李 黎 莫曉燕* 陳雪玉
實驗研究
混合5’-核苷酸的分離與檢測
李 黎 莫曉燕* 陳雪玉
以核酸酶P1酶解RNA產(chǎn)物為材料,對離子交換樹脂分離混合5’-核苷酸的工藝條件進行研究,并通過建立的RP-HPLC檢測方法鑒定單核苷酸分離效果。結(jié)果表明,陽離子交換樹脂NH-1可使4種單核苷酸有效分離,洗脫順序依次為UMP→GMP→CMP→AMP;最佳分離條件為:色譜柱徑高比=1∶20,RNA酶解液上樣濃度20g/L,吸附時間8h,洗脫流速0.5mL/min。確定RP-HPLC C18反相柱的色譜條件為:流動相KH2PO4-甲醇,在30mmol/L KH2PO4(pH 5.5)以及0.5mL/min流速條件下,按照KH2PO4∶甲醇=100∶0→97∶3,15min,97∶3→95∶5,1min進行梯度洗脫。通過外標(biāo)法對混合單核苷酸的分離效果進行檢測,證明增加吸附時間是改善分離效果的重要因素。
5’-核苷酸;陽離子交換樹脂;反相高效液相色譜;分離和檢測
核苷酸及其衍生物是醫(yī)藥、食品、農(nóng)業(yè)和科研領(lǐng)域重要的生化試劑和原料,與國外相比,國內(nèi)核苷酸工業(yè)發(fā)展緩慢,尤其是混合核苷酸的分離純化工藝大多處于分離率差、純化效率低的狀況[1-3]。本文采用陽離子交換樹脂對核酸酶P1酶解RNA的核苷酸混合液進行分離純化研究[4-6],并且探討4種單核苷酸的RP-HPLC檢測方法。
1.1 材料和試劑
核苷酸混合液(核酸酶P1酶解RNA產(chǎn)物,自制);NH-1陽離子交換樹脂(西安藍深生物科技有限公司);AMP、CMP、GMP、UMP標(biāo)準品(美國Sigma公司);甲醇(色譜純,天津市科密歐化學(xué)試劑有限公司);其余試劑均為分析純。
1.2 主要儀器
DU-640紫外可見分光光度計(美國BECKMAN儀器有限公司);125-168高效液相色譜儀(美國BECKMAN儀器有限公司);BS-100A自動部分收集器(上海精科實業(yè)有限公司);HL-2恒流泵(上海嘉鵬科技有限公司)。
1.3 實驗方法
1.3.1 樹脂的選擇與處理
根據(jù)待分離核苷酸的電荷特性,選擇強酸性苯乙烯系陽離子交換樹脂NH-1作為分離介質(zhì),該樹脂具有上柱量大、分離度高的特點,適合于工業(yè)化生產(chǎn)[7-9]。
稱取適量NH-1陽離子交換樹脂,蒸餾水浸泡2h除去雜質(zhì)顆粒;加四倍樹脂量的1mol/L NaOH溶液浸泡4h,蒸餾水水洗至中性;以四倍樹脂量的1mol/L HCl浸泡4h,蒸餾水水洗至中性;再用pH 1.5的HCl浸泡樹脂,使樹脂轉(zhuǎn)為氫型后置冰箱保存待用。
1.3.2 混合單核苷酸的分離純化及鑒定
以核酸酶P1酶解酵母RNA獲得的核苷酸混合液上樣,NH-1強酸型陽離子交換樹脂吸附,蠕動泵控制流速,蒸餾水洗脫,使用部分收集器收集洗脫液,每管10~14mL。將收集的洗脫液依次測定254nm吸收值(A254nm)并繪制洗脫曲線。分別考查了上樣液濃度、洗脫液流速以及樹脂吸附時間與單核苷酸洗脫曲線的關(guān)系。
1.3.2.1 上樣液濃度
分別采用5g/L和10g/L的RNA酶解液上樣,色譜柱徑高比為1∶15,在洗脫流速1mL/min的條件下繪制洗脫曲線。
1.3.2.2 洗脫液流速
以20g/L 的RNA酶解液上樣,色譜柱徑高比為1∶20,分別在洗脫流速0.5和1mL/min的條件下繪制洗脫曲線。
1.3.2.3 樹脂吸附時間
以20g/L的RNA酶解液上樣分別吸附0、3和8h,色譜柱徑高比為1∶20,在洗脫流速05mL/min的條件下繪制洗脫曲線。
1.3.2.4 單核苷酸的鑒定
取0.7mL洗脫液溶于1mL KH2PO4-NaOH緩沖液(pH 7.0)中,混勻后測定其在220~300nm波長范圍內(nèi)的紫外吸收值,根據(jù)4種核苷酸的紫外吸收光譜特性(表1)鑒定單核苷酸種類。
