基于Access的染色體病查詢系統(tǒng)

孫殿欽+夏翃

摘要：本文介紹了一種基于Access的染色體病查詢系統(tǒng)。該系統(tǒng)擁有瀏覽、查詢、制作報表等功能，適用于在教學(xué)科普活動中進行推廣。

關(guān)鍵詞：染色體異常；數(shù)據(jù)庫；Access

中圖分類號：G434 文獻(xiàn)標(biāo)識碼：A 論文編號：1674-2117（2018）01-0080-03

引言

染色體是細(xì)胞中遺傳物質(zhì)的主要載體。染色體的結(jié)構(gòu)或者數(shù)目一旦發(fā)生了異常，會導(dǎo)致許多基因的增加或缺失，造成癥狀復(fù)雜不一的綜合征。[1]我國出生缺陷發(fā)生率約5.6%，每年新增出生缺陷近90萬例[2]，其中大約30%與遺傳因素有關(guān)，染色體病在其中占大部分。[3]本文筆者利用Access整合染色體基因庫、染色體病、染色體畸變等信息，設(shè)計出簡單易操作的染色體病查詢系統(tǒng)，值得推廣普及。

Access數(shù)據(jù)庫簡介

Microsoft Access是當(dāng)今最優(yōu)秀的關(guān)系型數(shù)據(jù)庫管理系統(tǒng)之一，其界面友好，操作簡單，維護方便，適用于開發(fā)中小型信息管理系統(tǒng)。Access不僅可與Excel等辦公軟件進行數(shù)據(jù)共享[4]，同時可以通過ODBC（Open Database Connectivity）與其他數(shù)據(jù)庫（如Oracle、Sybase、FoxPro等）相連，從而便于數(shù)據(jù)整理、匯總和輸出。此外，Access數(shù)據(jù)庫屬于綜合性數(shù)據(jù)庫，可以處理包括圖像、視頻在內(nèi)的多種數(shù)據(jù)類型。它對使用者的計算機基礎(chǔ)要求較低，并且其轉(zhuǎn)移方便，運行環(huán)境簡單，對計算機配置要求較低，是理想的數(shù)據(jù)庫處理系統(tǒng)。

系統(tǒng)功能實現(xiàn)

1.數(shù)據(jù)來源

“人類正常染色體”表中的數(shù)據(jù)來源于美國國家生物技術(shù)信息中心（NCBI，U.S.）的公開資料；“genemap”表中的數(shù)據(jù)來源于“在線人類孟德爾遺傳數(shù)據(jù)庫”（Online Mendelian Inheritance in Man，OMIM），OMIM可供下載的.txt數(shù)據(jù)格式可以導(dǎo)入到Access數(shù)據(jù)庫中，這體現(xiàn)了Access數(shù)據(jù)庫的優(yōu)點；“畸變類型”表中的圖片來源于哈佛大學(xué)Sir William Dunn病理學(xué)院Richard Wheeler博士的公開共享資料，其余數(shù)據(jù)來源于CNKI百科條目；“常見染色體病”表中的信息來源于CNKI百科條目。

2.數(shù)據(jù)表建立

Access中的數(shù)據(jù)以數(shù)據(jù)表的形式存儲，其他幾種對象都是在表的基礎(chǔ)上進行操作，所以在Access數(shù)據(jù)庫中，數(shù)據(jù)表是數(shù)據(jù)庫的核心，是數(shù)據(jù)庫的基本結(jié)構(gòu)。本數(shù)據(jù)庫共建立四張表，分別為genemap表、常見染色體病表、人類正常染色體表以及畸變類型表。四張表的具體結(jié)構(gòu)如下頁圖1所示。

3.表間關(guān)系建立

該系統(tǒng)多用數(shù)據(jù)表間的關(guān)系如下頁圖2所示。染色體是本數(shù)據(jù)庫的核心，染色體畸變是聯(lián)系臨床病癥和生物分子結(jié)構(gòu)間的橋梁，本系統(tǒng)所涉及的關(guān)系都圍繞它們而創(chuàng)建。

4.“登錄”窗體

該系統(tǒng)在“登錄”窗體中，利用ADO接口技術(shù)實現(xiàn)對數(shù)據(jù)庫的訪問，圖3為“登錄”界面。

5.“主面板”窗體

“主面板”是系統(tǒng)的中樞，應(yīng)用宏組實現(xiàn)“主面板”窗體對各個功能界面的調(diào)用，界面友好，操作簡單（如圖4）。

6.瀏覽功能

該系統(tǒng)共設(shè)計常見染色體病瀏覽、染色體畸變類型瀏覽、人類正常染色體瀏覽三項瀏覽功能。瀏覽功能界面應(yīng)用豐富的示意圖片和詳盡的介紹文字，在不失科學(xué)性的基礎(chǔ)上增強了可讀性，將抽象的邏輯化數(shù)據(jù)形象化，不僅能實現(xiàn)數(shù)據(jù)表的基本功能，還大大降低了數(shù)據(jù)庫操作的難度。

7.查詢功能

該系統(tǒng)共設(shè)計輸入染色體畸變類型查詢所致病癥及相關(guān)信息、輸入染色體號查詢此條染色體攜帶基因的相關(guān)信息、輸入疾病名稱查詢受累染色體等相關(guān)信息三項參數(shù)查詢功能。下頁圖5為參數(shù)查詢界面，圖6為運行查詢后，X染色體上的基因查詢結(jié)果。

結(jié)語

本文利用Access建立了一個有關(guān)染色體病的小型數(shù)據(jù)庫，旨在為教師教學(xué)提供輔助工具，為大眾知識普及提供支持。雖然Access數(shù)據(jù)庫應(yīng)用廣泛，簡單易學(xué)，功能強大，但Access數(shù)據(jù)庫文件不能被編譯成可執(zhí)行文件，所占空間相對過大。另外，Access雖然可以構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)應(yīng)用，但只能支持100名左右的用戶以只讀方式訪問。在安全性方面，Access也不如Oracle等獲得ISO標(biāo)準(zhǔn)認(rèn)證的數(shù)據(jù)庫，這些都阻礙了系統(tǒng)的推廣和應(yīng)用。

染色體病多種多樣，病因和臨床表現(xiàn)十分復(fù)雜。在該系統(tǒng)的基礎(chǔ)上，加入人群流行病學(xué)調(diào)查等信息，便可生成報表，從而推測染色體結(jié)構(gòu)特點與各種畸變發(fā)生率之間的相關(guān)性，甚至可以將數(shù)據(jù)導(dǎo)入到SPSS中進行科學(xué)的統(tǒng)計學(xué)分析。我們希望Access的更多功能得以開發(fā)，及其與其他軟件的協(xié)調(diào)配合和數(shù)據(jù)庫信息的進一步完善。

參考文獻(xiàn)：

[1]Theisen A， Shaffer L G.Disorders caused by chromosome abnormalities[J].The application of clinical genetics， 2010（3）：159.

[2]中華人民共和國衛(wèi)生部.中國出生缺陷防治報告（2012）[R].2012.

[3]毛萌，朱軍.出生缺陷監(jiān)測研究現(xiàn)狀[J].中華實用兒科臨床雜志，2009，24（11）：801-803.

[4]劉陟剛.Access在Office各組件中的交叉應(yīng)用探索[J].價值工程，2014（34）：225-226.

作者簡介：孫殿欽（1996—），男，2014級預(yù)防醫(yī)學(xué)班本科生；夏翃（1974—）（通訊作者），女，計算機教研室教師，副教授。endprint