴(kuò)增到了2000bp左右大小的DNA片段與預(yù)期大小相符(圖2)。
圖1 CPV特異性PCR結(jié)果
M.DNA Marker DGL2000; 1.BJY06 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物(426bp) 2.CPV疫苗株的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物(426bp)。3.陰性對(duì)照。
圖2 CPV VP2基因PCR結(jié)果
M. DNA Marker DGL2000; 1.BJY06 PCR擴(kuò)增產(chǎn)物(1955bp) 2. CPV疫苗株P(guān)CR陽(yáng)對(duì)照(1955bp)。3.陰性對(duì)照。
表2 犬細(xì)小病毒VP2核酸和氨基酸變異位點(diǎn)比較
(4)序列測(cè)定結(jié)果:用引物F1、R2擴(kuò)增的產(chǎn)物長(zhǎng)度為1955個(gè)核苷酸,包含完整的VP2全基因,由1755個(gè)核苷酸組成,編碼584個(gè)氨基酸。發(fā)生有意義突變的核苷酸及相應(yīng)的氨基酸(表2)進(jìn)行比較分析,BJY06分離株為CPV-2a亞型。
從本試驗(yàn)結(jié)果可以看出,同HA、金標(biāo)試紙條檢測(cè)方法相比較,PCR方法能檢出更少量的CPV,即PCR方法更敏感,特異性更強(qiáng)。HA方法并不能準(zhǔn)確檢出CPV,HA陽(yáng)性只能非特異地表明有病毒生長(zhǎng),靈敏度也不高,而且觀察結(jié)果也帶有較大主觀性;金標(biāo)試紙條方法特異性比HA方法好,但靈敏度也不高,只有在病毒含量達(dá)到一定濃度時(shí),有效反應(yīng)才能發(fā)生。相比較認(rèn)為PCR方法可作為MDCK細(xì)胞中病毒繁殖的一種特異、敏感的檢測(cè)方法。
本試驗(yàn)把PCR檢測(cè)技術(shù)與病毒分離培養(yǎng)技術(shù)相結(jié)合,成功的對(duì)犬細(xì)小病毒進(jìn)行了分離。PCR檢測(cè)方法的高敏感性可以檢測(cè)到在MDCK中生長(zhǎng)的微量病毒,能夠在MDCK細(xì)胞未發(fā)生明顯病變前檢測(cè)出CPV的存在,從而提高CPV分離的成功率。同時(shí)隨著寵物疾病診斷條件的提高,PCR診斷方法在臨床工作中的應(yīng)用也將逐漸成為現(xiàn)實(shí)。
2005年邱薇等[4]對(duì)我國(guó)不同地區(qū)分離到的9株細(xì)小病毒毒株進(jìn)行了VP2基因的擴(kuò)增和序列分析,并與CPV的參考毒株進(jìn)行了比較,依據(jù)圖3所示的氨基酸的變化規(guī)律,進(jìn)行了亞型鑒定,9株CPV中有6株屬CPV-2a,3株屬CPV-2b,未檢測(cè)到CPV-2c變異株,表明我國(guó)目前仍以CPV-2a流行為主。本次試驗(yàn)分離到的毒株經(jīng)序列比對(duì)也是CPV-2a亞型。該分型方法與使用單克隆抗體進(jìn)行犬細(xì)小病毒亞型鑒定相比具有經(jīng)濟(jì)、方便的特點(diǎn),國(guó)內(nèi)外的研究者已逐漸認(rèn)可并使用該分型方法。為今后進(jìn)行大范圍的CPV的流行病學(xué)調(diào)查提供了依據(jù)。
BJY06毒株的VP2基因序列進(jìn)行遺傳演化分析(圖3)表明,BJY06與另2個(gè)中國(guó)分離株B-2004和CH-GN同在一個(gè)分支內(nèi),但親緣關(guān)系最近的是日本株FPV-31、臺(tái)灣株T37和中國(guó)株B-2004。中國(guó)2005年毒株CPV-GN雖然與BJY06仍有較近的進(jìn)化關(guān)系,但為CPV-2b亞型。BJY06與其它亞型的毒株相比較核苷酸的同源性為98.3%~99.6%。與FPV~377的氨基酸同源性最低,為97.1%,與V129、V120、T4、T37、Taiwan 9的同源性最高,為100%。
圖3 .VP2基因遺傳進(jìn)化樹DC, domestic cat; DD, domestic dog; MK, mink; BF, blue fox. JPN, Japan; TWN, Tai wan; CHN, China; VTN, Vietnam; FNL, Finland.
與其它的CPV-2a亞型毒株相比較,在遺傳進(jìn)化關(guān)系上與日本毒株sho-nan在同一個(gè)分支內(nèi),與V154的距離最遠(yuǎn)。核苷酸同源性在99.3%~99.6%。BJY06與CPV-31的氨基酸同源性最低為99.7%,與V129、V120、T4、T37、Taiwan 9的氨基酸同源性均為100%。表明在該亞型內(nèi)的氨基酸變異很小,幾乎是沒有變化。在297和555位氨基酸美國(guó)株CPV-31為S(絲氨酸)和I(亮氨酸)而BJY06和其它的中國(guó)、日本毒株為A(丙氨酸)和V(纈氨酸)。這兩個(gè)位點(diǎn)的不同究竟有何意義需要進(jìn)一步研究。
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S852.65+5
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1007-1733(2011)01-0006-03
(2010–10–27)