表1 4種單核苷酸的紫外吸收光譜特性
1.3.3 混合單核苷酸的RP-HPLC檢測
反相色譜是迄今在高效液相色譜中應(yīng)用最廣泛的技術(shù),主要是因為它適用于分析絕大多數(shù)的非極性物質(zhì)和很多可離子化的化合物[10-12]。本文通過優(yōu)化色譜條件建立反相高效液相色譜檢測核苷酸的方法,并運用外標(biāo)法對混合5’-單核苷酸的分離效果進行檢測。
首先對色譜條件進行優(yōu)化選擇,采用單一標(biāo)準核苷酸分別進樣,流動相為pH 5.5的KH2PO4與甲醇(95∶5),進樣濃度為0.1mg/L,檢測波長為260nm。
1.3.3.1 鹽濃度
分別在流速1和0.5mL/min的條件下,考查了10~30mmol/L KH2PO4溶液濃度對4種標(biāo)準核苷酸保留時間的影響。
1.3.3.2 流速
在流動相為10mmol/L KH2PO4條件下,改變流速(1、0.8、0.5、0.3mL/min),檢測4種標(biāo)準核苷酸的保留時間。
1.3.3.3 pH
在30mmol/L KH2PO4溶液、流速0.5mL/min條件下,改變KH2PO4溶液的pH(4.5、5.5、6.5),檢測4種標(biāo)準核苷酸的保留時間。
1.3.3.4 梯度洗脫
在30mmol/L KH2PO4溶液、流速0.5mL/min條件下,分別采用KH2PO4∶甲醇=100∶0→95∶5,10min;KH2PO4∶甲醇=100∶0→95∶5,20min;KH2PO4∶甲醇=100∶0→97∶3,15min,97∶3→95∶5,1min不同條件梯度洗脫,考查4種標(biāo)準核苷酸保留時間。
在選擇的最佳色譜條件下,以0.1、0.2、0.3、0.4、0.5mg/L不同濃度的4種標(biāo)準核苷酸混合液分別進樣,根據(jù)峰面積和濃度制作標(biāo)準曲線。將前述陽離子交換樹脂分離的4種單核苷酸樣品進行RP-HPLC檢測,根據(jù)峰面積和標(biāo)準曲線分別計算4種核苷酸的濃度。
2.1 混合單核苷酸的分離條件
2.1.1 上樣液濃度對洗脫曲線的影響
不同濃度酶解液上樣洗脫曲線如圖1。由實驗結(jié)果可知,NH-1強酸型陽離子交換樹脂可將混合核苷酸分離得到4種單核苷酸,但是5g/L上樣液時第4個峰峰值偏??;增加濃度至10g/L后4個峰均明顯,第4個峰值有所提高。對于一定量的樹脂而言,條件相同的情況下,可吸附核苷酸的質(zhì)量是一定的,所以在一定范圍內(nèi)增加上柱液濃度,有利于更多的樣品被吸附,提高分離效率。
2.1.2 流速對洗脫曲線的影響
圖1 不同上樣液濃度對混合核苷酸分離的影響
不同流速的洗脫曲線如圖2。由實驗結(jié)果可知,洗脫流速為1mL/min時,4個峰可以基本分離,但是峰值小,并且雜峰較大;降低流速至0.5mL/min后,各個峰值增加明顯,雜峰明顯減小。在交換層析時,為了保證有效交換,兩相需要有充分的接觸時間,若接觸時間短則有可能導(dǎo)致吸附不完全,出現(xiàn)洗脫液重疊交叉,不能完全分開的問題,所以適當(dāng)降低流速有利于增加兩相的接觸時間,提高吸附效果從而改善分離效率。
圖2 不同流速對混合核苷酸分離的影響
2.1.3 吸附時間對洗脫曲線的影響
相同條件下改變吸附時間的結(jié)果見圖3。從混合核苷酸洗脫曲線可知,隨著吸附時間延長,核苷酸的分離效果有所提高,吸附8h洗脫曲線中4個峰的分離效果明顯好于吸附3h和吸附0h。兩相的有效吸附是分離的重要條件之一,增加吸附時間,是保證兩相充分吸附的最直接簡便的方法,可以有效改善分離效果。
2.2 單核苷酸的定性鑒定
圖3 不同吸附時間對混合核苷酸分離的影響
采用分光光度法檢測單核苷酸的種類,結(jié)果見表2。將得出的數(shù)值與表1進行對比,鑒定出4種核苷酸的洗脫順序為UMP、GMP、CMP、AMP,此洗脫順序符合分離原理,進一步證實本研究的分離條件和分離方法有效。
表2 4種單核苷酸定性鑒定結(jié)果
2.3 混合單核苷酸RP-HPLC的色譜條件
2.3.1 鹽濃度對分離效果的影響
不同流速條件下改變 KH2PO4溶液濃度,檢測各標(biāo)準核苷酸的保留時間,結(jié)果見表3??梢钥闯?,相同流速條件下,隨著流動相鹽濃度的提高,4種樣品保留時間不同程度延長,分離度有所提高;而同一鹽濃度時,降低流速效果更佳。例如流速為0.5mL/min時,當(dāng)KH2PO4溶液從20mmol/L 增加到30mmol/L,CMP和UMP的分離度由0.45上升至0.52,因此選定30mmol/L KH2PO4溶液為最佳鹽濃度。
表3 不同鹽濃度的單核苷酸保留時間(min)
2.3.2 流速對分離效果的影響
不同流速對各標(biāo)準核苷酸保留時間的影響結(jié)果見表4。結(jié)果顯示,隨著流速減小,單核苷酸的分離度逐漸增加,保留時間也隨之延長。當(dāng)流速為0.3mL/min時,CMP和UMP的分離度為0.31;而流速為0.5mL/min時,4種核苷酸保留時間基本分開,CMP和UMP的分離度為0.29。綜合鹽濃度考察結(jié)果,確定0.5mL/min為流動相的最佳流速。
表4 不同流速的單核苷酸保留時間(min)
2.3.3 pH對分離效果的影響
不同KH2PO4溶液pH條件下,檢測的各標(biāo)準核苷酸保留時間結(jié)果見表5。由結(jié)果可知,流動相的pH變化對單核苷的保留時間有不同程度的影響。當(dāng)KH2PO4溶液的pH為4.5時,4種核苷酸的保留時間非常接近,幾乎無法分開,分析原因是由于核苷酸隨流動相pH降低,其有機酸的解離性質(zhì)被抑制;pH升高至5.5時,隨著核苷酸的解離,各單核苷酸的保留時間有所增加,4種核苷酸基本分開;但是pH至6.5時,4種核苷酸的分離程度下降,CMP和UMP的分離度(0.41)<pH 5.5的分離度(0.52)。因此,選擇pH為5.5為KH2PO4溶液的最佳色譜條件。
表5 不同pH的單核苷酸保留時間(min)
2.3.4 梯度洗脫對分離效果的影響
分析單一標(biāo)準核苷酸的檢測結(jié)果可知,AMP分離效果較好,CMP、UMP和GMP可基本分離但是效果不理想,特別是CMP和UMP保留時間較近,在核苷酸混合液走樣時有重疊的可能。因此,進一步探索不同梯度洗脫條件對各標(biāo)準核苷酸保留時間的影響,結(jié)果見表6。KH2PO4溶液與甲醇比例從100∶0降至95∶5的梯度洗脫,4種核苷酸保留時間有所延長,GMP可以分開,但CMP與UMP保留時間仍較為接近。采用15min內(nèi)KH2PO4溶液與甲醇比例從100∶0降至97∶3,再于1min內(nèi)將二者比值降至95∶5,避免AMP保留時間過長,此時CMP與UMP分離效果較好。
表6 不同梯度洗脫條件的單核苷酸保留時間(min)
最終獲得的RP-HPLC色譜條件為:流動相30mmol/L KH2PO4(pH 5.5)-甲醇,流速0.5mL/min,梯度洗脫條件KH2PO4∶甲醇=100∶0→97∶3,15min,97∶3→95∶5,1min,檢測波長:260nm?;旌蠁魏塑账釞z測結(jié)果如圖4,在此條件下4種核苷酸可以有效分離。
圖4 混合單核苷酸RP-HPLC圖譜
2.4 標(biāo)準曲線及核苷酸的定量測定
在選擇的最佳色譜條件下制作標(biāo)準曲線見圖5,不同吸附時間條件下分離的4種核苷酸測定結(jié)果如圖6和圖7。由實驗結(jié)果可知,增加吸附時間,分離得到的單核苷酸濃度有不同程度的增加,進一步說明,兩相的有效吸附是分離的重要因素,增加吸附時間是保證兩相充分吸附的最直接有效方法。
采用NH-1陽離子交換樹脂分離核酸酶P1酶解RNA產(chǎn)物,最佳分離條件為:RNA酶解液上樣濃度20g/L,色譜柱徑高比1∶20,吸附8h,洗脫流速0.5mL/min,可將混合核苷酸有效分離,分光光度法檢測鑒定單核苷酸的洗脫順序依次為UMP、GMP、CMP、AMP。
圖6 樣品單核苷酸RP-HPLC圖譜
圖7 不同吸附時間混合核苷酸的分離結(jié)果
建立了反相高效液相色譜檢測核苷酸的方法,得到的最佳色譜條件為:流動相KH2PO4-甲醇,在30mmol/L KH2PO4(pH 5.5)以及0.5mL/min流速條件下,按照KH2PO4∶甲醇=100∶0→97∶3,15min,97∶3→95∶5,1min進行梯度洗脫。通過外標(biāo)法對混合單核苷酸的分離效果進行檢測,證明增加吸附時間是改善分離效果的重要因素。
[1] 廖紅東,莫曉燕.核酸酶P1研究進展[J].藥物生物技術(shù),2004,11(3):190-193.
[2] 錢敏,李關(guān)榮,魯成.核糖核酸研究進展[J].蠶業(yè)科學(xué),2004,30(2):185-190.
[3] 張志軍,溫明浩,王克文,等.核苷酸生產(chǎn)技術(shù)現(xiàn)狀及展望[J].現(xiàn)代化工,2004,24(11):19-23.
[4] 徐燚.核苷酸制備工藝的研究[D].南京:南京工業(yè)大學(xué),2002.
[5] Cihlar T,Rosenberg I.Ef fi cient separation of natural ribonucleotides by low-pressure anion-exchange chromatography[J].J.Chromatog,1993,644(2): 299-305.
[6] 王光柱.5’-混合脫氧單核苷酸分離純化的工藝研究[D].杭州:浙江大學(xué),2006.
[7] 肖林平,徐正軍,何明芳,等.NH-1分離5’-核苷酸的研究[J].離子交換與吸附,2003,19(5):430-436.
[8] Halder A,Sa B.Preparation and in vitro evaluation of polystyrenecoated diltiazem-resin complex by oil-in-water emulsion solvent evaporation method[J].AAPS Pharm SciTech,2006,7(2): 105-112.
[9] Ozawa M,Koyama S,Suzuki T.Innovative separation method for advanced spent fuel reprocessing based on tertiary pyridine resin[J].Czechoslovak J Phys,2006,56(1): 579-587.
[10] 鄒耀洪.香菇中5’-核苷酸的高效液相色譜-質(zhì)譜分析[J].食品科學(xué),2005,26(1):196-198.
[11] Brockstedt U,Pfau W.Reversed-Phase High-Performance Liquid Chromatographic Separation of 32p-Labeled Nucleotlde Adducts Formed by Food-Derived Carcinogenic Aminoimidazoazarenes[J].Chromatographia,1999,50(9):547-552.
[12] Shimelis O,Giese RW.Nuclease P1 digestion/high-performance liquid chromatography,a practical method for DNA quantization [J].J Chromatography A,2006,1117(1):132-136.
Q524
B
1671-8194(2010)21-0045-04
西安交通大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院(710049)